More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0171 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
630 aa  1268    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  44.55 
 
 
552 aa  451  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  43.52 
 
 
549 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  43.33 
 
 
549 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  43.18 
 
 
560 aa  442  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  42.59 
 
 
544 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  43.21 
 
 
552 aa  436  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  40.77 
 
 
553 aa  434  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  44.11 
 
 
549 aa  434  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  43.47 
 
 
552 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  42.65 
 
 
552 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  44.91 
 
 
546 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  42.96 
 
 
568 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  44.71 
 
 
546 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  40.59 
 
 
547 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  39.85 
 
 
550 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  42.38 
 
 
549 aa  415  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  41.4 
 
 
550 aa  414  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  43.46 
 
 
546 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  41.22 
 
 
548 aa  413  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  42.67 
 
 
563 aa  411  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  37.64 
 
 
518 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  39.89 
 
 
575 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  40.77 
 
 
549 aa  403  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  40.23 
 
 
562 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  40.96 
 
 
549 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  38.96 
 
 
554 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  39.7 
 
 
576 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  40.63 
 
 
549 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  38.76 
 
 
566 aa  398  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  41.87 
 
 
575 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  40.34 
 
 
513 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  41.87 
 
 
564 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  41.68 
 
 
575 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  41.68 
 
 
575 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  39.85 
 
 
548 aa  396  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  42.69 
 
 
539 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  42.18 
 
 
541 aa  392  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  40.78 
 
 
576 aa  395  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  40.22 
 
 
575 aa  395  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  44.91 
 
 
544 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  42.03 
 
 
543 aa  395  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  39.59 
 
 
570 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  42.33 
 
 
564 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  42.97 
 
 
546 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  39.85 
 
 
575 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  39.33 
 
 
576 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  42.37 
 
 
562 aa  391  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  42.08 
 
 
552 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  39.18 
 
 
575 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0312  AMP-binding domain protein  42.19 
 
 
550 aa  392  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0580  AMP-binding domain protein  40.3 
 
 
576 aa  389  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.566618  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  38.96 
 
 
571 aa  388  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  43.64 
 
 
549 aa  386  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  40.79 
 
 
579 aa  389  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  40.9 
 
 
561 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  39.77 
 
 
560 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  39.92 
 
 
576 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  39.92 
 
 
576 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  40.23 
 
 
576 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  39.37 
 
 
564 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  40.15 
 
 
576 aa  385  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  39.39 
 
 
566 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  39.92 
 
 
576 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  39.25 
 
 
571 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  40.11 
 
 
564 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  39.92 
 
 
576 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  38.56 
 
 
578 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  40.49 
 
 
565 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  39.92 
 
 
576 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  39.92 
 
 
570 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  39.92 
 
 
576 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  38.53 
 
 
566 aa  381  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  38.86 
 
 
570 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  38.24 
 
 
566 aa  381  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  38.67 
 
 
574 aa  381  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  40.8 
 
 
579 aa  381  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2357  AMP-binding domain protein  40.86 
 
 
550 aa  379  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.210215 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  40.77 
 
 
549 aa  379  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3833  AMP-binding domain protein  40.67 
 
 
601 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5134  AMP-binding domain protein  40.79 
 
 
518 aa  378  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0657606  normal  0.735688 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  36.5 
 
 
558 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  39.15 
 
 
570 aa  379  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  42.8 
 
 
547 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4355  AMP-binding domain protein  40.48 
 
 
577 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  38.62 
 
 
578 aa  375  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  38.36 
 
 
565 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1241  acyl-CoA synthetase  38.96 
 
 
572 aa  375  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  37.89 
 
 
605 aa  373  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  38.01 
 
 
574 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  39.44 
 
 
550 aa  375  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.727031  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  41.99 
 
 
551 aa  375  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  38.66 
 
 
573 aa  373  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1362  AMP-dependent synthetase and ligase  42.39 
 
 
542 aa  375  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00632075  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  40.65 
 
 
550 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  40.91 
 
 
538 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  38.79 
 
 
570 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  39.93 
 
 
577 aa  372  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3045  AMP-binding domain protein  38.79 
 
 
578 aa  372  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3764  AMP-binding domain protein  38.79 
 
 
578 aa  372  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>