More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0150 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
332 aa  679    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  49.5 
 
 
305 aa  315  7e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  44.33 
 
 
318 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  46.62 
 
 
287 aa  239  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  43.99 
 
 
318 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  43.3 
 
 
318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  41.92 
 
 
318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  38.24 
 
 
312 aa  223  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  41.01 
 
 
318 aa  209  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  41.11 
 
 
312 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  31.49 
 
 
310 aa  150  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  30.31 
 
 
438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  30.25 
 
 
318 aa  129  7.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  31.5 
 
 
314 aa  122  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  30.47 
 
 
323 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  30.98 
 
 
319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 
312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  28.79 
 
 
330 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 
321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  31.58 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  29.92 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  29.02 
 
 
300 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  31.6 
 
 
342 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  31.23 
 
 
310 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  31.63 
 
 
325 aa  112  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 
352 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  29.17 
 
 
319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  29.04 
 
 
323 aa  109  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  30.58 
 
 
321 aa  109  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  30.45 
 
 
321 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  30.12 
 
 
312 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  28.73 
 
 
310 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  30.38 
 
 
319 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  27.96 
 
 
367 aa  107  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  29.29 
 
 
319 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  29.54 
 
 
319 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  29.2 
 
 
317 aa  106  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  30.4 
 
 
342 aa  105  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  29.1 
 
 
319 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 
310 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  28.77 
 
 
320 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  28.69 
 
 
319 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  31.42 
 
 
264 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  29.54 
 
 
319 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  28.93 
 
 
335 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  28.93 
 
 
335 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 
364 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  28.99 
 
 
319 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  29.41 
 
 
318 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  29.57 
 
 
364 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  33.95 
 
 
321 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  28.47 
 
 
337 aa  102  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  28.69 
 
 
319 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  28.69 
 
 
319 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  28.69 
 
 
336 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  28.67 
 
 
349 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  34.16 
 
 
298 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  30.5 
 
 
327 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  27.96 
 
 
346 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 
332 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  28.03 
 
 
318 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  32.14 
 
 
308 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  30.17 
 
 
329 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  31.75 
 
 
302 aa  99.8  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  28.69 
 
 
339 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  27.52 
 
 
312 aa  99.8  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.3 
 
 
319 aa  99.8  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  28.93 
 
 
317 aa  99.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  28.69 
 
 
339 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  26.89 
 
 
319 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  28.94 
 
 
315 aa  99  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 
319 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  28.63 
 
 
318 aa  98.2  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 
319 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  28.63 
 
 
318 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  35.48 
 
 
307 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  28.63 
 
 
318 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  31.07 
 
 
333 aa  97.4  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  28.63 
 
 
318 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  28.63 
 
 
318 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  28.63 
 
 
318 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  28.63 
 
 
318 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  28.63 
 
 
318 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  35.48 
 
 
307 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  34 
 
 
299 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 
351 aa  96.7  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  33.19 
 
 
313 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  30.71 
 
 
304 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 
321 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  29.15 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  28.98 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  28.64 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  29.1 
 
 
315 aa  94.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 
315 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  29.24 
 
 
315 aa  94.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  28.14 
 
 
317 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  33.78 
 
 
309 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  26.73 
 
 
316 aa  90.9  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  29.86 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  27.86 
 
 
347 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>