More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0148 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
437 aa  894    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  64.46 
 
 
414 aa  560  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  64.51 
 
 
427 aa  528  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  59.76 
 
 
430 aa  509  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  58.77 
 
 
431 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  60.37 
 
 
425 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  59.04 
 
 
425 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  53.81 
 
 
453 aa  475  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  56.85 
 
 
440 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  57.94 
 
 
420 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0587  oxidoreductase molybdopterin binding protein  52.41 
 
 
456 aa  461  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.271361  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2286  molybdopterin-binding oxidoreductase  57.94 
 
 
451 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0386813  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  57.94 
 
 
445 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  57.94 
 
 
449 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3258  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  50.9 
 
 
449 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0801  oxidoreductase, molybdopterin binding  51.44 
 
 
451 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.325021  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  56.46 
 
 
409 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  55.95 
 
 
414 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  53.86 
 
 
430 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  48.33 
 
 
445 aa  427  1e-118  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  54.71 
 
 
425 aa  427  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  54.59 
 
 
429 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3134  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  50.72 
 
 
448 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0673188  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  53.38 
 
 
424 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  53.16 
 
 
406 aa  411  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  54.38 
 
 
419 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2631  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  52.49 
 
 
443 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492263  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  51.36 
 
 
418 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  54.03 
 
 
406 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3784  oxidoreductase molybdopterin binding  50.82 
 
 
457 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  51.36 
 
 
418 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  50.99 
 
 
418 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  53.76 
 
 
402 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  49.86 
 
 
437 aa  396  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  48.56 
 
 
425 aa  394  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  50.94 
 
 
423 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2438  putative sulfite oxidase molybdopterin subunit  52.36 
 
 
457 aa  395  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  51.47 
 
 
425 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  48.78 
 
 
419 aa  383  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  47.04 
 
 
431 aa  374  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  53.78 
 
 
415 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  0.0000568946 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  47.1 
 
 
428 aa  367  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  47.1 
 
 
428 aa  367  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  44.99 
 
 
431 aa  363  2e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  51.35 
 
 
414 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  50.45 
 
 
414 aa  349  5e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  50.9 
 
 
405 aa  348  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  41.13 
 
 
427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  37.67 
 
 
376 aa  169  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.04 
 
 
415 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.27 
 
 
400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  33.43 
 
 
370 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  34.08 
 
 
372 aa  150  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  33.23 
 
 
369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  31.71 
 
 
420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  32.41 
 
 
369 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  31.25 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  32.01 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  31.41 
 
 
414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  32.96 
 
 
403 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  32.72 
 
 
405 aa  133  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  32.72 
 
 
405 aa  133  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  31.6 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  31.94 
 
 
361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  36.46 
 
 
401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  32.4 
 
 
401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  31.6 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  32.25 
 
 
402 aa  131  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.71 
 
 
434 aa  130  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  32.09 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  32.09 
 
 
403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  28.75 
 
 
409 aa  127  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.45 
 
 
400 aa  126  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  32.05 
 
 
359 aa  126  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.45 
 
 
465 aa  126  7e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  30.57 
 
 
402 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  28.29 
 
 
414 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  31.78 
 
 
410 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  26.17 
 
 
410 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.63 
 
 
453 aa  120  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31 
 
 
415 aa  120  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  29.19 
 
 
451 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  31.59 
 
 
426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  30.8 
 
 
407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  28.61 
 
 
461 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  28.61 
 
 
461 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.71 
 
 
417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  31.34 
 
 
407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  30.41 
 
 
406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.22 
 
 
411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  27.94 
 
 
363 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.78 
 
 
408 aa  114  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  30.19 
 
 
866 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  29.17 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  31.91 
 
 
367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.14 
 
 
417 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  28.39 
 
 
446 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.99 
 
 
412 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  30.71 
 
 
457 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.07 
 
 
501 aa  107  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>