More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0127 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 128 aa  253  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  88.19 
 
 		 130 aa  224  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  84.92 
 
 		 128 aa  214  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  71.43 
 
 		 130 aa  184  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  69.05 
 
 		 130 aa  180  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  55.37 
 
 		 134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  48.31 
 
 		 136 aa  124  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  48.8 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  49.61 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  45.6 
 
 		 138 aa  117  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  45.69 
 
 		 136 aa  116  9e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  48.39 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  47.2 
 
 		 129 aa  113  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  45.74 
 
 		 141 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  47.2 
 
 		 140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  45.97 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  44.44 
 
 		 138 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  45.24 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  44.35 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  44.53 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  43.31 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  43.8 
 
 		 131 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  45.38 
 
 		 127 aa  103  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  43.09 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  42.62 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  43.7 
 
 		 130 aa  97.8  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  43.44 
 
 		 131 aa  97.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  41.98 
 
 		 130 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  39.2 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  42.42 
 
 		 129 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  38.71 
 
 		 131 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  43.52 
 
 		 345 aa  93.6  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  37.9 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  45.74 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  45.97 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  42.2 
 
 		 346 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  43.44 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  40.57 
 
 		 346 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  40.98 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  38.71 
 
 		 361 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  39.2 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  39.2 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  40.32 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  39.67 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  37.88 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  39.02 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  38.05 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  36.29 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  36.59 
 
 		 323 aa  73.9  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  41.8 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  38.52 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  35.2 
 
 		 354 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  44.8 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  38.54 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.61 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.93 
 
 		 388 aa  68.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  31.97 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  38.95 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  40.22 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  36 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  33.6 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  36.08 
 
 		 344 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  36.8 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  37.61 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  35.38 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  37.07 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  33.05 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.01 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  34.55 
 
 		 463 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  36.51 
 
 		 438 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  36.22 
 
 		 346 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  39.18 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  35.43 
 
 		 476 aa  60.8  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3323  Rhodanese domain protein  30.33 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  32.28 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  35.09 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  40.21 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.59 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  37.89 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  41.76 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  35.23 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2034  rhodanese domain-containing protein  36.05 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  33.94 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6069  Rhodanese domain protein  36.46 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180105  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  38.89 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  37.3 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1238  hypothetical protein  25.83 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  38.04 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  34.78 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  31.53 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  32.74 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  31.53 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  40.48 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11084  hypothetical protein  34.74 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.7245e-55  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  34.26 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>