More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0100 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0100  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 705 aa  1369    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0253265  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0098  radical SAM domain-containing protein  50.7 
 
 		 716 aa  599  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2450  radical SAM domain-containing protein  34.38 
 
 		 590 aa  250  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1423  radical SAM/B12 binding domain protein  30.86 
 
 		 715 aa  231  3e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.623089  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2019  Radical SAM domain protein  22.57 
 
 		 525 aa  159  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0788272  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2521  radical SAM domain-containing protein  30.86 
 
 		 531 aa  146  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0155875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2210  radical SAM domain-containing protein  31.17 
 
 		 565 aa  146  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2989  Radical SAM domain protein  28.81 
 
 		 500 aa  138  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3373  radical SAM domain-containing protein  27.98 
 
 		 503 aa  126  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1420  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 		 632 aa  125  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0070  Radical SAM domain protein  29.48 
 
 		 635 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0050  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 		 707 aa  120  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0213  radical SAM domain-containing protein  30.5 
 
 		 429 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25181  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1855  radical SAM family protein  30.31 
 
 		 638 aa  120  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.357803 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0245  radical SAM family protein  29.19 
 
 		 502 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000162793  hitchhiker  0.0000142762 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4370  radical SAM domain-containing protein  32.99 
 
 		 634 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0105  radical SAM domain-containing protein  29.91 
 
 		 636 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1155  radical SAM family protein  27.18 
 
 		 658 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3586  Radical SAM domain protein  24.07 
 
 		 732 aa  110  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00751133 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3504  radical SAM domain-containing protein  26.62 
 
 		 646 aa  109  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2787  Radical SAM domain protein  24.91 
 
 		 732 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.231637  normal  0.0637853 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2276  radical SAM domain-containing protein  26.46 
 
 		 642 aa  105  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.315011  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  27.51 
 
 		 472 aa  105  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1481  radical SAM family protein  26.54 
 
 		 644 aa  104  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.177835  normal  0.151823 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0089  Radical SAM domain protein  30.46 
 
 		 643 aa  104  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3553  Radical SAM domain protein  30.96 
 
 		 474 aa  103  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1777  Radical SAM domain protein  25.09 
 
 		 737 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.54513 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3570  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 658 aa  103  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370781  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0112  Fe-S oxidoreductase  27.78 
 
 		 726 aa  100  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0246  radical SAM domain-containing protein  28.53 
 
 		 647 aa  98.2  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  28.17 
 
 		 470 aa  97.8  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  27.04 
 
 		 459 aa  98.2  5e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1863  radical SAM family protein  26.45 
 
 		 486 aa  95.1  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300057  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4972  radical SAM domain-containing protein  30.16 
 
 		 738 aa  95.1  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991033  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 529 aa  91.7  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 		 472 aa  89.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  25.37 
 
 		 473 aa  87.8  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3569  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.78 
 
 		 478 aa  87.4  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.663184 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  25.47 
 
 		 723 aa  87  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.677011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2637  putative anaerobic magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester [oxidative] cyclase  30.28 
 
 		 547 aa  85.5  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.166489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2336  radical SAM family Fe-S protein  27.71 
 
 		 553 aa  84.7  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3552  Radical SAM domain protein  30.4 
 
 		 488 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0968  Radical SAM domain protein  21.55 
 
 		 630 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 		 1250 aa  84  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  25.92 
 
 		 472 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1134  putative Fe-S oxidoreductase  24.74 
 
 		 425 aa  83.2  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0512  Radical SAM domain protein  26.25 
 
 		 486 aa  82.8  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2479  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  25.57 
 
 		 484 aa  81.3  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.515921  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3370  cobalamin B12-binding  27.13 
 
 		 618 aa  80.5  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.818313  normal  0.0333946 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1302  Radical SAM domain protein  25.47 
 
 		 540 aa  79.7  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0143596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2074  radical SAM binding protein  30 
 
 		 598 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1684  radical SAM family protein  28.52 
 
 		 633 aa  79.7  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1292  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  28.38 
 
 		 474 aa  79.3  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2434  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 520 aa  79  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 		 524 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000772503  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2416  radical SAM domain-containing protein  26.64 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0875  radical SAM family Fe-S protein  28.62 
 
 		 495 aa  78.2  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1602  radical SAM family Fe-S protein  23.17 
 
 		 487 aa  77.8  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2929  radical SAM domain-containing protein  29.07 
 
 		 497 aa  77.8  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  23.47 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 451 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1038  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.85 
 
 		 479 aa  77.4  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1009  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.85 
 
 		 479 aa  77.4  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0797  Radical SAM domain protein  30.63 
 
 		 489 aa  77  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1779  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.69 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1625  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  30.12 
 
 		 558 aa  76.6  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2065  Radical SAM domain protein  24.3 
 
 		 530 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1836  radical SAM domain-containing protein  26.89 
 
 		 474 aa  76.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2089  Radical SAM domain protein  24.79 
 
 		 530 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.670556 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2120  radical SAM domain protein  25.69 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.323478  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  27.69 
 
 		 520 aa  75.5  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4901  radical SAM family protein  25.47 
 
 		 474 aa  75.5  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413487  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.17 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4964  radical SAM family protein  26.1 
 
 		 476 aa  75.5  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.576294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 502 aa  75.1  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  26.57 
 
 		 473 aa  75.1  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3401  Radical SAM domain protein  25.63 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3455  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.39 
 
 		 474 aa  74.7  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.207743  normal  0.273738 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2963  Radical SAM domain protein  23.74 
 
 		 522 aa  74.7  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3764  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.39 
 
 		 474 aa  74.7  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.427217  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1179  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.85 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.846685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3585  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  30.24 
 
 		 548 aa  73.9  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4198  radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 		 620 aa  73.9  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0577  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 		 473 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1750  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 		 473 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.499976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2796  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 		 481 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0536346  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3654  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.39 
 
 		 474 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176133  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2859  Fe-S oxidoreductase  26.2 
 
 		 473 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2852  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 		 481 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2737  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 		 481 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1767  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 		 503 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580532  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4478  radical SAM family protein  30.59 
 
 		 554 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140837  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3883  radical SAM family protein  28.12 
 
 		 577 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1626  Radical SAM domain protein  24.38 
 
 		 655 aa  73.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1975  Radical SAM domain protein  27.01 
 
 		 468 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00675749  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2281  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  31.54 
 
 		 520 aa  72.8  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1924  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  28.57 
 
 		 612 aa  72.4  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0281  magnesium-protoporphyrin IX monomethylester oxidative cyclase, 66 kDa subunit(bchE)  28.57 
 
 		 612 aa  72.4  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416035  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1014  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  27.84 
 
 		 600 aa  72.4  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.770044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0973  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.96 
 
 		 477 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.91955  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>