157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0078 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0078    100 
 
 		 629 bp  1247    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.132602  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4837  ABC transporter related  86.24 
 
 		 792 bp  194  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.856491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1167  ABC transporter related  84.16 
 
 		 801 bp  147  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259654  normal  0.174224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4901  ABC transporter related  83.03 
 
 		 798 bp  139  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  83.67 
 
 		 807 bp  135  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1327  ABC transporter related  83.17 
 
 		 801 bp  131  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  0.338067 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  87.02 
 
 		 801 bp  125  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  86.57 
 
 		 801 bp  123  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31130  ABC transporter ATP binding protein  82.47 
 
 		 795 bp  115  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.098287  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5619  ABC transporter related  86.07 
 
 		 837 bp  107  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  84.03 
 
 		 789 bp  103  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  84.33 
 
 		 816 bp  99.6  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  84.33 
 
 		 822 bp  99.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  83.58 
 
 		 822 bp  91.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  83.58 
 
 		 822 bp  91.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  82.48 
 
 		 828 bp  81.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  82.09 
 
 		 795 bp  75.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  85.39 
 
 		 831 bp  73.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  82.76 
 
 		 798 bp  71.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12490  Oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding component  95.45 
 
 		 969 bp  71.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0971633  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  90.91 
 
 		 840 bp  69.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  87.32 
 
 		 780 bp  69.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  93.48 
 
 		 816 bp  67.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4023  ABC transporter related  84.04 
 
 		 951 bp  67.9  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  85.37 
 
 		 1071 bp  67.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3728  ABC transporter related  84.04 
 
 		 951 bp  67.9  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.365004 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1884  oligopeptide ATP-binding ABC transporter protein  93.33 
 
 		 999 bp  65.9  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0431032  normal  0.324708 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  95.12 
 
 		 789 bp  65.9  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1874  ABC transporter, ATPase subunit  90.57 
 
 		 1101 bp  65.9  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209056  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  82.3 
 
 		 792 bp  65.9  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0859  ABC transporter related  80.26 
 
 		 777 bp  63.9  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0340597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  93.18 
 
 		 780 bp  63.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  91.67 
 
 		 864 bp  63.9  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  83.91 
 
 		 819 bp  61.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  86.57 
 
 		 822 bp  61.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5824  ABC transporter related  91.49 
 
 		 816 bp  61.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.971522  normal  0.461602 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  87.1 
 
 		 1092 bp  60  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58470  ABC transporter ATP-binding protein  88.89 
 
 		 975 bp  60  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.868458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5515  ABC transporter related  100 
 
 		 837 bp  60  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  82.65 
 
 		 798 bp  60  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  81.36 
 
 		 792 bp  60  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  82.65 
 
 		 798 bp  60  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0298  ABC transporter related  84.42 
 
 		 819 bp  58  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  88.68 
 
 		 840 bp  58  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  100 
 
 		 1119 bp  58  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  89.8 
 
 		 810 bp  58  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  92.68 
 
 		 783 bp  58  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  94.44 
 
 		 1884 bp  56  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2053  ABC transporter, ATP-binding protein  86.67 
 
 		 1014 bp  56  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.514983  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3102  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  100 
 
 		 1932 bp  56  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94565  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2557  ABC transporter related protein  90.91 
 
 		 1209 bp  56  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000490216  normal  0.117456 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6512  ABC transporter related  90.91 
 
 		 795 bp  56  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6746  ABC transporter related  90.91 
 
 		 795 bp  56  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665072  normal  0.226989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  87.5 
 
 		 831 bp  56  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2335  ABC transporter related  90.91 
 
 		 846 bp  56  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1188  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  92.5 
 
 		 1833 bp  56  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  89.58 
 
 		 846 bp  56  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5476  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  83.33 
 
 		 1131 bp  56  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6335  ABC transporter related  90.91 
 
 		 795 bp  56  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3644  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  88.24 
 
 		 1131 bp  54  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.84314  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1927  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  92.31 
 
 		 1890 bp  54  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.831202  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  85.71 
 
 		 1101 bp  54  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  85.71 
 
 		 780 bp  54  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3724  ABC transporter related  85.71 
 
 		 987 bp  54  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  90.7 
 
 		 768 bp  54  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5119  ABC transporter ATP-binding protein  89.36 
 
 		 975 bp  54  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1662  ABC transporter related  86.44 
 
 		 1044 bp  54  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1099  ABC transporter related  85.71 
 
 		 984 bp  54  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5129  ABC transporter related  100 
 
 		 828 bp  54  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5066  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  86.44 
 
 		 1104 bp  54  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.478807  normal  0.674172 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  85.48 
 
 		 1152 bp  52  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0856  ABC transporter, ATP-binding protein  87.04 
 
 		 1014 bp  52  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0425057  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1901  ABC transporter, ATP-binding protein  87.04 
 
 		 1014 bp  52  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3916  ABC transporter related  83.33 
 
 		 816 bp  52  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0231  ABC transporter related  83.33 
 
 		 789 bp  52  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3469  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  96.67 
 
 		 1182 bp  52  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.647978 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1762  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  92.11 
 
 		 1005 bp  52  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.389781  normal  0.264761 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2220  ABC transporter related  92.11 
 
 		 852 bp  52  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  88 
 
 		 810 bp  52  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2850  ABC transporter related  82.93 
 
 		 768 bp  52  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.220732  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1759  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  87.04 
 
 		 1098 bp  52  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354405  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2213  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  87.04 
 
 		 1098 bp  52  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527977  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0585  ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components  87.04 
 
 		 1098 bp  52  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0087071  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0897  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  87.04 
 
 		 1098 bp  52  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106898  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  88 
 
 		 741 bp  52  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2227  ABC transporter related protein  100 
 
 		 804 bp  52  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0741245  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3942  ABC transporter related  88 
 
 		 996 bp  52  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.311747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4042  ABC transporter related  100 
 
 		 1083 bp  52  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  100 
 
 		 810 bp  52  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1486  ABC transporter related  82.22 
 
 		 960 bp  52  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1384  ABC transporter related protein  92.11 
 
 		 834 bp  52  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0283767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3600  ABC transporter related  96.67 
 
 		 792 bp  52  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00199632  normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3003  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  88.89 
 
 		 999 bp  50.1  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  85.25 
 
 		 849 bp  50.1  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0678  acetylglutamate/acetylaminoadipate kinase  100 
 
 		 804 bp  50.1  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.173173  normal  0.204565 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0245  ABC transporter related  82.72 
 
 		 843 bp  50.1  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.415257  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1093  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  90.24 
 
 		 1071 bp  50.1  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0116  ABC transporter related  93.94 
 
 		 768 bp  50.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0979566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1217  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  91.89 
 
 		 1038 bp  50.1  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  82.02 
 
 		 855 bp  50.1  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>