178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0076 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0076  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
134 aa  279  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0152  alkylhydroperoxidase  73.68 
 
 
137 aa  209  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.909501  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0301  alkylhydroperoxidase AhpD core  71.97 
 
 
137 aa  205  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3860  alcohol dehydrogenase  73.68 
 
 
135 aa  204  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5750  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  69.17 
 
 
135 aa  203  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.36901 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3382  hypothetical protein  70.68 
 
 
135 aa  194  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282694  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1750  alkylhydroperoxidase  61.94 
 
 
132 aa  173  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430274  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3028  alkylhydroperoxidase  70.18 
 
 
118 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970861  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2606  alkylhydroperoxidase AhpD core  59.5 
 
 
130 aa  160  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327752  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2036  alkylhydroperoxidase  61.86 
 
 
143 aa  158  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.466607  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1632  alkylhydroperoxidase AhpD core  58.33 
 
 
130 aa  150  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134838  normal  0.2145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  56.56 
 
 
130 aa  148  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0965008  normal  0.0295015 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0600  alkylhydroperoxidase  55.74 
 
 
130 aa  146  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0188  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.39 
 
 
233 aa  102  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.514154  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.25 
 
 
176 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.98 
 
 
176 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.23 
 
 
181 aa  57  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.97 
 
 
178 aa  55.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 
189 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.14 
 
 
186 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.14 
 
 
186 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.07 
 
 
211 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.9 
 
 
216 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.33 
 
 
112 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  32.97 
 
 
192 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  30.85 
 
 
181 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  38.24 
 
 
183 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.26 
 
 
217 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  31.4 
 
 
189 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.18 
 
 
180 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0332  alkylhydroperoxidase  32.43 
 
 
144 aa  50.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  31.82 
 
 
194 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0700  carboxymuconolactone decarboxylase  34.21 
 
 
155 aa  50.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.363105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.07 
 
 
172 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.28 
 
 
179 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  32.52 
 
 
183 aa  50.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  31.82 
 
 
192 aa  50.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.82 
 
 
192 aa  50.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0497  alkylhydroperoxidase  45.31 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.40883 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  43.06 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  32.94 
 
 
201 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1580  alkylhydroperoxidase  30.7 
 
 
144 aa  48.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.589547  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1046  alkylhydroperoxidase  32.11 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  39.71 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  35.82 
 
 
225 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  42.62 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  51.22 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  31.13 
 
 
172 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.03 
 
 
192 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  32.26 
 
 
172 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.91 
 
 
178 aa  47.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.34 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  39.39 
 
 
112 aa  47  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.82 
 
 
192 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.76 
 
 
196 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4256  alkylhydroperoxidase  30.36 
 
 
183 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875283  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  32.5 
 
 
201 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  30.68 
 
 
192 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.03 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.03 
 
 
192 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  32.89 
 
 
182 aa  46.6  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  33.7 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.89 
 
 
189 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.19 
 
 
172 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  46.15 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2441  alkylhydroperoxidase  25.76 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.57 
 
 
191 aa  45.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  36.71 
 
 
112 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  36.71 
 
 
112 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  42.62 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.68 
 
 
192 aa  45.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  46.15 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.52 
 
 
212 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  54.05 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1909  alkylhydroperoxidase-like protein  27.13 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2061  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.84 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  31.82 
 
 
192 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  28.16 
 
 
177 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.82 
 
 
192 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.82 
 
 
192 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.68 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0806  alkylhydroperoxidase  32.5 
 
 
174 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0545  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
369 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.99267  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  44.44 
 
 
157 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.08 
 
 
182 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.58 
 
 
188 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1616  alkylhydroperoxidase  38.24 
 
 
111 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630224  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  31.58 
 
 
198 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  38.24 
 
 
115 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  31.58 
 
 
207 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.81 
 
 
181 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1177  alkylhydroperoxidase  30 
 
 
169 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.135888 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  28.41 
 
 
201 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  29.49 
 
 
199 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  25 
 
 
178 aa  43.5  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2298  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.62 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  31.33 
 
 
183 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.29 
 
 
184 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0782  alkylhydroperoxidase  31.37 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.592163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.27 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>