More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0058 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0058  histidine kinase  86.33 
 
 		 461 aa  766    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0058  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 462 aa  885    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.45 
 
 		 469 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.248447  normal  0.139653 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3932  histidine kinase  43.01 
 
 		 474 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3588  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 474 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2527  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 473 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.547854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6694  putative two-component system histidine kinase  45.8 
 
 		 462 aa  325  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 		 473 aa  323  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.739946  normal  0.0152706 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5324  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.36 
 
 		 473 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 		 463 aa  258  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02406  two-component system sensor protein  41.97 
 
 		 461 aa  251  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4431  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4162  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0287  two-component system, sensor protein  37.16 
 
 		 457 aa  237  3e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0258  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 457 aa  236  8e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.818246  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1450  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 460 aa  219  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126208  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  37.13 
 
 		 460 aa  216  9e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1803  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 487 aa  216  9e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  37.13 
 
 		 460 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  35.46 
 
 		 474 aa  209  8e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 461 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2734  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 461 aa  208  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0124674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  37.92 
 
 		 496 aa  204  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 		 515 aa  202  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3492  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 456 aa  202  9e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0651449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 459 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.08 
 
 		 515 aa  200  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 459 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 463 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 517 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  35.24 
 
 		 500 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 519 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 459 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  33.93 
 
 		 517 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 515 aa  196  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 515 aa  195  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 		 471 aa  193  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  33.93 
 
 		 518 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 523 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 515 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 464 aa  190  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.093144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  31.12 
 
 		 517 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 517 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 517 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 509 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2866  histidine kinase  33.85 
 
 		 508 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  33.71 
 
 		 817 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6107  two component sensor kinase  32.13 
 
 		 467 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0311  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 476 aa  187  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3342  histidine kinase  33.33 
 
 		 460 aa  187  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0710689 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  32.66 
 
 		 505 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 474 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  32.66 
 
 		 505 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 474 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  32.66 
 
 		 505 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  32.66 
 
 		 505 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  34.62 
 
 		 499 aa  183  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3644  histidine kinase  33.26 
 
 		 460 aa  183  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54500  two-component sensor  36.61 
 
 		 460 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.452392 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 481 aa  182  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  32.6 
 
 		 463 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.28 
 
 		 513 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  33.18 
 
 		 474 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 		 531 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  31.66 
 
 		 526 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 487 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3584  histidine kinase  33.69 
 
 		 495 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 477 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1451  histidine kinase  34.95 
 
 		 440 aa  178  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0728  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 467 aa  178  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 524 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 478 aa  176  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3348  histidine kinase  33.63 
 
 		 481 aa  176  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0882915  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 493 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3436  sensor histidine kinase  34.06 
 
 		 497 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.999938  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 463 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4763  two-component sensor  36.72 
 
 		 460 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42346  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 455 aa  172  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 463 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  32.88 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  34.43 
 
 		 518 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3215  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 477 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  31.12 
 
 		 517 aa  170  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  31.97 
 
 		 475 aa  170  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 462 aa  169  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4637  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 485 aa  169  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.337185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 476 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 472 aa  168  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.184807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2571  histidine kinase  31.83 
 
 		 489 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673908 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3125  sensor protein QseC  31.59 
 
 		 457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  32.29 
 
 		 472 aa  167  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 482 aa  166  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  32.89 
 
 		 472 aa  166  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5198  histidine kinase  31.58 
 
 		 481 aa  166  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0041  sensor histidine kinase  33.65 
 
 		 459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0041  sensor histidine kinase  33.65 
 
 		 459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0254  sensor kinase protein  33.65 
 
 		 459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2173  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 457 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.097715  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>