133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0032 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0032  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 196 aa  383  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0034  orotate phosphoribosyltransferase  94.27 
 
 		 196 aa  359  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  77.6 
 
 		 196 aa  301  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  76.04 
 
 		 196 aa  298  5e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  76.04 
 
 		 196 aa  296  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  61.78 
 
 		 194 aa  241  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1574  orotate phosphoribosyltransferase  59.9 
 
 		 194 aa  233  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0783619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2869  orotate phosphoribosyltransferase  59.38 
 
 		 194 aa  224  9e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.943845  normal  0.0213162 
 
 
-
 
NC_004310  BR0653  orotate phosphoribosyltransferase  57.29 
 
 		 192 aa  213  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364226  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0646  orotate phosphoribosyltransferase  57.29 
 
 		 192 aa  213  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.704446  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2635  orotate phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 		 192 aa  209  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0469  orotate phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 		 192 aa  201  5e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0397818  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  54.64 
 
 		 194 aa  200  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  54.92 
 
 		 196 aa  186  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  53.61 
 
 		 196 aa  185  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  44.97 
 
 		 200 aa  168  5e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  43.98 
 
 		 190 aa  167  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  41.84 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  42.56 
 
 		 193 aa  157  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  40.21 
 
 		 191 aa  155  4e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1108  orotate phosphoribosyltransferase  41.88 
 
 		 199 aa  154  9e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.899932  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  44.15 
 
 		 189 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 		 196 aa  150  1e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  38.74 
 
 		 190 aa  148  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  40.84 
 
 		 198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  41.36 
 
 		 193 aa  144  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1029  orotate phosphoribosyltransferase  43.52 
 
 		 195 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00928266  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  38.34 
 
 		 193 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  44.57 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  44.57 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  39.9 
 
 		 193 aa  143  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  40.32 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  40.32 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  41.45 
 
 		 191 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  38.74 
 
 		 195 aa  141  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  38.66 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  40.72 
 
 		 191 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  39.89 
 
 		 195 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0908  orotate phosphoribosyltransferase  44.02 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  39.49 
 
 		 191 aa  134  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  38.3 
 
 		 188 aa  134  8e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  37.7 
 
 		 191 aa  131  6.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  36.17 
 
 		 188 aa  131  7.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  40.22 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  37.13 
 
 		 202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  38.74 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  40.31 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  35.83 
 
 		 187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  39.06 
 
 		 195 aa  127  9.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  37.62 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  39.41 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  38.73 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  37.13 
 
 		 202 aa  124  7e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  36.14 
 
 		 202 aa  124  8.000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  39.09 
 
 		 189 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  35.57 
 
 		 196 aa  122  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  35.64 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  35.38 
 
 		 195 aa  122  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  36.41 
 
 		 202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  38.12 
 
 		 202 aa  119  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  38.34 
 
 		 202 aa  116  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  35.15 
 
 		 202 aa  115  3e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  40.21 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1343  phosphoribosyltransferase  31.32 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000345754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3840  phosphoribosyltransferase  34.2 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000401087 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1652  orotate phosphoribosyltransferase  30.83 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  29.22 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2604  orotate phosphoribosyltransferase  27.22 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  28.39 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2531  orotate phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3709  orotate phosphoribosyltransferase  25.79 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0928059  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3733  orotate phosphoribosyltransferase  25.79 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191128  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4021  orotate phosphoribosyltransferase  25.79 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3927  orotate phosphoribosyltransferase  25.79 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1310  orotate phosphoribosyltransferase  32.48 
 
 		 219 aa  51.2  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1261  orotate phosphoribosyltransferase  25.79 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3896  orotate phosphoribosyltransferase  25.79 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000349219 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3624  orotate phosphoribosyltransferase  25.79 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3641  orotate phosphoribosyltransferase  25.16 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  29.82 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3931  orotate phosphoribosyltransferase  25.16 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3980  orotate phosphoribosyltransferase  25.16 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0239  orotate phosphoribosyltransferase  30.68 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2669  orotate phosphoribosyltransferase  29.84 
 
 		 209 aa  48.1  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  31.47 
 
 		 192 aa  48.1  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  27.45 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1353  orotate phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3471  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  28.46 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.743259  decreased coverage  0.000656001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  31.79 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0127  orotate phosphoribosyltransferase  23.81 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00677892  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  25.5 
 
 		 176 aa  45.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2766  orotate phosphoribosyltransferase  30.65 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0547  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  31.25 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0210  orotate phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 		 178 aa  45.1  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  28.95 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>