More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_R0049 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A5626  23S ribosomal RNA  89.99 
 
 
2908 bp  1390  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178373  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0017  23S ribosomal RNA  91.6 
 
 
3129 bp  706  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.78829 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0004  23S ribosomal RNA  91.6 
 
 
3129 bp  706  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0145  23S ribosomal RNA  90.08 
 
 
2908 bp  1398  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192013  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0095  23S ribosomal RNA  90.08 
 
 
2908 bp  1398  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00287341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0075  23S ribosomal RNA  90.08 
 
 
2908 bp  1398  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0072  23S ribosomal RNA  90.16 
 
 
2908 bp  1405  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0069  23S ribosomal RNA  90.08 
 
 
2908 bp  1398  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0066  23S ribosomal RNA  90.08 
 
 
2908 bp  1398  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0063  23S ribosomal RNA  90.08 
 
 
2908 bp  1398  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0060  23S ribosomal RNA  90.08 
 
 
2908 bp  1398  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0055  23S ribosomal RNA  90.08 
 
 
2908 bp  1398  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0031  23S ribosomal RNA  90.08 
 
 
2908 bp  1398  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0028  23S ribosomal RNA  90.08 
 
 
2908 bp  1398  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0016  23S ribosomal RNA  90.08 
 
 
2908 bp  1398  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0011  23S ribosomal RNA  90.08 
 
 
2908 bp  1398  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0027  23S ribosomal RNA  91.6 
 
 
3129 bp  706  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.344785  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0055  23S ribosomal RNA  91.6 
 
 
3129 bp  706  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639179  decreased coverage  0.00060371 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5619  23S ribosomal RNA  89.99 
 
 
2908 bp  1390  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.298261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5037  23S ribosomal RNA  89.99 
 
 
2909 bp  1390  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  6.90364e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0850  23S ribosomal RNA  89.99 
 
 
2909 bp  1390  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.23811e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0596  23S ribosomal RNA  89.99 
 
 
2909 bp  1390  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  4.24077e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0357  23S ribosomal RNA  89.99 
 
 
2909 bp  1390  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00725974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0348  23S ribosomal RNA  90.08 
 
 
2909 bp  1398  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0669786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0342  23S ribosomal RNA  89.99 
 
 
2909 bp  1390  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0924378  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0331  23S ribosomal RNA  89.99 
 
 
2909 bp  1390  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0325  23S ribosomal RNA  89.99 
 
 
2909 bp  1390  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0212799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0303  23S ribosomal RNA  89.99 
 
 
2909 bp  1390  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106285  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0185  23S ribosomal RNA  89.99 
 
 
2909 bp  1390  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  7.05814e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0105  23S ribosomal RNA  89.99 
 
 
2909 bp  1390  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  7.7794e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0092  23S ribosomal RNA  89.99 
 
 
2909 bp  1390  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0130944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0034  23S ribosomal RNA  89.99 
 
 
2909 bp  1390  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0010  23S ribosomal RNA  89.99 
 
 
2909 bp  1390  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0263199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0004  23S ribosomal RNA  90.08 
 
 
2908 bp  1398  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0090  23S ribosomal RNA  85.42 
 
 
2900 bp  936  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.133955  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0087  23S ribosomal RNA  85.51 
 
 
2900 bp  944  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0011  23S ribosomal RNA  90.59 
 
 
2907 bp  1445  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0004  23S ribosomal RNA  90.59 
 
 
2908 bp  1445  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0080  23S ribosomal RNA  89.72 
 
 
2923 bp  1404  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.632106  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0069  23S ribosomal RNA  89.72 
 
 
2923 bp  1404  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0064  23S ribosomal RNA  89.72 
 
 
2923 bp  1404  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.65244  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0022  23S ribosomal RNA  89.64 
 
 
2923 bp  1396  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0019  23S ribosomal RNA  89.72 
 
 
2923 bp  1404  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0006  23S ribosomal RNA  89.64 
 
 
2923 bp  1396  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0078  23S ribosomal RNA  99.9 
 
 
2925 bp  5773  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0063  23S ribosomal RNA  99.76 
 
 
2924 bp  5733  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00771367  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0049  23S ribosomal RNA  100 
 
 
2925 bp  5798  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0025  23S ribosomal RNA  99.86 
 
 
2925 bp  5767  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.610781  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0010  23S ribosomal RNA  99.86 
 
 
2925 bp  5767  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0004  23S ribosomal RNA  99.83 
 
 
2925 bp  5759  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  5.45462e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0080  23S ribosomal RNA  89.72 
 
 
2923 bp  1404  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0016  23S ribosomal RNA  90.59 
 
 
2907 bp  1445  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.921086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0028  23S ribosomal RNA  90.59 
 
 
2907 bp  1445  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0084  23S ribosomal RNA  85.06 
 
 
2900 bp  922  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0759493  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0067  23S ribosomal RNA  85.06 
 
 
2900 bp  922  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0064  23S ribosomal RNA  85.06 
 
 
2900 bp  922  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0029  23S ribosomal RNA  85.06 
 
 
2900 bp  922  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0017  23S ribosomal RNA  85.42 
 
 
2900 bp  936  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0004  23S ribosomal RNA  85.06 
 
 
2900 bp  922  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0141  23S ribosomal RNA  90.59 
 
 
2907 bp  1445  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.030132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0091  23S ribosomal RNA  90.59 
 
 
2907 bp  1445  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109092  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0072  23S ribosomal RNA  90.5 
 
 
2907 bp  1437  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000119646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0069  23S ribosomal RNA  90.5 
 
 
2908 bp  1437  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0066  23S ribosomal RNA  90.59 
 
 
2907 bp  1445  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0063  23S ribosomal RNA  90.59 
 
 
2908 bp  1445  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0060  23S ribosomal RNA  90.59 
 
 
2908 bp  1445  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0055  23S ribosomal RNA  90.59 
 
 
2907 bp  1445  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.940507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0031  23S ribosomal RNA  90.5 
 
 
2907 bp  1437  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000296907  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0069  23S ribosomal RNA  89.72 
 
 
2923 bp  1404  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5631  23S ribosomal RNA  89.99 
 
 
2908 bp  1390  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260934  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0113  23S ribosomal RNA  89.91 
 
 
2927 bp  1396  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0054  23S ribosomal RNA  89.86 
 
 
2933 bp  1376  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0030  23S ribosomal RNA  89.86 
 
 
2933 bp  1376  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0027  23S ribosomal RNA  89.78 
 
 
2933 bp  1368  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.373876  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0016  23S ribosomal RNA  89.86 
 
 
2933 bp  1376  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0203947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0011  23S ribosomal RNA  89.78 
 
 
2933 bp  1368  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0004  23S ribosomal RNA  89.78 
 
 
2933 bp  1368  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0069  23S ribosomal RNA  90.77 
 
 
2609 bp  678  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0041  23S ribosomal RNA  90.59 
 
 
2618 bp  670  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0588399  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0021  23S ribosomal RNA  90.77 
 
 
2609 bp  678  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0002  23S ribosomal RNA  90.77 
 
 
2609 bp  678  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.1832e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0079  23S ribosomal RNA  89.04 
 
 
2913 bp  733  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.354766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0071  23S ribosomal RNA  89.34 
 
 
2912 bp  749  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.19372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0064  23S ribosomal RNA  89.19 
 
 
2912 bp  741  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00853635  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0020  23S ribosomal RNA  89.04 
 
 
3062 bp  733  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.58535e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0009  23S ribosomal RNA  89.04 
 
 
2912 bp  733  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.363949  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0059  23S ribosomal RNA  89.78 
 
 
2935 bp  1368  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0062  23S ribosomal RNA  89.95 
 
 
2932 bp  1384  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0070  23S ribosomal RNA  90.08 
 
 
2927 bp  1411  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0066  23S ribosomal RNA  89.99 
 
 
2927 bp  1404  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0037  23S ribosomal RNA  89.91 
 
 
2927 bp  1396  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0027  23S ribosomal RNA  90.08 
 
 
2927 bp  1411  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0024  23S ribosomal RNA  89.99 
 
 
2927 bp  1404  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0010  23S ribosomal RNA  89.91 
 
 
2927 bp  1396  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0004  23S ribosomal RNA  89.99 
 
 
2928 bp  1404  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0059  23S ribosomal RNA  91.22 
 
 
2943 bp  718  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.12329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0050  23S ribosomal RNA  91.22 
 
 
2946 bp  718  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.074771  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0031  23S ribosomal RNA  91.22 
 
 
2946 bp  718  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.196747  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0028  23S ribosomal RNA  91.22 
 
 
2946 bp  718  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0010  23S ribosomal RNA  91.22 
 
 
2944 bp  718  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.142358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>