298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1944 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1944  50S ribosomal protein L34  100 
 
 		 44 aa  85.1  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00370795  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2065  50S ribosomal protein L34  93.18 
 
 		 44 aa  80.5  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000217746  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1864  50S ribosomal protein L34P  86.36 
 
 		 44 aa  75.5  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.670126  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1898  ribosomal protein L34  86.05 
 
 		 54 aa  75.1  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000611674  hitchhiker  3.5180100000000004e-26 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3434  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 		 44 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5281  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5639  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5341  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000589989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5185  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5738  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0731881  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5320  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5598  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4028  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.105181  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5675  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5615  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106423  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0001  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 45 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000166725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3562  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2793  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 45 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.202877  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3946  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 		 44 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2414  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  63.9  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000429596  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1793  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000343039  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0279  ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 52 aa  61.2  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1055  ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 51 aa  61.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2577  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0134  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 52 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135a  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000390368  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3898  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.035137  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12828  hypothetical protein  72.73 
 
 		 52 aa  60.5  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0709  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 48 aa  60.5  0.000000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28540  LSU ribosomal protein L34P  69.77 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000649644  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6371  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1787  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000418324  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2950  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000318423  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52480  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4045  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 46 aa  58.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486459 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4017  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00224916  normal  0.155192 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3608  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2935  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000367166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2199  ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000155667  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3760  50S ribosomal protein L34P  73.81 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0009  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5615  ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5137  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4623  50S ribosomal protein L34P  69.77 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0002  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4487  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  57  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849089  hitchhiker  0.00000000110171 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf883  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 48 aa  56.6  0.0000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2238  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.773424  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3921  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 55 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250811  normal  0.369762 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1543  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 52 aa  56.6  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.185024 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682.1  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2763  ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 52 aa  55.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000022911  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4618  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 46 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0870  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4315  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000480274  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0096  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 52 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605951 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4370  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.09492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2924  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 53 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916972  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2743  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 53 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3852  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 52 aa  55.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3505  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0561624 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2038  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2138  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0031  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 46 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  0.196138 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1021  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.797032  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0962  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2132  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 53 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189497  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0521  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.907647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4038  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 46 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.34188  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0656  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 50 aa  54.3  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244963 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2033  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 51 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.778923  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0132  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0575  50S ribosomal protein L34P  68.18 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13959  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 47 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0357  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.0448083 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0082  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.376077 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27040  LSU ribosomal protein L34P  67.44 
 
 		 45 aa  53.5  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1046  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  53.5  0.0000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0456047  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2338  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 53 aa  53.5  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4225  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 45 aa  53.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2524  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 53 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.480913  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2512  50S ribosomal protein L34  69.05 
 
 		 45 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197783  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2353  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.15509 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38060  LSU ribosomal protein L34P  65.12 
 
 		 49 aa  52.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2414  ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00945499  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9056  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 45 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00101546  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3089  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1059  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.202626  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0070  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0081  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2632  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1363  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2603  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 46 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15416  normal  0.859083 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1568  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 47 aa  53.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0660974  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2310  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093766 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2720  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.054761 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2884  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715219  normal  0.406653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1923  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.360923  normal  0.510099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>