More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1893 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 223 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  70.59 
 
 		 222 aa  337  9.999999999999999e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  37.23 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  34.89 
 
 		 236 aa  142  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  35.24 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  35.62 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  36.17 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  35.65 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  37.1 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  37.97 
 
 		 231 aa  135  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  34.63 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  36.36 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  37.02 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  36.07 
 
 		 229 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  33.77 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  36.32 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 233 aa  126  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  35.8 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2575  glutamine amidotransferase class-I  35.35 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  33.89 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  33.18 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  35.29 
 
 		 228 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  36.9 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  36.17 
 
 		 236 aa  112  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  36.46 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0634  putative glutamine amidotransferase  36.72 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  30.56 
 
 		 243 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  35.03 
 
 		 236 aa  108  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  28.63 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  30.97 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  34.97 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0513  glutamine amidotransferase class-I  37.02 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0638034  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  29.65 
 
 		 245 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  28.19 
 
 		 228 aa  106  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  35.39 
 
 		 234 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  36.57 
 
 		 288 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  34.66 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  35.36 
 
 		 237 aa  102  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6109  glutamine amidotransferase  34.25 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  35.83 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  31.86 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  35.83 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2631  glutamine amidotransferase  34.52 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0063485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2803  glutamine amidotransferase  34.52 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2582  glutamine amidotransferase  34.52 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2697  glutamine amidotransferase  34.52 
 
 		 239 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2673  glutamine amidotransferase  34.52 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  36.93 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  33.7 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  36.02 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0890  glutamine amidotransferase  28.38 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00279446  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  35.43 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2713  glutamine amidotransferase  30.61 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  32.04 
 
 		 389 aa  99.4  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  35.71 
 
 		 234 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3609  glutamine amidotransferase  33.15 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00629536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3486  glutamine amidotransferase  33.15 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  31.89 
 
 		 233 aa  95.9  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3185  glutamine amidotransferase class-I  27.8 
 
 		 243 aa  95.9  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620946 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  34.29 
 
 		 231 aa  95.9  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  38.41 
 
 		 235 aa  95.5  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 242 aa  95.1  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  33.5 
 
 		 247 aa  94.7  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3411  glutamine amidotransferase  32.6 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0545272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  33.71 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  31.65 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  31.65 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  28.09 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4214  glutamine amidotransferase  29.08 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.278908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  31.75 
 
 		 232 aa  92.8  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1579  glutamine amidotransferase  35.56 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430853  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2079  glutamine amidotransferase  32.62 
 
 		 246 aa  92.8  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  30.21 
 
 		 241 aa  92.4  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  27.66 
 
 		 243 aa  92.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  30.48 
 
 		 241 aa  92  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  29.73 
 
 		 229 aa  92  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  30.85 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  32.97 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  30.85 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  31 
 
 		 252 aa  90.9  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3704  glutamine amidotransferase  34.29 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.480438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4025  glutamine amidotransferase  34.86 
 
 		 251 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.54233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  32.14 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  31.7 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2565  glutamine amidotransferase class-I  36.03 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  31.25 
 
 		 236 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1717  glutamine amidotransferase class-I  33.14 
 
 		 237 aa  89  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  31.25 
 
 		 233 aa  89  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  30 
 
 		 236 aa  88.6  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  35.51 
 
 		 234 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  36.55 
 
 		 222 aa  88.2  9e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3102  glutamine amidotransferase class-I  32.02 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.830668  normal  0.133558 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4908  glutamine amidotransferase  25.97 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  30.94 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  34.78 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  30.34 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  32.04 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0325  glutamine amidotransferase class-I  33.72 
 
 		 224 aa  86.3  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.939059 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  31.91 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  32.38 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0578431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>