87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1865 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 
430 aa  894    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0732  hypothetical protein  54.21 
 
 
429 aa  474  1e-132  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.368831  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0697  hypothetical protein  51.15 
 
 
435 aa  434  1e-120  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000533536  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  44.24 
 
 
437 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  44.24 
 
 
437 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350178  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  44.83 
 
 
437 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0438  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  44.01 
 
 
437 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  43.55 
 
 
437 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0361814  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0371  type I phosphodiesterase  43.78 
 
 
437 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00015541  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0368  type I phosphodiesterase  44.01 
 
 
437 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000500368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0394  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  43.55 
 
 
437 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  43.98 
 
 
437 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000352443  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0374  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  42.43 
 
 
437 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  42.63 
 
 
437 aa  365  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000974575  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1625  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  41.43 
 
 
431 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.018842  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1367  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  40.48 
 
 
431 aa  347  3e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.1 
 
 
422 aa  268  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.26 
 
 
456 aa  178  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.579511 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.87 
 
 
455 aa  166  8e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.27 
 
 
433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4169  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27 
 
 
445 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  hitchhiker  0.00388008 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.52 
 
 
496 aa  139  7e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1148  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.56 
 
 
461 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  25.11 
 
 
422 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  25.56 
 
 
713 aa  80.5  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11140  uncharacterized AP superfamily protein  22.65 
 
 
466 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0415876 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00130  hypothetical protein  21.56 
 
 
540 aa  74.7  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.997572  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  22.25 
 
 
417 aa  74.3  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1841  phosphodiesterase I  22.2 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126105  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1106  phosphodiesterase I  24.43 
 
 
424 aa  73.6  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2330  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.82 
 
 
467 aa  72.8  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0776  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.13 
 
 
501 aa  71.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1878  phosphodiesterase I  23.62 
 
 
428 aa  70.5  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.872565 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  21.85 
 
 
417 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03452  putative type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase protein  21.43 
 
 
447 aa  66.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1643  nucleotide diphosphatase  23.99 
 
 
411 aa  66.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0839592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2289  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.16 
 
 
456 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0787093 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.9 
 
 
312 aa  63.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.46 
 
 
411 aa  63.2  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372693 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2169  phosphodiesterase I  23.81 
 
 
433 aa  63.2  0.000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1658  nucleotide diphosphatase  22.09 
 
 
413 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0426  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.18 
 
 
450 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70997  phosphodiesterase; putative nucleotide pyrophosphatase precursor  24.1 
 
 
709 aa  61.2  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.42018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7260  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.44 
 
 
456 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000104438  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2080  phosphodiesterase I  23.41 
 
 
433 aa  60.8  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0396  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.13 
 
 
471 aa  59.7  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0983  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.43 
 
 
459 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1823  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.92 
 
 
455 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2886  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.77 
 
 
454 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2469  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.89 
 
 
467 aa  56.6  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00142832  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2529  phosphonoacetate hydrolase  22.81 
 
 
471 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3142  phosphonoacetate hydrolase  22.81 
 
 
412 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3158  phosphonoacetate hydrolase  22.51 
 
 
412 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19589  normal  0.0309825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20320  uncharacterized AP superfamily protein  23.17 
 
 
427 aa  53.9  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.291938  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3134  phosphonoacetate hydrolase  23.67 
 
 
412 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133169 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2427  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.19 
 
 
455 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3194  phosphonoacetate hydrolase  23.96 
 
 
412 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5338  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.68 
 
 
509 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.935168 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3720  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.3 
 
 
434 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758068  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17500  phosphonoacetate hydrolase  21.17 
 
 
416 aa  50.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2797  hypothetical protein  25.51 
 
 
274 aa  50.1  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.383004  hitchhiker  0.0000926251 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4875  phosphonoacetate hydrolase  21.84 
 
 
424 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1558  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.16 
 
 
458 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6493  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000588943  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5730  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.76 
 
 
349 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0082  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.7 
 
 
462 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106273  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.62 
 
 
434 aa  47.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17290  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.55 
 
 
453 aa  47.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  23.14 
 
 
569 aa  46.6  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1707  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  19.6 
 
 
307 aa  46.6  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  hitchhiker  4.53263e-17 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3427  phosphonoacetate hydrolase  22.49 
 
 
436 aa  46.6  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619528  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.9 
 
 
478 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4910  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.62 
 
 
682 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4485  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.14 
 
 
683 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000194972 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9252  phosphonoacetate hydrolase  23.04 
 
 
417 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1644  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.38 
 
 
519 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4352  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.14 
 
 
725 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.268784  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4133  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.57 
 
 
377 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0770784  hitchhiker  0.0000385329 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1624  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.66 
 
 
416 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000105277 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04783  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  32.1 
 
 
384 aa  45.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2730  putative phosphodiesterase-nucleotide pyrophosphatase  30.49 
 
 
744 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.204405  normal  0.277577 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1166  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.38 
 
 
542 aa  43.5  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284742  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1690  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.88 
 
 
490 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0352  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.12 
 
 
435 aa  43.1  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00675844  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4972  phosphonoacetate hydrolase  21.83 
 
 
436 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00141978  normal  0.1555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.76 
 
 
558 aa  43.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0726  hypothetical protein  23.67 
 
 
274 aa  43.1  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>