85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1858 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1858  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  712    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0734  peptide ABC transporter permease  53.41 
 
 		 353 aa  374  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  49.86 
 
 		 350 aa  342  5e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  41.36 
 
 		 348 aa  282  6.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  37.5 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1347  peptide ABC transporter permease  40.52 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0572  peptide ABC transporter permease  40.23 
 
 		 348 aa  239  4e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.26303  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1048  peptide ABC transporter permease  39.94 
 
 		 348 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  33.33 
 
 		 349 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  33.33 
 
 		 349 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  34.17 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  29.09 
 
 		 354 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  27.81 
 
 		 354 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  27.53 
 
 		 354 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  27.53 
 
 		 354 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  28.81 
 
 		 354 aa  159  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  27.53 
 
 		 354 aa  159  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  27.81 
 
 		 354 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  27.53 
 
 		 354 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  28.25 
 
 		 354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  28.25 
 
 		 354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0687  peptide ABC transporter permease  30.49 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  28.73 
 
 		 362 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  26.24 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1744  protein of unknown function DUF214  25.79 
 
 		 380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  24.4 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18550  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  25.51 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.766854  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  24.51 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  24.51 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1934  hypothetical protein  24.86 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3483  protein of unknown function DUF214  26.02 
 
 		 375 aa  95.9  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2883  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 347 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.07735  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00290  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  27.1 
 
 		 357 aa  94.4  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4149  hypothetical protein  25.2 
 
 		 361 aa  85.9  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  22.25 
 
 		 355 aa  82.8  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2484  protein of unknown function DUF214  23.24 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0213564  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3382  protein of unknown function DUF214  23.1 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4604  protein of unknown function DUF214  22.41 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  18.89 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04050  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  24.56 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.057296 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  20.38 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  26.14 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  23.77 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0187  hypothetical protein  25.64 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  25.57 
 
 		 855 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  19.79 
 
 		 349 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  24.36 
 
 		 401 aa  53.9  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  26.7 
 
 		 834 aa  53.9  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  20.94 
 
 		 402 aa  53.1  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  24.04 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1432  hypothetical protein  24.24 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  24.24 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  24.56 
 
 		 401 aa  50.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  23.15 
 
 		 401 aa  50.1  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  23.15 
 
 		 401 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  23.15 
 
 		 401 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  23.15 
 
 		 401 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  23.15 
 
 		 401 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  22.76 
 
 		 657 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  26.67 
 
 		 841 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  21.99 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  22.86 
 
 		 401 aa  47  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  27.83 
 
 		 402 aa  47  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  19.67 
 
 		 654 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  22.05 
 
 		 380 aa  46.6  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  24.79 
 
 		 399 aa  46.2  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.01 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1654  hypothetical protein  20.35 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.498405  normal  0.951827 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  24.63 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  22.61 
 
 		 833 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0476  ABC transporter, permease protein  22.6 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  25.98 
 
 		 657 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  22.05 
 
 		 654 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  30.7 
 
 		 400 aa  43.5  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  24.56 
 
 		 401 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  28.79 
 
 		 399 aa  43.5  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  26.5 
 
 		 794 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  24.41 
 
 		 656 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  26.5 
 
 		 850 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  23.03 
 
 		 392 aa  42.7  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  24.6 
 
 		 885 aa  42.7  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  22.19 
 
 		 409 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  22.19 
 
 		 409 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  24.7 
 
 		 401 aa  42.7  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1813  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.63 
 
 		 416 aa  42.7  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0198484  normal  0.092514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>