More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1824 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1824  integral membrane protein TerC  100 
 
 
251 aa  503  1e-141  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0089  hypothetical protein  55.73 
 
 
260 aa  280  2e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0183454 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0339  integral membrane protein TerC  41.06 
 
 
255 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0387  integral membrane protein TerC  42.8 
 
 
262 aa  179  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.518334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0382  integral membrane protein TerC  42.69 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0578  Integral membrane protein TerC  39.75 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.592878 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4857  putative tellurium resistance protein  42.47 
 
 
263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.002558  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0516  putative tellurium resistance protein  43.08 
 
 
263 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000032211  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0376  TerC family integral membrane protein  43.08 
 
 
263 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499103  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0516  tellurium resistance protein, putative  42.31 
 
 
263 aa  169  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0388  tellurium resistance protein  42.31 
 
 
263 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000390174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0379  TerC family integral membrane protein  42.31 
 
 
263 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000163216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0402  tellurium resistance protein  42.31 
 
 
263 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.221092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0446  putative tellurium resistance protein  42.31 
 
 
263 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0467  putative tellurium resistance protein  42.69 
 
 
263 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2785  membrane protein TerC  39.5 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000011101  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1175  Integral membrane protein TerC  39.5 
 
 
271 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1776  integral membrane protein TerC  37.69 
 
 
259 aa  122  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.221136  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0990  Integral membrane protein TerC  37.1 
 
 
245 aa  122  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1856  Integral membrane protein TerC  36.41 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00332833  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1296  Integral membrane protein TerC  37.31 
 
 
245 aa  115  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0964782  normal  0.506232 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0610  TerC family integral membrane protein  32.34 
 
 
268 aa  110  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00407754  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2235  integral membrane protein TerC  31.67 
 
 
274 aa  109  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2770  Integral membrane protein TerC  37.11 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1298  Integral membrane protein TerC  34.43 
 
 
242 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.843516  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1726  hypothetical protein  39.47 
 
 
255 aa  107  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185755  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1019  integral membrane protein TerC  32.83 
 
 
267 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.192115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1038  integral membrane protein TerC  32.83 
 
 
267 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00785586  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2829  Integral membrane protein TerC  27.23 
 
 
245 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0867019  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4213  tellurium resistance protein TerC  32.51 
 
 
285 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.537903  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2338  Integral membrane protein TerC  29.86 
 
 
277 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0443  tellurium resistance protein TerC  31.53 
 
 
281 aa  98.6  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.850021  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3984  membrane protein, TerC family  28.78 
 
 
264 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1036  integral membrane protein TerC  28.35 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1422  hypothetical protein  28.78 
 
 
264 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1200  TerC family integral membrane protein  28.78 
 
 
264 aa  97.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1202  TerC family integral membrane protein  28.78 
 
 
264 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0439285  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1462  membrane protein, TerC family  28.78 
 
 
264 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1360  membrane protein, TerC family  28.78 
 
 
264 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1398  membrane protein, TerC family  28.78 
 
 
264 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1223  hypothetical protein  28.78 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1224  integral membrane protein TerC  28.29 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1322  hypothetical protein  28.78 
 
 
264 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3425  hypothetical protein  28.16 
 
 
240 aa  95.9  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4409  Integral membrane protein TerC  27.35 
 
 
254 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1024  Integral membrane protein TerC  30.49 
 
 
233 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0081641 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1844  Integral membrane protein TerC  28.02 
 
 
239 aa  94.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10491  tellurium resistance protein TerC  30.89 
 
 
240 aa  92  9e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120538  hitchhiker  0.00269947 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0367  membrane protein TerC  30.21 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1578  integral membrane protein TerC  30.46 
 
 
258 aa  89.4  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22538  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0549  hypothetical protein  29.02 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4472  Integral membrane protein TerC  27.5 
 
 
254 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0960  hypothetical protein  30.84 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0967888  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10291  membrane protein TerC  31.92 
 
 
232 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10281  membrane protein TerC  31.48 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.919914  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09251  tellurium resistance protein TerC  31.94 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0654271  hitchhiker  0.00000817994 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09161  tellurium resistance protein TerC  30.41 
 
 
236 aa  82  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1304  TerC family protein  27.69 
 
 
245 aa  81.6  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.666261  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1297  Integral membrane protein TerC  31.58 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.308093 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1171  TerC family protein  29.24 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.674887  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2735  Integral membrane protein TerC  27.05 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3367  Integral membrane protein TerC  27.05 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.50286  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2572  tellurium resistance protein TerC  28.21 
 
 
295 aa  79  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  30.56 
 
 
360 aa  75.5  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0992  Integral membrane protein TerC  29.36 
 
 
233 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3951  integral membrane protein TerC  26.83 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0480576 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  30.33 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  30.33 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  30.33 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6290  Integral membrane protein TerC  26.4 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.06689  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1647  Integral membrane protein TerC  27.69 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.409513  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  29.07 
 
 
322 aa  63.5  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3736  TerC family membrane protein  23.58 
 
 
261 aa  63.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407676  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  30.96 
 
 
324 aa  62.8  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  29 
 
 
373 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1829  integral membrane protein TerC  26.67 
 
 
236 aa  62.4  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106378  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0070  hypothetical protein  22.07 
 
 
234 aa  62.4  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.693932  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  23.24 
 
 
238 aa  62.4  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  31.07 
 
 
327 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0978  TerC family integral membrane protein  23.61 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3943  integral membrane protein TerC  22.77 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0819  TerC family integral membrane protein  23.61 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0815  TerC family integral membrane protein  23.61 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  23.48 
 
 
238 aa  61.6  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0479  hypothetical protein  27.5 
 
 
318 aa  61.6  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000001102  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0277  TerC family integral membrane protein  23.61 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12000  tellurium resistance membrane protein TerC  24 
 
 
300 aa  60.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000641872  normal  0.194106 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2399  TerC family integral membrane protein  23.61 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363415  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0012  TerC family integral membrane protein  23.61 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2677  TerC family integral membrane protein  23.61 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.849406  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3292  Integral membrane protein TerC  23.5 
 
 
229 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000553264  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  21.81 
 
 
250 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  22.65 
 
 
519 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0566  TerC family membrane protein  25.85 
 
 
228 aa  60.1  0.00000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0659342  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  22.65 
 
 
519 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  22.65 
 
 
519 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  22.65 
 
 
519 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  22.65 
 
 
519 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  27.32 
 
 
320 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  27.87 
 
 
339 aa  59.3  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>