More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1819 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  513  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  67.59 
 
 		 254 aa  345  3e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  60.87 
 
 		 256 aa  322  3e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  55.73 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  57.31 
 
 		 251 aa  279  4e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  56.63 
 
 		 252 aa  275  4e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  48.59 
 
 		 262 aa  240  1e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  47.2 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  49.2 
 
 		 267 aa  231  9e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  46.18 
 
 		 261 aa  227  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  45.38 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  42.57 
 
 		 270 aa  224  8e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  46.18 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  46.59 
 
 		 251 aa  221  6e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  44.76 
 
 		 265 aa  221  9e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  45.16 
 
 		 264 aa  221  9e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  44.58 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  44.58 
 
 		 265 aa  217  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  44.98 
 
 		 265 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  43.15 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  42.34 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  41.77 
 
 		 270 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  41.53 
 
 		 260 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  42.17 
 
 		 264 aa  211  7.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  41.77 
 
 		 264 aa  210  1e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  42.17 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  43.78 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 		 264 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 		 264 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  41.77 
 
 		 264 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 		 264 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 		 264 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 		 264 aa  209  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 		 264 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  44.58 
 
 		 267 aa  209  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  42.74 
 
 		 257 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 		 264 aa  208  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  45.42 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  42.17 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  42.17 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  42.34 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  42.57 
 
 		 264 aa  205  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  41.94 
 
 		 282 aa  205  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  42.17 
 
 		 264 aa  205  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  42.17 
 
 		 264 aa  205  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  41.77 
 
 		 264 aa  205  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  43.04 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  41.37 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 264 aa  202  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  43.65 
 
 		 263 aa  202  5e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 264 aa  202  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  40.96 
 
 		 264 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  40.96 
 
 		 264 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  40.96 
 
 		 264 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  39.92 
 
 		 264 aa  201  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  42 
 
 		 264 aa  201  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  41.77 
 
 		 264 aa  201  8e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  41.77 
 
 		 264 aa  201  8e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  40.73 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  42.17 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  41.77 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  39.52 
 
 		 264 aa  198  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  43.78 
 
 		 264 aa  198  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  41.37 
 
 		 263 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  43.4 
 
 		 264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  41.27 
 
 		 264 aa  195  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  42.97 
 
 		 264 aa  195  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  42.02 
 
 		 264 aa  189  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  39.11 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  43.35 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  39.04 
 
 		 267 aa  186  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  39.92 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  37.75 
 
 		 264 aa  185  7e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  37.96 
 
 		 245 aa  181  9.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  39.92 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  39.68 
 
 		 264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  34.89 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  33.62 
 
 		 240 aa  115  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  35.11 
 
 		 357 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  35.1 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0551  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  32.52 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.978201  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  32.64 
 
 		 370 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2212  ABC transporter, ATPase subunit  32.56 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.618749 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  32.46 
 
 		 357 aa  112  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3243  ABC transporter related  34.48 
 
 		 368 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  31.95 
 
 		 247 aa  109  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4972  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  30.42 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243489  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2614  ABC transporter related  32.69 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796579  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  32.42 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  36.55 
 
 		 234 aa  109  5e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4373  ABC transporter related  32.43 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003481  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  31.91 
 
 		 371 aa  108  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000145818  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1722  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  30.43 
 
 		 248 aa  108  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  34.2 
 
 		 350 aa  108  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1115  ABC transporter related  31.37 
 
 		 248 aa  108  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000583905  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0556  ABC transporter-like  33.06 
 
 		 238 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000214193  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  35.19 
 
 		 227 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1792  ABC transporter, ATP-binding protein  34.12 
 
 		 233 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3866  ABC transporter related  29.77 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1039  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  31.22 
 
 		 377 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>