More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1788 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 326 aa  669    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.841389  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2323  histidine kinase  30.57 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0514446  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1527  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 343 aa  133  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1309  sensor histidine kinase  29.36 
 
 		 323 aa  132  6e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000599634  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0977  sensor histidine kinase  31.43 
 
 		 312 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03370  signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 347 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1909  Signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 291 aa  127  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1081  histidine kinase  28.43 
 
 		 346 aa  126  6e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.837913 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2176  histidine kinase  32.31 
 
 		 368 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1416  histidine kinase  28 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0837  sensor histidine kinase  30.61 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0398077  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0831  sensor histidine kinase  31.55 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0938177  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0522  histidine kinase  33.33 
 
 		 331 aa  123  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 350 aa  122  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0835  Signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0874026  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0494  histidine kinase  27.84 
 
 		 340 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.752547  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0118  sensor histidine kinase  28.18 
 
 		 337 aa  116  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.151918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2305  histidine kinase  29.22 
 
 		 328 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000217968  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0313  sensor histidine kinase  36.28 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2647  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2703  ATPase domain-containing protein  32.48 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2344  sensor histidine kinase  32.88 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00230354  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0116  sensor histidine kinase  29 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0322042  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2618  sensor histidine kinase, putative  33.03 
 
 		 334 aa  113  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0136174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2656  sensor protein YxdK  33.03 
 
 		 327 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115985  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2571  sensor protein YxdK  33.03 
 
 		 276 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.86964  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2379  two-component sensor histidine kinase  32.43 
 
 		 334 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00984637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2615  sensor histidine kinase  32.43 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000946507 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2539  histidine kinase  31.98 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2421  sensor histidine kinase, C-terminal  33.02 
 
 		 252 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208231  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2753  sensor histidine kinase  32.88 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000130626 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4183  sensor histidine kinase  26.44 
 
 		 370 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4172  two-component sensor histidine kinase  25.57 
 
 		 370 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.420668  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4530  sensor histidine kinase  35.63 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742104  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1092  histidine kinase  29.26 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4518  sensor histidine kinase  25.86 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4571  sensor histidine kinase  35.63 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0678  sensor histidine kinase  25.36 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4284  histidine kinase  34.48 
 
 		 360 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.895654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4335  histidine kinase-like ATPase  34.48 
 
 		 321 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0656  sensor histidine kinase, putative  30.48 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0734197  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4726  sensor histidine kinase  27.86 
 
 		 340 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4568  sensor histidine kinase  27.86 
 
 		 340 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00420124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5088  sensor histidine kinase  27.86 
 
 		 340 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4990  sensor histidine kinase  27.86 
 
 		 340 aa  102  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0271  sensor histidine kinase  27.86 
 
 		 340 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4962  sensor histidine kinase  27.86 
 
 		 340 aa  102  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4949  sensor histidine kinase  27.86 
 
 		 340 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4588  sensor histidine kinase  27.86 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.868097  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.132473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0698  ATPase domain-containing protein  29.18 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.541747  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4977  sensor histidine kinase  27.55 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4678  histidine kinase  27.24 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 340 aa  99.4  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4556  sensor histidine kinase  25.73 
 
 		 353 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3153  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.15 
 
 		 360 aa  98.6  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2205  sensor histidine kinase, putative  31.03 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5199  sensor histidine kinase  27.46 
 
 		 341 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.79 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1524  Signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 517 aa  77  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.13171  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1435  phosphate regulon sensor protein PhoR  28.45 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 464 aa  73.6  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0083  histidine kinase  26.43 
 
 		 402 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 511 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00510304  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3784  histidine kinase  21.58 
 
 		 496 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.26 
 
 		 592 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.14 
 
 		 571 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0830  histidine kinase  25.55 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 591 aa  70.5  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1722  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 		 763 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 462 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 511 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 463 aa  70.1  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4607  histidine kinase  23.08 
 
 		 696 aa  69.7  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.998833  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0783  Signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 		 491 aa  69.7  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1321  sensor histidine kinase  27.47 
 
 		 377 aa  69.3  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2387  histidine kinase  25.88 
 
 		 400 aa  69.3  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1154  histidine kinase  26.34 
 
 		 414 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3493  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  23.79 
 
 		 867 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.789076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4169  sensor histidine kinase  26.78 
 
 		 580 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0804  histidine kinase  32.43 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0156746  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 		 586 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.16 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1172  sensor histidine kinase  26.78 
 
 		 580 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0874083  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1188  sensor histidine kinase, putative  23.05 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  24.03 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1550  ATP-binding region, ATPase-like protein  25.61 
 
 		 531 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  0.141787 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.72 
 
 		 376 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.81 
 
 		 592 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130733  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 		 510 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4401  histidine kinase  27.7 
 
 		 447 aa  67  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  24.02 
 
 		 347 aa  67  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 		 640 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4313  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.86 
 
 		 965 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0143  Signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 458 aa  67  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>