176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1777 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  100 
 
 		 392 aa  806    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1322  galactokinase  69.11 
 
 		 396 aa  534  1e-151  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  59.44 
 
 		 392 aa  490  1e-137  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  52.6 
 
 		 385 aa  402  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  52.91 
 
 		 387 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  52.65 
 
 		 387 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1371  galactokinase  54.34 
 
 		 388 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2244  galactokinase  57.14 
 
 		 399 aa  394  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1069  galactokinase  54.17 
 
 		 396 aa  386  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  54.4 
 
 		 389 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  53.33 
 
 		 390 aa  379  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  50.65 
 
 		 386 aa  380  1e-104  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  51.16 
 
 		 394 aa  371  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  47.46 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  48.21 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  47.79 
 
 		 396 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  48.66 
 
 		 394 aa  356  5e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  45.2 
 
 		 389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  47.84 
 
 		 387 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  43.78 
 
 		 383 aa  331  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  45.65 
 
 		 399 aa  320  1.9999999999999998e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  42.6 
 
 		 386 aa  300  2e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  38.16 
 
 		 405 aa  292  6e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  40.9 
 
 		 397 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  37.69 
 
 		 398 aa  269  5.9999999999999995e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  38.6 
 
 		 389 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  38.15 
 
 		 403 aa  260  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  37.73 
 
 		 395 aa  253  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  36.25 
 
 		 391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  37.57 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  36.34 
 
 		 386 aa  250  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  37.83 
 
 		 404 aa  249  4e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  37.18 
 
 		 389 aa  249  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  35.9 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  35.06 
 
 		 382 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  35.06 
 
 		 382 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  35.06 
 
 		 382 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  34.55 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  34.55 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  35.66 
 
 		 405 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  34.62 
 
 		 372 aa  246  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  35.77 
 
 		 391 aa  245  9e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  37.67 
 
 		 350 aa  239  4e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  37.67 
 
 		 350 aa  239  4e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  34.82 
 
 		 383 aa  239  8e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  35.42 
 
 		 382 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  36.25 
 
 		 386 aa  236  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  34.12 
 
 		 382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  37.57 
 
 		 385 aa  233  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  33.68 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  33.68 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  33.68 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  33.68 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  33.86 
 
 		 382 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  34.74 
 
 		 393 aa  232  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  33.42 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  34.86 
 
 		 409 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  34.53 
 
 		 379 aa  229  8e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  34.52 
 
 		 385 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  34.77 
 
 		 414 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  35.79 
 
 		 387 aa  228  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  36.46 
 
 		 359 aa  227  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  35.08 
 
 		 383 aa  224  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  37.33 
 
 		 355 aa  223  3e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  35.42 
 
 		 383 aa  224  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  35.08 
 
 		 387 aa  224  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  36.36 
 
 		 384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  35.85 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  35.85 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  35.85 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  36.34 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  36.04 
 
 		 380 aa  217  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  33.76 
 
 		 389 aa  216  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  35.66 
 
 		 387 aa  216  7e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  33.15 
 
 		 358 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  33.62 
 
 		 400 aa  211  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  33.9 
 
 		 349 aa  212  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  38.76 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  30.88 
 
 		 394 aa  210  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  35.12 
 
 		 387 aa  210  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2677  cyclic nucleotide-binding protein  34.53 
 
 		 393 aa  209  5e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106497  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  36.99 
 
 		 376 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  32.05 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  34.93 
 
 		 351 aa  206  5e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  32.47 
 
 		 388 aa  205  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  31.41 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  30.67 
 
 		 388 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  34.12 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  33.69 
 
 		 348 aa  201  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  32.43 
 
 		 356 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2211  galactokinase  34.12 
 
 		 414 aa  199  5e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.173587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  31.35 
 
 		 384 aa  199  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  33.42 
 
 		 357 aa  199  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  31.15 
 
 		 385 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0973  galactokinase  34.04 
 
 		 416 aa  196  6e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  31.98 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  30.18 
 
 		 412 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3973  galactokinase  34.72 
 
 		 408 aa  192  7e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.340727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4056  galactokinase  32.33 
 
 		 403 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37616  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  34.34 
 
 		 373 aa  189  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>