More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1775 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1775  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 330 aa  686    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0302  LacI family transcription regulator  45.18 
 
 		 333 aa  315  8e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.323775  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1372  galactose operon repressor  42.73 
 
 		 331 aa  276  3e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2079  transcriptional regulator, LacI family  37.84 
 
 		 341 aa  238  8e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0539  transcriptional regulator, LacI family  38.25 
 
 		 340 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1547  LacI family transcription regulator  34.52 
 
 		 337 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0111532  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1340  LacI family transcription regulator  34.52 
 
 		 337 aa  211  9e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000460933  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02944  DNA-binding transcriptional repressor  33.84 
 
 		 327 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0626  transcriptional regulator, LacI family  33.84 
 
 		 327 aa  199  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02894  hypothetical protein  33.84 
 
 		 327 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0714  transcriptional regulator, LacI family  31.9 
 
 		 334 aa  198  7.999999999999999e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3542  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  33.84 
 
 		 327 aa  198  9e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0625  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  33.53 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3257  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  33.53 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4389  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  33.53 
 
 		 327 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3369  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  33.53 
 
 		 327 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002659  beta-D-galactosidase transcriptional repressor  32.53 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.443693  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1972  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  32.32 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0103522 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03334  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  32.23 
 
 		 328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1063  LacI family transcription regulator  32.23 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4137  regulatory protein LacI  31.27 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0793  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 		 340 aa  156  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.137474  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0977  transcriptional regulator, LacI family  29.54 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1323  transcription regulator of beta-galactosidase gene  25.98 
 
 		 333 aa  143  5e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0741  transcriptional regulator, LacI family  28.31 
 
 		 343 aa  142  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1949  LacR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.721622  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  30.12 
 
 		 337 aa  135  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1087  LacI family transcription regulator  25.9 
 
 		 339 aa  135  8e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.42902  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  27.86 
 
 		 341 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  28.82 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  26.84 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1454  LacI family transcription regulator  27.66 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0012728  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  27.19 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  26.88 
 
 		 336 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0909  LacI family transcription regulator  27.47 
 
 		 339 aa  119  9e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000295634  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1069  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  28.4 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.209088 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  28.08 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  26.44 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  26.1 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0892  LacI family transcription regulator  27.67 
 
 		 346 aa  116  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00803151  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0588  LacI family transcription regulator  28.11 
 
 		 328 aa  116  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.979882  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  25.44 
 
 		 328 aa  116  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0527  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  28.11 
 
 		 328 aa  116  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  27.57 
 
 		 335 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2456  LacI family transcription regulator  28.29 
 
 		 352 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0081  transcriptional regulator, LacI family  27.58 
 
 		 327 aa  112  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  28.37 
 
 		 351 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1019  LacI family transcription regulator  25 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  26.89 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0226  LacI family transcription regulator  24.93 
 
 		 336 aa  110  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1063  LacI family transcription regulator  25.74 
 
 		 325 aa  109  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0292  transcriptional regulator, LacI family  25.97 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0509  transcriptional regulator, LacI family  27.51 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000057395  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0568  LacI family transcription regulator  24.86 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000865309  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  27.22 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2503  transcriptional regulator  27.61 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117668  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  25.29 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  26.45 
 
 		 355 aa  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1333  transcriptional regulator, LacI family  27.38 
 
 		 347 aa  106  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00834702  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  24.27 
 
 		 361 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  25.51 
 
 		 340 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0881  LacI family transcription regulator  28.3 
 
 		 335 aa  106  7e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000659595  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  26.63 
 
 		 339 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0466  transcriptional regulator, LacI family  28.07 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1882  LacI family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.711539 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  24.63 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  26.32 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  25.66 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  25.44 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  26.16 
 
 		 338 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5756  transcriptional regulator, LacI family  25.64 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.35 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.82 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29490  transcriptional regulator  28.45 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  25.5 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  25.07 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  24.93 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  25.36 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  26.79 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  25.15 
 
 		 338 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  28.19 
 
 		 339 aa  102  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  26.67 
 
 		 326 aa  102  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2606  transcriptional regulator  27.12 
 
 		 348 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  25.36 
 
 		 341 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  24.93 
 
 		 331 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  26.33 
 
 		 368 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2029  transcriptional regulator, LacI family  24.57 
 
 		 343 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  25.51 
 
 		 340 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  25.44 
 
 		 338 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  25.87 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  24.21 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2238  transcriptional regulator, LacI family  27.41 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0129  transcriptional regulator, LacI family  26.02 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1005  transcriptional regulator, LacI family  25.58 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.33 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01670  transcriptional regulator  26.16 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  23.91 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  27.62 
 
 		 347 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3351  LacI family transcription regulator  27.25 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  decreased coverage  0.0034898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>