More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1752 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1752  major intrinsic protein  100 
 
 		 235 aa  464  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0947  MIP family channel protein  51.53 
 
 		 273 aa  222  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000138868  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2149  MIP family channel protein  49.15 
 
 		 272 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  48.23 
 
 		 275 aa  211  7e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1065  glycerol uptake facilitator protein  50.22 
 
 		 273 aa  210  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000246889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4234  glycerol uptake facilitator protein  50.22 
 
 		 273 aa  210  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000125591  decreased coverage  0.000000000395439 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0806  MIP family channel protein  50.22 
 
 		 273 aa  209  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000186398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1124  glycerol uptake facilitator protein  50.22 
 
 		 273 aa  209  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0946  glycerol uptake facilitator protein  50.22 
 
 		 278 aa  209  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.82294e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0937  glycerol uptake facilitator protein  50.22 
 
 		 278 aa  209  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000181424  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1194  glycerol uptake facilitator protein  50.22 
 
 		 273 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000435303  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2846  MIP family channel protein  47.46 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1105  glycerol uptake facilitator protein  49.78 
 
 		 273 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5867199999999997e-51 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5936  major intrinsic protein  48.91 
 
 		 241 aa  207  8e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1025  glycerol uptake facilitator protein  50.22 
 
 		 273 aa  207  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000147152  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0959  glycerol uptake facilitator protein  50.22 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000387378  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1653  glycerol uptake facilitator protein  46.12 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3650  MIP family channel protein  43.57 
 
 		 250 aa  198  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1358  MIP family channel protein  47.39 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00322648  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1384  MIP family channel protein  47.39 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000466  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2043  MIP family channel protein  46.28 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1487  glycerol uptake facilitator  46.7 
 
 		 242 aa  195  7e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00172082  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0275  glycerol uptake facilitator protein  44 
 
 		 232 aa  192  5e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1065  MIP family channel protein  44.31 
 
 		 247 aa  192  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1170  putative glycerol uptake facilitator protein  46.49 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1001  glycerol uptake facilitator protein  46.49 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.379218  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0866  glycerol uptake facilitator protein  45.22 
 
 		 274 aa  188  5.999999999999999e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.306502  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2878  glycerol uptake facilitator protein  44.02 
 
 		 235 aa  187  9e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2561  glycerol uptake facilitator glpF  43.16 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1918  MIP family channel protein  45.2 
 
 		 255 aa  184  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.157288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1019  MIP family channel protein  44.92 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2513  MIP family channel protein  41.09 
 
 		 255 aa  177  8e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23040  MIP family channel protein  41.81 
 
 		 240 aa  178  8e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1557  major intrinsic protein  42.8 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0486  major intrinsic protein  42.08 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3541  major intrinsic protein  45.13 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1765  MIP family channel protein  45.58 
 
 		 244 aa  175  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.459656 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0075  major intrinsic protein  42.61 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0637  major intrinsic protein, glycerol uptake channel  42.74 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2177  major intrinsic protein  42.92 
 
 		 243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2249  major intrinsic protein  40.68 
 
 		 249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000222007  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5300  major intrinsic protein  44.39 
 
 		 249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29930  permease, glycerol uptake facilitator  42.42 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3322  MIP family channel protein  42.31 
 
 		 237 aa  170  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218114 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0294  MIP family channel protein  43.91 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000803178  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1986  major intrinsic protein  40.26 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000584519 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4188  MIP family channel protein  42.08 
 
 		 243 aa  168  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2383  major intrinsic protein  41.3 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0598  glycerol uptake facilitator protein  42.31 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0373  major intrinsic protein  44.21 
 
 		 250 aa  165  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421217  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5041  major intrinsic protein  39.83 
 
 		 240 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0239  glycerol uptake facilitator protein  42.31 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0905  glycerol uptake facilitator protein  42.31 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0724  glycerol uptake facilitator protein  42.31 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.122714  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2451  glycerol uptake facilitator protein  42.31 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0738  glycerol uptake facilitator protein  42.31 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2707  glycerol uptake facilitator protein  42.31 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2370  glycerol uptake facilitator protein  42.31 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.925384  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0618  MIP family channel protein  42.41 
 
 		 238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0379  MIP family channel protein  41.74 
 
 		 242 aa  162  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.995202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0255  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  41.23 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2708  MIP family channel protein  42.08 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2068  MIP family channel protein  42.08 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104324  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0349  glycerol uptake facilitator or related permease (major Intrinsic protein family)  40.17 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000402346  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2679  MIP family channel protein  42.08 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824387  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2604  MIP family channel protein  42.08 
 
 		 238 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6007  Aquaporin  42.08 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264936  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2732  MIP family channel protein  42.08 
 
 		 238 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3290  major intrinsic protein  38.17 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.881341  normal  0.0169929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6410  major intrinsic protein  40.6 
 
 		 246 aa  154  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4219  major intrinsic protein  37.87 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.673856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0086  glycerol facilitator-aquaporin  39.06 
 
 		 243 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385513 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0390  major intrinsic protein  39.84 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.143775  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06810  permease, glycerol uptake facilitator  41.59 
 
 		 245 aa  151  7e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1213  glycerol uptake facilitator  40 
 
 		 244 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0217  glycerol uptake facilitator protein  38.19 
 
 		 259 aa  145  6e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0726  major intrinsic protein  38.16 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000820267 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0559  major intrinsic protein  39.74 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202801 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0480  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  38.66 
 
 		 289 aa  142  5e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000262851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2986  MIP family channel protein  36.13 
 
 		 268 aa  138  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.862108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0878  major intrinsic protein  38.97 
 
 		 244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1246  MIP family channel protein  37.61 
 
 		 246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0409  glycerol uptake facilitator protein  39.06 
 
 		 251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0875  MIP family channel protein  37.01 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1732  glycerol uptake facilitator protein, putative  34.81 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0128526  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0810  major intrinsic protein  35.59 
 
 		 252 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.199879 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1732  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  33.57 
 
 		 287 aa  126  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000479183  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0245  glycerol uptake facilitator  37.67 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1007  MIP family channel protein  36.89 
 
 		 281 aa  126  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0697124  decreased coverage  0.00139101 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0101  glycerol uptake facilitator protein  39.17 
 
 		 282 aa  125  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0102  glycerol uptake facilitator protein  39.17 
 
 		 282 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4112  MIP family channel protein  39.17 
 
 		 282 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0253  major intrinsic protein  35.59 
 
 		 251 aa  125  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.740215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7483  MIP family channel protein  36.25 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0175  MIP family channel protein  37.92 
 
 		 279 aa  122  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03312  hypothetical protein  37.29 
 
 		 284 aa  122  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2523  MIP family channel protein  33.76 
 
 		 274 aa  122  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1632  glycerol uptake facilitator or related permease (major Intrinsic protein family)  34.56 
 
 		 287 aa  122  6e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000451911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0160  MIP family channel protein  37.5 
 
 		 279 aa  122  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0206  MIP family channel protein  37.2 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>