More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1723 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1723  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  100 
 
 
362 aa  746    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  37.54 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  34.73 
 
 
364 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  36.69 
 
 
354 aa  232  8.000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  34.45 
 
 
364 aa  232  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  34.45 
 
 
364 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  34.73 
 
 
364 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  34.17 
 
 
364 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  32.96 
 
 
364 aa  222  8e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.32 
 
 
399 aa  216  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  30.47 
 
 
358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  30.19 
 
 
358 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.04 
 
 
370 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.65 
 
 
379 aa  209  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  33.61 
 
 
357 aa  208  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.7 
 
 
366 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.75 
 
 
360 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.61 
 
 
357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  32.48 
 
 
361 aa  195  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  31.49 
 
 
375 aa  193  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.68 
 
 
351 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.3 
 
 
358 aa  192  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  31.94 
 
 
852 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1611  threonine-phosphate decarboxylase  33.15 
 
 
368 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.238586  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.18 
 
 
361 aa  189  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.21 
 
 
352 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  33.15 
 
 
356 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  32.88 
 
 
864 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1737  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.86 
 
 
362 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0451969 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  33.62 
 
 
363 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  31.94 
 
 
863 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33.15 
 
 
360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  29.04 
 
 
366 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.15 
 
 
362 aa  172  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02741  aminotransferases class-I  31.97 
 
 
360 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  29.27 
 
 
371 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02181  aminotransferases class-I  30.71 
 
 
374 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.47 
 
 
496 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  29.41 
 
 
863 aa  166  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0317  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.97 
 
 
364 aa  165  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02161  aminotransferases class-I  29.22 
 
 
373 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1766  threonine-phosphate decarboxylase  30.56 
 
 
367 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0200  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  30.35 
 
 
374 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  29.86 
 
 
362 aa  157  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2490  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.69 
 
 
362 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2148  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.62 
 
 
357 aa  155  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.73 
 
 
498 aa  151  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1309  aminotransferase class I and II  29.09 
 
 
378 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000234222  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1268  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.28 
 
 
364 aa  149  6e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  26.26 
 
 
371 aa  147  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1515  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.62 
 
 
361 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2464  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.84 
 
 
357 aa  146  5e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.275573 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1585  class I/II aminotransferase  29.78 
 
 
359 aa  145  9e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0554  aminotransferase class I and II  27.61 
 
 
357 aa  143  5e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.06 
 
 
498 aa  142  7e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  27.35 
 
 
858 aa  142  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  30.47 
 
 
368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  27.41 
 
 
383 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  29.88 
 
 
368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  29.88 
 
 
368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1118  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  30.19 
 
 
366 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21150  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  26.7 
 
 
350 aa  138  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02271  aminotransferases class-I  28.61 
 
 
361 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645989  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  24.02 
 
 
371 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.24 
 
 
366 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  24.3 
 
 
371 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27901  aminotransferases class-I  26.72 
 
 
360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2687  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  28.96 
 
 
352 aa  133  3.9999999999999996e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.243018  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  24.02 
 
 
371 aa  133  6e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  28.4 
 
 
368 aa  133  6e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0512  aminotransferase class I and II  27.91 
 
 
346 aa  132  6.999999999999999e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.749213  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1067  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.29 
 
 
359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.748471  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  23.89 
 
 
371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5370  aminotransferase class I and II  29.88 
 
 
340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0420  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.65 
 
 
356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0576  aminotransferase, class I and II  27.82 
 
 
357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1139  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.04 
 
 
348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.122292 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1011  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.14 
 
 
372 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0141  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.37 
 
 
352 aa  124  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1265  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.45 
 
 
360 aa  123  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4468  aminotransferase class I and II  27.01 
 
 
342 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.517965  normal  0.0670224 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.4 
 
 
332 aa  123  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  25.56 
 
 
346 aa  122  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  26.76 
 
 
371 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1260  aminotransferase class I and II  28.97 
 
 
365 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2151  aminotransferase class I and II  27.53 
 
 
349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.518477  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  27.41 
 
 
370 aa  116  6e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  27.6 
 
 
351 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1231  aminotransferase class I and II  26.18 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0367  histidinol-phosphate aminotransferase  24.58 
 
 
355 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  25.36 
 
 
630 aa  113  5e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0633  aminotransferase class I and II  26.87 
 
 
354 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.468003 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.56 
 
 
356 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  25.58 
 
 
360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0607  histidinol-phosphate aminotransferase  24.3 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  28.57 
 
 
355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1406  aminotransferase, class I and II  28.19 
 
 
332 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000645732  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  25.95 
 
 
364 aa  109  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1426  aminotransferase class I and II  31.93 
 
 
326 aa  109  7.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  25.66 
 
 
358 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>