More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1716 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 		 253 aa  517  1e-146  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  65.18 
 
 		 257 aa  342  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  65.18 
 
 		 257 aa  342  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  65.18 
 
 		 257 aa  341  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  65.18 
 
 		 257 aa  341  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  64.37 
 
 		 257 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.42 
 
 		 251 aa  287  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.39 
 
 		 251 aa  287  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.97 
 
 		 253 aa  274  9e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.59 
 
 		 252 aa  270  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.44 
 
 		 261 aa  266  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.63 
 
 		 254 aa  266  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  51 
 
 		 867 aa  265  5e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.22 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.22 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.19 
 
 		 249 aa  261  4.999999999999999e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.79 
 
 		 254 aa  261  1e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.06 
 
 		 251 aa  260  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.15 
 
 		 258 aa  260  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.65 
 
 		 251 aa  259  4e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.81 
 
 		 254 aa  257  1e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.39 
 
 		 248 aa  255  5e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  51 
 
 		 248 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.39 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.19 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.57 
 
 		 254 aa  249  4e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.8 
 
 		 264 aa  245  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.8 
 
 		 258 aa  246  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.4 
 
 		 259 aa  241  9e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.79 
 
 		 244 aa  240  2e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.8 
 
 		 261 aa  238  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.8 
 
 		 261 aa  236  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  47.58 
 
 		 257 aa  235  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.15 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.49 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.97 
 
 		 610 aa  231  7.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.18 
 
 		 252 aa  231  9e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.56 
 
 		 255 aa  227  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  46 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.06 
 
 		 250 aa  226  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.8 
 
 		 626 aa  224  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.6 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  44.76 
 
 		 271 aa  218  6e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.46 
 
 		 253 aa  218  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7180  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.4 
 
 		 252 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987588  normal  0.0970048 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2358  precorrin-4 C11-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  46.03 
 
 		 243 aa  217  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.64 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.14 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.19 
 
 		 272 aa  215  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.49 
 
 		 271 aa  215  7e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.06 
 
 		 261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6035  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.5 
 
 		 275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1314  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.52 
 
 		 268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144548  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1521  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.22 
 
 		 261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000101409 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.55 
 
 		 262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.62 
 
 		 253 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0301  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.22 
 
 		 260 aa  209  2e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0342995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.15 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3737  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.31 
 
 		 275 aa  209  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.53 
 
 		 626 aa  209  4e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6025  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.2 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0102106  normal  0.375652 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1078  hypothetical protein  48.32 
 
 		 237 aa  209  5e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.87 
 
 		 269 aa  208  6e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2446  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.44 
 
 		 261 aa  207  9e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130726  normal  0.124304 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0114  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.61 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177043  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  42.68 
 
 		 614 aa  207  1e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3154  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.57 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134288  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0510  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.23 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0808  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.78 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2157  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.37 
 
 		 280 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107141  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1229  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.6 
 
 		 264 aa  205  5e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0594011 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3515  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.74 
 
 		 257 aa  205  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.312418 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2501  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.03 
 
 		 251 aa  205  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.218572 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1475  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.57 
 
 		 260 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.8 
 
 		 598 aa  205  7e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2812  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.6 
 
 		 266 aa  204  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.51 
 
 		 249 aa  204  9e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1721  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  45.42 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2300  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.96 
 
 		 273 aa  203  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366203  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2821  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.17 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  43.32 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2484  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.7 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1525  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.57 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  43.72 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2529  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.7 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.527305 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.95 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3260  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.34 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2521  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.7 
 
 		 250 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0627  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-4 C11-methyltransferase  45.19 
 
 		 242 aa  202  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2923  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.43 
 
 		 264 aa  202  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.680231  normal  0.0185874 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.37 
 
 		 259 aa  201  8e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.54 
 
 		 243 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.7 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12107  precorrin-4 C11-methyltransferase cobM  43.93 
 
 		 251 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.182153  normal  0.885771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  42 
 
 		 250 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4243  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.31 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0806  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  42.52 
 
 		 273 aa  199  3e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.11 
 
 		 250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.65 
 
 		 257 aa  199  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5844  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.77 
 
 		 292 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>