More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1679 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  51.48 
 
 		 888 aa  691    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1823  small GTP-binding protein  50.86 
 
 		 885 aa  686    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.624036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2220  small GTP-binding protein  50.08 
 
 		 882 aa  671    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1679  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  100 
 
 		 642 aa  1326    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0030  translation elongation factor (GTPase)  55.92 
 
 		 640 aa  770    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1053  small GTP-binding protein  51.41 
 
 		 880 aa  699    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.902008  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1042  translation elongation factor G, putative  40.95 
 
 		 646 aa  502  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000207187  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1233  putative tetracycline resistance protein  40.03 
 
 		 646 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.139219  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0089  translation elongation factor  55.72 
 
 		 751 aa  394  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0048  tetO  30.81 
 
 		 639 aa  260  5.0000000000000005e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.333118  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3046  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  28.82 
 
 		 647 aa  256  9e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3033  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  28.97 
 
 		 647 aa  254  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2204  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  28.62 
 
 		 647 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.335897  hitchhiker  0.000000000000106418 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3077  tetracycline resistance protein  28.82 
 
 		 647 aa  252  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.306394  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0923  tetracycline resistance protein  30.98 
 
 		 639 aa  251  4e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2763  tetracycline resistance protein  29.33 
 
 		 647 aa  251  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3072  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  28.19 
 
 		 647 aa  249  9e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2829  small GTP-binding protein  29.92 
 
 		 647 aa  249  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328333  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2800  tetracycline resistance protein  29.17 
 
 		 647 aa  247  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2828  tetracycline resistance protein  28.5 
 
 		 647 aa  246  8e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3042  tetracycline resistance protein  28.5 
 
 		 647 aa  246  8e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  27.84 
 
 		 691 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  26.99 
 
 		 698 aa  239  2e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  27.84 
 
 		 691 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  26.69 
 
 		 691 aa  238  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1905  elongation factor G  27.47 
 
 		 691 aa  237  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224995  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  26.69 
 
 		 691 aa  236  7e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  27.54 
 
 		 691 aa  235  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  26.69 
 
 		 691 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2069  small GTP-binding protein  28.15 
 
 		 656 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.532976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0356  elongation factor G  27.62 
 
 		 691 aa  232  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  26.53 
 
 		 691 aa  229  1e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  26.94 
 
 		 692 aa  228  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  26.74 
 
 		 692 aa  228  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23631  elongation factor G  26.98 
 
 		 691 aa  227  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.221598 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1214  translation elongation and release factor (GTPase)  26.75 
 
 		 673 aa  227  6e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000546094  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  25.93 
 
 		 692 aa  226  1e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  26.68 
 
 		 691 aa  226  1e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  26.68 
 
 		 691 aa  226  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  26.68 
 
 		 691 aa  226  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  26.35 
 
 		 691 aa  226  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  27.72 
 
 		 692 aa  226  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0579  elongation factor G  27.01 
 
 		 698 aa  225  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  26.59 
 
 		 689 aa  225  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6052  elongation factor G  26.82 
 
 		 698 aa  224  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  26.35 
 
 		 691 aa  224  4e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  26.54 
 
 		 691 aa  224  4e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3923  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  26.22 
 
 		 703 aa  224  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  26.38 
 
 		 692 aa  224  4.9999999999999996e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  27 
 
 		 691 aa  223  6e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  26.38 
 
 		 691 aa  222  9.999999999999999e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0803  elongation factor G  26.45 
 
 		 692 aa  223  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.468644  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2159  elongation factor G  26.74 
 
 		 691 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2437  elongation factor G  26.74 
 
 		 691 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.318497 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  26.57 
 
 		 694 aa  222  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0357  elongation factor G  28.2 
 
 		 698 aa  222  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.931415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  26.96 
 
 		 692 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16321  elongation factor G  25.99 
 
 		 691 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3438  translation elongation factor G  26.63 
 
 		 697 aa  221  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000152425  hitchhiker  0.000196406 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1044  translation elongation factor G  27.27 
 
 		 706 aa  221  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000201593  hitchhiker  0.00441639 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0189  elongation factor G  25.65 
 
 		 703 aa  220  5e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  25.11 
 
 		 690 aa  220  6e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  26.47 
 
 		 697 aa  219  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0084  translation elongation factor G  25.52 
 
 		 692 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2215  elongation factor G  26.74 
 
 		 691 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4510  translation elongation factor G  26.63 
 
 		 699 aa  219  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1014  elongation factor G  25.98 
 
 		 701 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.203543 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  26.17 
 
 		 697 aa  219  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0559  translation elongation factor G  26.81 
 
 		 700 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.347154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  26.17 
 
 		 697 aa  219  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0986  elongation factor G  25.98 
 
 		 701 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.798274  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  26.46 
 
 		 695 aa  218  2e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16891  elongation factor G  26.25 
 
 		 691 aa  219  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.900412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  25.91 
 
 		 689 aa  219  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  25.55 
 
 		 692 aa  219  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1004  elongation factor G  25.98 
 
 		 701 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  26.56 
 
 		 691 aa  218  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6617  translation elongation factor G  26.06 
 
 		 700 aa  217  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2336  translation elongation and release factor (GTPase)  24.96 
 
 		 694 aa  218  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109511  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20910  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  27 
 
 		 702 aa  217  5e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.357835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  25.53 
 
 		 691 aa  217  5e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2409  elongation factor G  27.87 
 
 		 696 aa  216  7e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000720128  hitchhiker  0.00000820155 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  26.02 
 
 		 697 aa  216  8e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2172  translation elongation factor G  26.05 
 
 		 698 aa  216  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.063609  normal  0.792928 
 
 
-
 
NC_002978  WD0016  elongation factor G  26.06 
 
 		 691 aa  216  9.999999999999999e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  26.5 
 
 		 692 aa  216  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1281  elongation factor G  25.4 
 
 		 700 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2733  translation elongation factor G  26.68 
 
 		 691 aa  216  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167208 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  27.62 
 
 		 691 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  26.55 
 
 		 692 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  26.47 
 
 		 704 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  26.64 
 
 		 691 aa  216  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  25.11 
 
 		 698 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3467  translation elongation factor G  26.5 
 
 		 701 aa  215  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0283568  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1676  elongation factor G  27.62 
 
 		 691 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377788  hitchhiker  0.000311159 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2120  elongation factor G  26.16 
 
 		 691 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.584312  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  26.95 
 
 		 700 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  25.85 
 
 		 692 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1075  elongation factor G  27.13 
 
 		 691 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0684  translation elongation factor G  25.76 
 
 		 700 aa  215  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.864327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>