168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1667 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1667  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  100 
 
 
283 aa  595  1e-169  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.195418  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1375  alpha/beta fold family hydrolase  57.09 
 
 
314 aa  369  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000598397 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0108  hypothetical protein  49.29 
 
 
308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000248564  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0491  alpha/beta fold family hydrolase  45.35 
 
 
309 aa  250  2e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000476721  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0208  alpha/beta fold family hydrolase  43.97 
 
 
313 aa  247  2e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3228  hypothetical protein  43.33 
 
 
320 aa  238  8e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2579  hypothetical protein  43.58 
 
 
345 aa  229  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.121751  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1527  alpha/beta fold family hydrolase  44.31 
 
 
307 aa  227  1e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0109  alpha/beta fold family hydrolase  42.58 
 
 
311 aa  215  8e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000692138  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  40.53 
 
 
319 aa  202  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1668  alpha/beta fold family hydrolase  42.74 
 
 
317 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0139798  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  39.38 
 
 
319 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  39.21 
 
 
300 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0993  hypothetical protein  40.34 
 
 
337 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  39.65 
 
 
319 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0251  putative alpha/beta hydrolase  39.65 
 
 
319 aa  191  8e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  40.34 
 
 
337 aa  191  9e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0300  alpha/beta hydrolase  38.77 
 
 
319 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0588  putative alpha/beta superfamily hydrolase  34.1 
 
 
345 aa  150  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.123084  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4216  hypothetical protein  31.64 
 
 
308 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2612  hypothetical protein  33.08 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0809624  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2298  hypothetical protein  32.7 
 
 
313 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2805  alpha/beta hydrolase  30.86 
 
 
307 aa  132  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.793976  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3938  hypothetical protein  30.47 
 
 
307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1021  hypothetical protein  30.47 
 
 
307 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4239  hypothetical protein  30.47 
 
 
307 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4015  hypothetical protein  30.47 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3848  alpha/beta hydrolase  30.47 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3862  alpha/beta hydrolase  30.47 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4328  hypothetical protein  30.47 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4130  hypothetical protein  30.47 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1306  hypothetical protein  30.63 
 
 
306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0753003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4175  hypothetical protein  30.08 
 
 
307 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0215  hydrolase of the alpha/beta superfamily  29.92 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000127658  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.35 
 
 
314 aa  102  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2062  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.12 
 
 
314 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543903  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.27 
 
 
315 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  26.8 
 
 
305 aa  96.7  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4715  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  28.24 
 
 
306 aa  95.9  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.45 
 
 
280 aa  92  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  26.2 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.48 
 
 
302 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  27.63 
 
 
313 aa  85.9  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  27.52 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  27.05 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  25.69 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0915  Lysophospholipase-like protein  29.36 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.452127  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  25.65 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.78 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5445  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.89 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  26.51 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0072  hypothetical protein  27.65 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000140127  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  25.43 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl606  putative hydrolase  26.09 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  25 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1999  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  23.83 
 
 
424 aa  68.9  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0236781  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4068  hypothetical protein  25.44 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86962  normal  0.017048 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0384  hypothetical protein  23.86 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0739  hypothetical protein  28.86 
 
 
382 aa  65.1  0.000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  27.23 
 
 
305 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl315  lysophospholipase  24.67 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.71518e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0385  hypothetical protein  26.32 
 
 
256 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0740137  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  23.41 
 
 
294 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  24.5 
 
 
294 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  27.83 
 
 
285 aa  62.4  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  23.42 
 
 
284 aa  61.6  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl390  hydrolase  24.19 
 
 
324 aa  60.5  0.00000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0649986  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  24.27 
 
 
278 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  24.16 
 
 
284 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  25.21 
 
 
282 aa  59.3  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  22.88 
 
 
293 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0392  hypothetical protein  24.19 
 
 
329 aa  58.2  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.280774  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  24.24 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  22.88 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  23.79 
 
 
284 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  23.79 
 
 
284 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  22.88 
 
 
293 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  22.88 
 
 
284 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  25.66 
 
 
283 aa  58.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  24.16 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  26.2 
 
 
292 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  23.55 
 
 
296 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0822  hypothetical protein  22.15 
 
 
376 aa  56.6  0.0000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  23.17 
 
 
287 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  23.79 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  25.45 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  23.98 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0317  alpha/beta hydrolase fold protein  24.47 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  22.46 
 
 
307 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  26.7 
 
 
282 aa  53.9  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09450  hypothetical protein  23.73 
 
 
348 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.513646  normal  0.860642 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1498  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
372 aa  53.9  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.219289  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0659  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  29.87 
 
 
388 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  22.62 
 
 
314 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  31.13 
 
 
876 aa  52.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  22.1 
 
 
307 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  24.24 
 
 
282 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  28.29 
 
 
301 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  28.57 
 
 
301 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0869  esterase/lipase-like protein  25 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>