More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1648 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1648  proline-specific peptidase  100 
 
 		 303 aa  629  1e-179  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0052  prolyl aminopeptidase  86.38 
 
 		 304 aa  543  1e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.946601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0576  tricorn interacting factor F1  46 
 
 		 303 aa  272  6e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0241  alpha/beta fold family hydrolase  37.84 
 
 		 292 aa  218  1e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1849  prolyl aminopeptidase  39.33 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000467937  hitchhiker  0.000191217 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2163  proline-specific peptidase  39.14 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1064  tricorn interacting factor F1  39.4 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2662  proline-specific peptidase  37.1 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000838232  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1984  proline-specific peptidase  32.47 
 
 		 339 aa  168  9e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3362  proline-specific peptidase  33.33 
 
 		 346 aa  162  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.158182 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  33.45 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3901  proline-specific peptidase  34.56 
 
 		 369 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0490645 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  33.1 
 
 		 296 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0261  proline-specific peptidase  33.76 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0035  proline-specific peptidase  33.56 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0847997  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  33.77 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  30.85 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.094773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  29.47 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2685  proline-specific peptidase  31.62 
 
 		 296 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.492833  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24200  proline-specific peptidase  31.54 
 
 		 316 aa  122  8e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2123  Prolyl aminopeptidase  28.82 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  29.5 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4540  proline iminopeptidase, putative  30.41 
 
 		 316 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11350  proline-specific peptidase  30.31 
 
 		 295 aa  119  7e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4217  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  32.78 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02210  proline imino-peptidase  29.92 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  27.78 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6377  proline-specific peptidase  28.62 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6197  proline-specific peptidase  27.34 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.941686 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10858  proline iminopeptidase pip  26.67 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000563068 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  27.43 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0830  proline-specific peptidase  26.6 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.269781  unclonable  0.00000881628 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21290  proline-specific peptidase  27.8 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16440  proline-specific peptidase  27.7 
 
 		 298 aa  102  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.700734 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2180  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  27.94 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5407  proline-specific peptidase  25.42 
 
 		 287 aa  89.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 283 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1477  proline iminopeptidase like protein  25.89 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140845 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  25.09 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  24.28 
 
 		 278 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  24.32 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  25.17 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  22.3 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  23.15 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  22.67 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  23.23 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  21.78 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5122  alpha/beta hydrolase fold protein  32.84 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  22.26 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  20.51 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  23.1 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  21.92 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  20.55 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  22.61 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  21.81 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  22.46 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  22.58 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1744  alpha/beta hydrolase fold protein  24.44 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0831035  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  22.56 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  22.06 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  23.16 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  22.58 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3216  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  24.64 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  21.82 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  22.18 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0781  abhydrolase  35.8 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  22.1 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  21.65 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  22.42 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  22.58 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  22.07 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  22.58 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.23 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  22.58 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  23.74 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4878  alpha/beta hydrolase fold  23.71 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  19.81 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  25.46 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  20.21 
 
 		 267 aa  57  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  22.94 
 
 		 281 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  20.79 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.36 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  21.16 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  23.25 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  22.46 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  21.95 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>