More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1641 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1641  major facilitator transporter  100 
 
 
434 aa  862    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119358  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1884  D-xylose proton-symporter  64.57 
 
 
447 aa  570  1e-161  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.326848  hitchhiker  0.0000000000014456 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  35.85 
 
 
439 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  32.95 
 
 
453 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 
460 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  31.25 
 
 
446 aa  209  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  30.68 
 
 
441 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  32.79 
 
 
452 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  32.62 
 
 
457 aa  199  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  32.55 
 
 
452 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  32.55 
 
 
452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  29.53 
 
 
445 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  30.8 
 
 
442 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  31.15 
 
 
464 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  28.54 
 
 
438 aa  182  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  28.21 
 
 
452 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  28.44 
 
 
443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  28.44 
 
 
443 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.454742 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  28.44 
 
 
443 aa  172  9e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 
443 aa  172  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  28.44 
 
 
443 aa  172  9e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  28.44 
 
 
443 aa  172  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  28.44 
 
 
443 aa  172  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  28.44 
 
 
443 aa  172  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  30.45 
 
 
442 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  29.72 
 
 
443 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  27.97 
 
 
468 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  27.97 
 
 
468 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  31.79 
 
 
445 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  27.97 
 
 
468 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  27.97 
 
 
468 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  27.97 
 
 
468 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  31.32 
 
 
445 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  31.32 
 
 
445 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  31.32 
 
 
445 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000189575  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  31.32 
 
 
445 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  31.32 
 
 
445 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 
469 aa  166  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  31.32 
 
 
445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2112  metabolite transporter  27.93 
 
 
442 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0151883  normal  0.38629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  27.25 
 
 
480 aa  161  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  28.92 
 
 
457 aa  159  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  27.61 
 
 
458 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3468  General substrate transporter  27.95 
 
 
468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  25.89 
 
 
476 aa  117  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 
458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  28.22 
 
 
436 aa  110  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  28.22 
 
 
436 aa  110  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 
474 aa  110  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  24.62 
 
 
499 aa  110  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 
423 aa  109  8.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 
451 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  22.52 
 
 
471 aa  107  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  23.9 
 
 
473 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  26.07 
 
 
436 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 
465 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  23.6 
 
 
465 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0341  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 
508 aa  103  6e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  24.46 
 
 
438 aa  103  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  24.07 
 
 
473 aa  103  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 
472 aa  103  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  25.15 
 
 
526 aa  103  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  24.73 
 
 
474 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  24.27 
 
 
474 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  26.85 
 
 
475 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  26.85 
 
 
475 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  24.47 
 
 
476 aa  101  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  22.97 
 
 
438 aa  101  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  26.56 
 
 
485 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7502  major facilitator transporter  26.85 
 
 
475 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0253072  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  24.47 
 
 
474 aa  99.8  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  26.35 
 
 
475 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  25.27 
 
 
487 aa  99.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  25.82 
 
 
427 aa  99.4  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  23.29 
 
 
437 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  23 
 
 
457 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  24.45 
 
 
474 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  23.29 
 
 
447 aa  98.6  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.53 
 
 
472 aa  99  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  25 
 
 
487 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  25 
 
 
487 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 
479 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  25.52 
 
 
464 aa  96.7  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.42 
 
 
474 aa  96.7  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  24.86 
 
 
472 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 
470 aa  96.7  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 
477 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  24.8 
 
 
472 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  27.46 
 
 
468 aa  95.9  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  26.21 
 
 
487 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  25.95 
 
 
485 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 
398 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  22.67 
 
 
479 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  25.75 
 
 
458 aa  94.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  24.01 
 
 
455 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  25.75 
 
 
458 aa  94.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  23.89 
 
 
455 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  25.46 
 
 
459 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  25.12 
 
 
462 aa  93.6  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  25.47 
 
 
485 aa  93.2  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>