More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1628 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1628  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 425 aa  874    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1857  GTPase  55.16 
 
 		 433 aa  460  9.999999999999999e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.622907  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  52.13 
 
 		 419 aa  443  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  51.2 
 
 		 419 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  51.2 
 
 		 419 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  51.2 
 
 		 419 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  51.31 
 
 		 419 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  50.96 
 
 		 419 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2747  GTP-binding proten HflX  52.67 
 
 		 419 aa  436  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  50.72 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  50.72 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0155  GTPase  50.23 
 
 		 437 aa  432  1e-120  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  50.48 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  50.49 
 
 		 419 aa  429  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  52.09 
 
 		 401 aa  403  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1697  GTPase  50.24 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.83128e-22 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1093  GTP-binding proten HflX  45.48 
 
 		 438 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000358907  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  39.42 
 
 		 441 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  40.35 
 
 		 442 aa  279  7e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  40.87 
 
 		 431 aa  278  1e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  40 
 
 		 413 aa  277  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  39.16 
 
 		 502 aa  276  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  39 
 
 		 444 aa  276  5e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  40.73 
 
 		 437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.15 
 
 		 493 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  39.95 
 
 		 503 aa  275  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  38.88 
 
 		 509 aa  273  3e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  40.49 
 
 		 434 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  40.69 
 
 		 582 aa  271  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  40.87 
 
 		 434 aa  271  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  39.26 
 
 		 436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  40.05 
 
 		 482 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  41.71 
 
 		 406 aa  268  1e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1212  GTP-binding proten HflX  39.56 
 
 		 412 aa  268  1e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  39.86 
 
 		 512 aa  267  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  39.6 
 
 		 420 aa  266  4e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2384  small GTP-binding protein  38.93 
 
 		 420 aa  266  8e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.740042  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  37.3 
 
 		 433 aa  265  1e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  42.22 
 
 		 412 aa  265  1e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  38.77 
 
 		 433 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  39.71 
 
 		 501 aa  264  2e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  38.18 
 
 		 450 aa  265  2e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.34 
 
 		 486 aa  264  3e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  37.38 
 
 		 454 aa  264  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  41.02 
 
 		 435 aa  263  4e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  37.89 
 
 		 479 aa  263  6e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  40.31 
 
 		 434 aa  262  6.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  44.61 
 
 		 409 aa  262  8e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  38.63 
 
 		 522 aa  262  8e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  37.89 
 
 		 440 aa  261  1e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  37.74 
 
 		 428 aa  261  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  38.46 
 
 		 501 aa  261  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  41.43 
 
 		 487 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  39.71 
 
 		 521 aa  261  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  38.61 
 
 		 422 aa  261  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  38.1 
 
 		 484 aa  260  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  38.26 
 
 		 454 aa  260  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  39.07 
 
 		 414 aa  259  5.0000000000000005e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  44.68 
 
 		 401 aa  259  7e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  39.17 
 
 		 493 aa  259  7e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  39.76 
 
 		 515 aa  259  9e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1407  small GTP-binding protein  39.81 
 
 		 515 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  40.05 
 
 		 512 aa  258  1e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0069  GTP-binding protein  37.93 
 
 		 450 aa  258  1e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  42.9 
 
 		 412 aa  258  1e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1232  GTP-binding proten HflX  40.63 
 
 		 415 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402227  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  38.82 
 
 		 414 aa  258  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  40.52 
 
 		 433 aa  258  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3472  GTP1/OBG protein  39.23 
 
 		 423 aa  257  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0294358  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  38.44 
 
 		 433 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  39.12 
 
 		 494 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  37.8 
 
 		 517 aa  256  4e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  40.21 
 
 		 435 aa  256  5e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  39.17 
 
 		 546 aa  256  5e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  38.94 
 
 		 433 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.36 
 
 		 436 aa  255  9e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  35.71 
 
 		 432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  47.83 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  38.89 
 
 		 421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6253  GTP-binding proten HflX  44.72 
 
 		 426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  38.88 
 
 		 493 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1365  GTP-binding protein, HSR1-related  39.12 
 
 		 412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0434116  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1391  GTP-binding protein HSR1-related  39.12 
 
 		 412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84706  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  38.14 
 
 		 417 aa  253  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1927  GTP binding protein  38.64 
 
 		 597 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1499  GTP-binding protein  39.74 
 
 		 425 aa  253  7e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3806  GTP-binding protein  39.47 
 
 		 425 aa  252  7e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  36.87 
 
 		 553 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  37.99 
 
 		 485 aa  252  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  36.54 
 
 		 461 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  37.31 
 
 		 432 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  38.41 
 
 		 597 aa  250  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3452  GTP-binding protein (hflX)  39.21 
 
 		 425 aa  249  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  37.38 
 
 		 429 aa  250  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1449  GTP-binding protein, HSR1-related  39.43 
 
 		 494 aa  250  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.062201  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  36.64 
 
 		 429 aa  249  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0228  GTPase  40.37 
 
 		 414 aa  250  4e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  36.62 
 
 		 512 aa  249  5e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3840  GTP1/OBG family GTP-binding protein  46.75 
 
 		 392 aa  249  8e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3757  GTP-binding protein  38.95 
 
 		 425 aa  249  9e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00868177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>