More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1607 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1607  phage integrase family protein  100 
 
 
402 aa  838    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1247  phage integrase family site specific recombinase  36.17 
 
 
399 aa  256  6e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.357571  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  27.08 
 
 
370 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  26.7 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  26.05 
 
 
369 aa  106  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  26.32 
 
 
369 aa  106  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  25.57 
 
 
384 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  25.49 
 
 
356 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0939  integrase family protein  27.41 
 
 
357 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.47 
 
 
374 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.47 
 
 
374 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  26.1 
 
 
369 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  28.25 
 
 
356 aa  96.3  8e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  25.34 
 
 
435 aa  92.4  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  26.28 
 
 
381 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  25.26 
 
 
393 aa  89.7  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  25.91 
 
 
381 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  23.21 
 
 
463 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  22.34 
 
 
378 aa  88.6  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  25.93 
 
 
374 aa  88.6  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  24.39 
 
 
393 aa  87.4  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  23.51 
 
 
391 aa  86.3  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  23.87 
 
 
377 aa  86.3  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  25.47 
 
 
388 aa  86.3  9e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0848  phage integrase family protein  27.04 
 
 
349 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0864  phage integrase family protein  27.04 
 
 
349 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0352184  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  22.74 
 
 
389 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  21.64 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  21.64 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  23.12 
 
 
370 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  24.42 
 
 
383 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  21.16 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  25.8 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  22.74 
 
 
357 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  25.74 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  21.94 
 
 
460 aa  78.6  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  24.6 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  22.14 
 
 
443 aa  77.8  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  25 
 
 
367 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  23.75 
 
 
451 aa  77.4  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  24.1 
 
 
362 aa  77  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  25.9 
 
 
368 aa  76.3  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  24.15 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  24 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  23.34 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  24.69 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  25.51 
 
 
308 aa  72.8  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  23.45 
 
 
392 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  25.52 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  20.72 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  27.08 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  26.2 
 
 
378 aa  70.9  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  23.59 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  21.35 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  24.15 
 
 
383 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  23.97 
 
 
305 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  23.57 
 
 
477 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1956  Integrase  30.14 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  22.77 
 
 
371 aa  67  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  24.6 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  28.12 
 
 
361 aa  66.6  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  24.24 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  23.28 
 
 
385 aa  66.2  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1993  phage integrase family site specific recombinase  23.85 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  21.77 
 
 
377 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  24.48 
 
 
400 aa  65.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.34 
 
 
328 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0555  phage integrase  27.11 
 
 
308 aa  65.5  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0470289  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  29.82 
 
 
209 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  21.72 
 
 
398 aa  64.7  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1679  integrase  23.81 
 
 
372 aa  64.3  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1690  integrase  27.53 
 
 
348 aa  64.7  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  27.13 
 
 
388 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  24.36 
 
 
391 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03170  site-specific recombinase XerD  26.61 
 
 
307 aa  63.5  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000220198 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  24.82 
 
 
378 aa  63.5  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1148  phage integrase family protein  23.25 
 
 
376 aa  63.2  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000721683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3952  integrase family protein  28.09 
 
 
310 aa  63.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.52 
 
 
298 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  22.81 
 
 
381 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  22.9 
 
 
385 aa  63.2  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.52 
 
 
298 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  23.48 
 
 
379 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  23.48 
 
 
379 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2723  integrase family protein  28.44 
 
 
313 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1020  phage integrase family protein  29.71 
 
 
401 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.085573  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.11 
 
 
298 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0607  integrase  24.92 
 
 
374 aa  62.8  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1932  integrase/recombinase, phage associated  21.43 
 
 
379 aa  62.8  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.706433  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1039  phage integrase family protein  29.71 
 
 
401 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.1908  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  24.86 
 
 
416 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  22.93 
 
 
386 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  23.72 
 
 
487 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  22.41 
 
 
368 aa  61.2  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  22.89 
 
 
442 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  22.89 
 
 
393 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  25.66 
 
 
275 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  23.34 
 
 
404 aa  60.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  24.91 
 
 
403 aa  59.7  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  23.38 
 
 
398 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>