More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1606 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  100 
 
 		 412 aa  822    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  69.51 
 
 		 413 aa  562  1.0000000000000001e-159  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  59.53 
 
 		 406 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  55.81 
 
 		 401 aa  433  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  49.5 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  47.55 
 
 		 424 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  46 
 
 		 424 aa  335  9e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  44.76 
 
 		 433 aa  331  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  41.58 
 
 		 411 aa  300  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  42.96 
 
 		 475 aa  282  9e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  40.78 
 
 		 467 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 418 aa  277  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  41.2 
 
 		 467 aa  276  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  40.68 
 
 		 424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  41.88 
 
 		 467 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1307  major facilitator superfamily MFS_1  39.09 
 
 		 538 aa  270  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4391  major facilitator superfamily MFS_1  38.81 
 
 		 575 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.796533 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4281  major facilitator superfamily MFS_1  38.81 
 
 		 575 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  40.96 
 
 		 467 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 397 aa  259  6e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02384  transporter transmembrane protein  37.1 
 
 		 549 aa  259  8e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.458603 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4006  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 550 aa  256  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0490  major facilitator transporter  36.99 
 
 		 537 aa  248  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.685431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4642  major facilitator transporter  38 
 
 		 548 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0620  major facilitator transporter  38.39 
 
 		 549 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4899  major facilitator transporter  35.74 
 
 		 553 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0808  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 		 549 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5340  MFS permease-like protein  35.53 
 
 		 553 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0111  major facilitator superfamily MFS_1  37.32 
 
 		 546 aa  238  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2808  major facilitator superfamily MFS_1  40.79 
 
 		 456 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13430  nitrate/nitrite transporter  37.16 
 
 		 507 aa  236  6e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0010455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3633  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 552 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0288  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 		 553 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000241924 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3922  major facilitator superfamily MFS_1  37.32 
 
 		 552 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1334  major facilitator transporter  34.39 
 
 		 545 aa  234  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0322  major facilitator transporter  35.26 
 
 		 554 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.41241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0308  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 553 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00531015 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0986  major facilitator transporter  36.12 
 
 		 556 aa  233  6e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4762  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 		 471 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00470  integral membrane transporter  35.07 
 
 		 558 aa  230  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0394066  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0313  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 553 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1293  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 566 aa  229  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1158  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 		 448 aa  229  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791207  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3191  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 		 545 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6345  major facilitator superfamily permease  35.89 
 
 		 551 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4920  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 552 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0958503  hitchhiker  0.000474897 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3696  major facilitator superfamily MFS_1  35.61 
 
 		 545 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.662162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5500  major facilitator superfamily MFS_1  35.61 
 
 		 545 aa  228  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3829  major facilitator superfamily transporter  34.32 
 
 		 547 aa  227  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2386  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 556 aa  226  7e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4093  MFS permease  37.05 
 
 		 552 aa  225  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3185  major facilitator superfamily MFS_1  38.73 
 
 		 464 aa  223  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  36.03 
 
 		 455 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3578  major facilitator transporter  33.47 
 
 		 553 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2301  major facilitator superfamily MFS_1  38.66 
 
 		 518 aa  219  7.999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1386  major facilitator transporter  34.95 
 
 		 570 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.863121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 		 453 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  33.64 
 
 		 453 aa  216  8e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0961  major facilitator transporter  38.68 
 
 		 463 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1405  putative permease  37.21 
 
 		 428 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 442 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1045  major facilitator superfamily MFS_1  39.69 
 
 		 464 aa  212  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 442 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  32.34 
 
 		 425 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 421 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 421 aa  166  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 421 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 408 aa  164  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 407 aa  159  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 407 aa  159  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  27.55 
 
 		 402 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  27.55 
 
 		 402 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 422 aa  157  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 411 aa  156  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  28.11 
 
 		 402 aa  156  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  27.81 
 
 		 402 aa  155  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  28.06 
 
 		 402 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  28.41 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 408 aa  152  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  27.55 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  27.55 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  27.3 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 402 aa  150  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 405 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 407 aa  145  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 402 aa  143  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  28 
 
 		 400 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  28.42 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  26.14 
 
 		 412 aa  137  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  26.32 
 
 		 412 aa  137  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  27.89 
 
 		 402 aa  136  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 430 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  27.89 
 
 		 402 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  25.36 
 
 		 410 aa  136  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>