35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1582 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1582  membrane protein putative toxin regulator-like protein  100 
 
 
369 aa  716    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000959585  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1792  membrane protein, putative toxin regulator  52.68 
 
 
376 aa  303  3.0000000000000004e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000252316  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1469  membrane protein, putative toxin regulator  48.04 
 
 
380 aa  291  9e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.141534  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5139  hypothetical protein  42.94 
 
 
337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000642874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5141  hypothetical protein  42.94 
 
 
337 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4707  regulatory protein  42.94 
 
 
337 aa  220  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.488826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5105  hypothetical protein  42.94 
 
 
337 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4722  regulatory protein  42.94 
 
 
337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4867  hypothetical protein  42.65 
 
 
337 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.355977  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5239  hypothetical protein  42.65 
 
 
337 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.518825  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5134  hypothetical protein  42.65 
 
 
337 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0374396  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4825  hypothetical protein  42.07 
 
 
337 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.222627  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0101  hypothetical protein  42.36 
 
 
337 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101131  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3590  hypothetical protein  41.45 
 
 
337 aa  189  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0121509  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2346  membrane protein putative toxin regulator-like protein  31.91 
 
 
364 aa  134  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.143914 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3731  phosphotransferase system, EIIC  28.77 
 
 
357 aa  122  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000282587  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1944  toxin regulator pfoR  30.56 
 
 
364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.737194  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1526  PfoR protein  28.87 
 
 
333 aa  119  7e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.216019  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2237  putative toxin regulator PfoR  29.11 
 
 
364 aa  119  7e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3597  PfoR protein  23.85 
 
 
338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02440  predicted membrane protein, putative toxin regulator  29.46 
 
 
357 aa  115  7.999999999999999e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2149  putative PTS system, EIIc component  28.16 
 
 
346 aa  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0650  hypothetical protein  26.62 
 
 
344 aa  99  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000543159  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1888  PfoR protein  27.84 
 
 
353 aa  96.3  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000119522 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1836  membrane protein, putative toxin regulator  25.76 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.114895  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1396  PTS system, IIC component, putative  25.38 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0363  membrane protein, putative toxin regulator  28.19 
 
 
321 aa  65.1  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1755  membrane protein, putative toxin regulator  25.85 
 
 
412 aa  55.8  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1947  phosphotransferase system EIIC  26.39 
 
 
353 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000102659  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1913  phosphotransferase system, EIIC  26.39 
 
 
353 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000928042  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2141  regulatory protein, putative  24.3 
 
 
352 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1284  membrane protein putative toxin regulator-like protein  24.25 
 
 
349 aa  50.4  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1352  hypothetical protein  23.26 
 
 
356 aa  48.5  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0530116  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2647  hypothetical protein  23.81 
 
 
351 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2592  hypothetical protein  23.81 
 
 
351 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>