162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1543 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1543  major facilitator transporter  100 
 
 		 405 aa  805    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000874493  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0383  major facilitator superfamily permease  49.63 
 
 		 396 aa  355  7.999999999999999e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  40.78 
 
 		 332 aa  218  2e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  34.15 
 
 		 399 aa  193  6e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0827  major facilitator superfamily permease  33.58 
 
 		 392 aa  173  5e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  33.58 
 
 		 401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  27.79 
 
 		 403 aa  142  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  30.87 
 
 		 383 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1289  major facilitator superfamily permease  29.35 
 
 		 398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000157601  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0306  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 384 aa  122  9e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0207  major facilitator superfamily permease  29.41 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000553672  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1892  hypothetical protein  27.13 
 
 		 358 aa  119  9e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1581  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 394 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  28.52 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  26.64 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  22.86 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  26.16 
 
 		 373 aa  59.7  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  22.71 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  29.73 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  23.4 
 
 		 912 aa  57.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  22.74 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  29.73 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 		 443 aa  57  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08060  arabinose efflux permease family protein  25.88 
 
 		 418 aa  57  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 385 aa  57  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  22.47 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  22.47 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  25.1 
 
 		 439 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06496  hypothetical protein  24.31 
 
 		 395 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 		 850 aa  55.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4044  putative permease  25.84 
 
 		 420 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4224  putative permease  25.36 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4117  putative permease  25.36 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0914  MFS transporter  24.14 
 
 		 395 aa  53.9  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  25 
 
 		 414 aa  53.9  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0668  MFS transporter  27.42 
 
 		 387 aa  53.5  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  22.61 
 
 		 895 aa  53.1  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 		 385 aa  53.1  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  26.42 
 
 		 386 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  22.49 
 
 		 388 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 413 aa  53.1  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1490  putative tetracycline resistance protein  23.93 
 
 		 462 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000919322  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  24.22 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4166  putative permease  25.36 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.74612 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 433 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  22.66 
 
 		 435 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  24 
 
 		 421 aa  51.6  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  21.79 
 
 		 399 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  23.65 
 
 		 433 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.12 
 
 		 474 aa  50.4  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1313  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 433 aa  50.1  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.720769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 452 aa  50.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 406 aa  50.1  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2079  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 423 aa  50.1  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.816032  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2058  major facilitator family protein  22.18 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0107331  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4140  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.4 
 
 		 505 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1279  tetracycline resistance protein, putative  21.47 
 
 		 462 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000123151  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 391 aa  48.9  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  22.65 
 
 		 417 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  22.65 
 
 		 417 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  24.24 
 
 		 455 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.24 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  25.81 
 
 		 497 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  22.65 
 
 		 417 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2788  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  22.53 
 
 		 389 aa  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0332558  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  22.65 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  22.65 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3637  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 405 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476152  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 447 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 462 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  27.04 
 
 		 388 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 408 aa  47  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 456 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.67 
 
 		 478 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 400 aa  47  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  20.41 
 
 		 404 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  22.35 
 
 		 427 aa  47  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0949  permease, general substrate transporter  22.62 
 
 		 482 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000025972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  24.06 
 
 		 420 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0971  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.02 
 
 		 482 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1116  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  22.02 
 
 		 482 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000271146 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  24.32 
 
 		 481 aa  46.2  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  23.91 
 
 		 453 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  28.04 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  22.68 
 
 		 456 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>