162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1543 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1543  major facilitator transporter  100 
 
 
405 aa  805  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  8.74493e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0383  major facilitator superfamily permease  49.63 
 
 
396 aa  355  8e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  40.78 
 
 
332 aa  218  2e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  34.15 
 
 
399 aa  193  6e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0827  major facilitator superfamily permease  33.58 
 
 
392 aa  173  5e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  33.58 
 
 
401 aa  147  4e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  27.79 
 
 
403 aa  142  2e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  30.87 
 
 
383 aa  135  2e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1289  major facilitator superfamily permease  29.35 
 
 
398 aa  134  2e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000157601  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0306  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 
384 aa  122  9e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0207  major facilitator superfamily permease  29.41 
 
 
387 aa  121  2e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000553672  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1892  hypothetical protein  27.13 
 
 
358 aa  119  9e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  6.60626e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1581  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 
378 aa  107  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 
394 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  28.52 
 
 
414 aa  77.8  3e-13  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 
388 aa  75.9  1e-12  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  26.64 
 
 
400 aa  72  2e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 
411 aa  72  2e-11  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 
381 aa  70.9  4e-11  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  25.39 
 
 
397 aa  64.3  4e-09  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  22.86 
 
 
404 aa  62  2e-08  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 
425 aa  60.8  4e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  28.33 
 
 
402 aa  60.5  6e-08  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  26.16 
 
 
373 aa  59.7  1e-07  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  29.73 
 
 
415 aa  57.8  3e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  22.71 
 
 
403 aa  58.2  3e-07  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  22.74 
 
 
423 aa  58.2  3e-07  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  23.4 
 
 
912 aa  57.8  3e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  29.73 
 
 
415 aa  57.4  4e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08060  arabinose efflux permease family protein  25.88 
 
 
418 aa  57  6e-07  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 
443 aa  57  6e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  24.93 
 
 
385 aa  57  7e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  22.47 
 
 
423 aa  56.6  8e-07  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  22.47 
 
 
423 aa  56.2  9e-07  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06496  hypothetical protein  24.31 
 
 
395 aa  55.5  2e-06  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  25.1 
 
 
439 aa  55.1  2e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 
414 aa  55.5  2e-06  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 
850 aa  55.5  2e-06  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  24.46 
 
 
384 aa  55.5  2e-06  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4044  putative permease  25.84 
 
 
420 aa  54.3  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0914  MFS transporter  24.14 
 
 
395 aa  53.9  5e-06  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4224  putative permease  25.36 
 
 
420 aa  53.9  5e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4117  putative permease  25.36 
 
 
420 aa  53.9  5e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  25 
 
 
414 aa  53.9  6e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0668  MFS transporter  27.42 
 
 
387 aa  53.5  7e-06  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  22.61 
 
 
895 aa  53.1  8e-06  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  26.42 
 
 
386 aa  53.1  8e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 
413 aa  53.1  8e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  22.49 
 
 
388 aa  53.1  8e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 
385 aa  53.1  8e-06  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1490  putative tetracycline resistance protein  23.93 
 
 
462 aa  52.8  1e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000919322  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  24.22 
 
 
433 aa  52.8  1e-05  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4166  putative permease  25.36 
 
 
420 aa  52  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.74612 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  22.66 
 
 
435 aa  51.6  2e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 
413 aa  52.4  2e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97881e-15 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 
433 aa  51.6  2e-05  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  24 
 
 
421 aa  51.6  3e-05  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  21.79 
 
 
399 aa  50.8  4e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.12 
 
 
474 aa  50.4  5e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  23.65 
 
 
433 aa  50.8  5e-05  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1313  major facilitator transporter  25.43 
 
 
433 aa  50.1  6e-05  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.720769  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  27.1 
 
 
452 aa  50.4  6e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  27.03 
 
 
406 aa  50.1  8e-05  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2079  major facilitator transporter  25.32 
 
 
423 aa  50.1  8e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.816032  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2058  major facilitator family protein  22.18 
 
 
415 aa  49.3  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0107331  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4140  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.4 
 
 
505 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 
391 aa  48.9  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  1.91868e-06  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1279  tetracycline resistance protein, putative  21.47 
 
 
462 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  1.23151e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  25.81 
 
 
497 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  23.5 
 
 
432 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2788  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  22.53 
 
 
389 aa  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0332558  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  22.65 
 
 
417 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  6.2799e-07 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  22.65 
 
 
417 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  6.20465e-15 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  24.24 
 
 
455 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.24 
 
 
440 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  22.65 
 
 
417 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3637  major facilitator transporter  27.83 
 
 
405 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476152  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  22.65 
 
 
417 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.10045e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  22.65 
 
 
417 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  24.7 
 
 
456 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.67 
 
 
478 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  23.4 
 
 
462 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  26.7 
 
 
447 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  27.04 
 
 
388 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  26.07 
 
 
408 aa  47  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  20.41 
 
 
404 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  22.35 
 
 
427 aa  47  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 
400 aa  47  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0949  permease, general substrate transporter  22.62 
 
 
482 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.5972e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  24.06 
 
 
420 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  23.91 
 
 
453 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  27.27 
 
 
426 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1038  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.02 
 
 
482 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 
437 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  1.98759e-05  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0971  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.02 
 
 
482 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  26.23 
 
 
441 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  22.02 
 
 
414 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  24.32 
 
 
481 aa  46.2  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  26.53 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  22.68 
 
 
456 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>