217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1542 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1779  glycosidase  72.61 
 
 
489 aa  726  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0384  glycosidase  79.88 
 
 
492 aa  814  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00983965  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1542  sucrose phosphorylase  100 
 
 
485 aa  997  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.296567  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0241  Sucrose phosphorylase  65.28 
 
 
483 aa  669  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0651  sucrose phosphorylase  47.15 
 
 
482 aa  471  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0824794  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0066  sucrose phosphorylase  38.99 
 
 
492 aa  320  4e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.530318  hitchhiker  0.00316152 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0232  sucrose phosphorylase  36.23 
 
 
493 aa  318  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0065  sucrose phosphorylase  38.57 
 
 
492 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0061  sucrose phosphorylase  38.57 
 
 
492 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4288  sucrose phosphorylase  39.55 
 
 
492 aa  316  5e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00965772  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0066  sucrose phosphorylase  37.2 
 
 
494 aa  314  2e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.18626e-09 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0064  sucrose phosphorylase  37.4 
 
 
494 aa  313  3e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  7.22293e-08 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3361  alpha amylase catalytic region  35.73 
 
 
491 aa  311  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0062  sucrose phosphorylase  38.41 
 
 
494 aa  310  3e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0945971  unclonable  3.50237e-05 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01971  sucrose phosphorylase  36.71 
 
 
498 aa  308  1e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1331  sucrose phosphorylase  36.36 
 
 
508 aa  298  1e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00201506  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3990  sucrose phosphorylase  37.5 
 
 
493 aa  295  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00149762  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1519  alpha amylase family protein  28.23 
 
 
559 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2316  alpha amylase catalytic region  28.23 
 
 
559 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.278573  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01286  predicted glucosyltransferase  28.23 
 
 
559 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2337  alpha amylase catalytic region  28.23 
 
 
559 aa  187  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0459721  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1424  alpha amylase family protein  28.23 
 
 
559 aa  187  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0774  Alpha amylase, catalytic region  31.52 
 
 
589 aa  185  1e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2165  alpha amylase, catalytic region  27.71 
 
 
565 aa  182  8e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3029  alpha amylase catalytic subunit  29.19 
 
 
556 aa  182  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.172997 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1813  alpha amylase family protein  27.62 
 
 
559 aa  180  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.653374 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0246  alpha amylase domain-containing protein  27.49 
 
 
583 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09141  glycoside hydrolase family protein  27.42 
 
 
583 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000264002 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2600  sucrose phosphorylase  28.57 
 
 
591 aa  175  1e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2164  alpha amylase, catalytic region  28.2 
 
 
586 aa  173  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.659302  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2588  alpha amylase  30.75 
 
 
598 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0665  alpha amylase catalytic region  27.95 
 
 
555 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.694695  normal  0.614349 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02161  putative sucrose phosphorylase  29.1 
 
 
584 aa  171  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1771  alpha amylase catalytic region  27.01 
 
 
585 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232326  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1248  alpha amylase catalytic region  28.6 
 
 
568 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55232  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3210  sucrose phosphorylase  27.13 
 
 
596 aa  163  5e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2573  alpha amylase, catalytic region  26.41 
 
 
578 aa  157  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000337914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2580  alpha amylase, catalytic region  26.41 
 
 
578 aa  157  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.008896  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2566  alpha amylase, catalytic region  26.41 
 
 
578 aa  157  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0104089  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0418  alpha amylase, catalytic region  26.88 
 
 
577 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.537622  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1824  putative sucrose phosphorylase  26.19 
 
 
587 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.552548  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10441  glycoside hydrolase family protein  25.84 
 
 
589 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1523  alpha amylase catalytic region  27.8 
 
 
561 aa  147  4e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.346384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2846  alpha amylase, catalytic region  25.33 
 
 
581 aa  146  8e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218279  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0506  putative sucrose phosphorylase  27.57 
 
 
544 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2606  alpha amylase domain-containing protein  24.85 
 
 
575 aa  145  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.281377 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08951  glycoside hydrolase family protein  24.36 
 
 
586 aa  140  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.497034  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0838  alpha amylase domain-containing protein  24.89 
 
 
586 aa  139  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2243  alpha amylase domain-containing protein  23.09 
 
 
575 aa  137  3e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08971  glycoside hydrolase family protein  23.86 
 
 
586 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.540308  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06751  glycoside hydrolase family protein  26 
 
 
578 aa  135  2e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.335085 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  25.63 
 
 
644 aa  75.9  2e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  26.73 
 
 
650 aa  70.5  7e-11  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  23.75 
 
 
638 aa  70.1  8e-11  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  22.64 
 
 
567 aa  66.2  1e-09  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  25.55 
 
 
636 aa  65.5  2e-09  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  26.13 
 
 
657 aa  63.2  1e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  23.05 
 
 
663 aa  62.8  2e-08  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  22.35 
 
 
649 aa  61.6  3e-08  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  21.9 
 
 
661 aa  61.2  4e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  20.98 
 
 
548 aa  60.1  9e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  21.87 
 
 
1061 aa  59.7  1e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  21.07 
 
 
1093 aa  59.3  1e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  21.14 
 
 
1101 aa  59.3  1e-07  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  21.29 
 
 
1094 aa  58.9  2e-07  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  23.98 
 
 
1098 aa  58.2  3e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  21.07 
 
 
1093 aa  58.5  3e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  26.6 
 
 
1113 aa  57.4  5e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  22.88 
 
 
652 aa  57.8  5e-07  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  3.23164e-05 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  21.22 
 
 
650 aa  57.4  6e-07  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  24.53 
 
 
553 aa  57  8e-07  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  24.86 
 
 
1098 aa  56.6  9e-07  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  22.22 
 
 
650 aa  56.6  1e-06  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  21.76 
 
 
1116 aa  56.6  1e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  21.95 
 
 
1116 aa  56.2  1e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  25.79 
 
 
639 aa  55.5  2e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  27.37 
 
 
1113 aa  55.8  2e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3928  alpha amylase catalytic region  21.09 
 
 
544 aa  55.5  2e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  20.74 
 
 
1088 aa  55.1  3e-06  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  22.56 
 
 
1154 aa  54.7  3e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  20.74 
 
 
1088 aa  55.1  3e-06  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  24.06 
 
 
1123 aa  55.1  3e-06  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  22.35 
 
 
643 aa  54.7  4e-06  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  21.56 
 
 
1100 aa  54.3  4e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  8.83241e-07 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  21.96 
 
 
1152 aa  54.7  4e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  24.14 
 
 
1100 aa  54.3  5e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  26.13 
 
 
1112 aa  54.3  5e-06  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  20.33 
 
 
1099 aa  53.9  6e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2418  trehalose synthase  23.85 
 
 
591 aa  53.9  6e-06  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.482185  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  24.67 
 
 
1102 aa  53.9  6e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  23.3 
 
 
642 aa  53.9  6e-06  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  21.33 
 
 
1088 aa  53.5  7e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  22.43 
 
 
645 aa  53.9  7e-06  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  21.51 
 
 
1136 aa  53.5  7e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  21.87 
 
 
1108 aa  53.9  7e-06  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  22.7 
 
 
543 aa  53.9  7e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  21.74 
 
 
1104 aa  53.9  7e-06  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  23.04 
 
 
645 aa  53.5  8e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  21.19 
 
 
1137 aa  53.5  8e-06  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  23.58 
 
 
1130 aa  53.5  8e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>