105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1504 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  511  1e-144  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  37.82 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  39.57 
 
 		 250 aa  175  8e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  37.15 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  35.71 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  35.71 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  34.3 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  34.69 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  34.69 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  33.75 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  34.02 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  32.24 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  32.2 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  32.92 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  31.03 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  31.03 
 
 		 256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  32.92 
 
 		 256 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  31.09 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  30.89 
 
 		 257 aa  105  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  26.92 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  25 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0301  hypothetical protein  27.56 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.345177  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0908  protein of unknown function DUF1212  25.62 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.395602  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  24.05 
 
 		 475 aa  63.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  22.22 
 
 		 468 aa  62.4  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03184  hypothetical protein  24.89 
 
 		 419 aa  62  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  22.87 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  26.82 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  22.87 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4904  hypothetical protein  22.87 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000992297  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  22.53 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4909  hypothetical protein  23.26 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000641021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  24.89 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  22.48 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  22.48 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1397  hypothetical protein  27.51 
 
 		 637 aa  57.8  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  22.48 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5877  hypothetical protein  22.48 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00509244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  20.73 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  22.09 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  22.95 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  23.02 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0597  protein of unknown function DUF1212  24.79 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43168  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1824  phosphoglycerate kinase  23.28 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  27.27 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  22.87 
 
 		 478 aa  54.3  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  22.13 
 
 		 448 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  23.58 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  24.02 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  23.64 
 
 		 406 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  21.99 
 
 		 461 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  23.27 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  22.86 
 
 		 314 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  22.86 
 
 		 303 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0557  protein of unknown function DUF1212  23.29 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3643  hypothetical protein  22.67 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3838  protein of unknown function DUF1212  22.67 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  21.15 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0175  protein of unknown function DUF1212  24.89 
 
 		 433 aa  49.3  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0019  hypothetical protein  23.38 
 
 		 573 aa  49.7  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0694356 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0629  hypothetical protein  25 
 
 		 420 aa  49.3  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973837  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1962  protein of unknown function DUF1212  23.43 
 
 		 258 aa  49.3  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0150285  hitchhiker  0.00184472 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4954  hypothetical protein  22.45 
 
 		 314 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4960  hypothetical protein  22.45 
 
 		 314 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  19.92 
 
 		 267 aa  48.9  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0580  hypothetical protein  25 
 
 		 420 aa  48.9  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000430265  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4800  hypothetical protein  22.45 
 
 		 314 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.457693 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  21.31 
 
 		 266 aa  48.9  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  21.31 
 
 		 266 aa  48.9  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0525  protein of unknown function DUF1212  23.57 
 
 		 419 aa  48.5  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349985 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4593  protein of unknown function DUF1212  25.81 
 
 		 422 aa  48.9  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  22.81 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1662  hypothetical protein  24.07 
 
 		 414 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  20.55 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  23.58 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  21.97 
 
 		 408 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  20.72 
 
 		 406 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  23.14 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  21.63 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  22.62 
 
 		 422 aa  46.6  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  22.12 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  21.78 
 
 		 408 aa  46.2  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  22.08 
 
 		 467 aa  46.2  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  21.85 
 
 		 406 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  23.14 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  23.14 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  21.85 
 
 		 406 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  21.85 
 
 		 406 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  22.82 
 
 		 406 aa  45.8  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  23.14 
 
 		 253 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  20.76 
 
 		 406 aa  45.4  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  22.71 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3691  hypothetical protein  20.72 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0517  protein of unknown function DUF1212  24.17 
 
 		 422 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133361  hitchhiker  0.00000293243 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  29.73 
 
 		 406 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  29.8 
 
 		 406 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  21.25 
 
 		 406 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  20.52 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  22.46 
 
 		 466 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>