More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1480 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  100 
 
 		 281 aa  568  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0598  50S ribosomal protein L2  76.9 
 
 		 279 aa  425  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000263643  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  75 
 
 		 277 aa  422  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  74.28 
 
 		 277 aa  419  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  74.28 
 
 		 277 aa  419  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  76.36 
 
 		 277 aa  420  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  75 
 
 		 276 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  73.82 
 
 		 278 aa  410  1e-113  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  3.4720999999999997e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  72.46 
 
 		 276 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  73.72 
 
 		 277 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  71.74 
 
 		 276 aa  403  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  71.01 
 
 		 276 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  71.38 
 
 		 276 aa  401  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  71.74 
 
 		 276 aa  403  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  70.65 
 
 		 276 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  71.01 
 
 		 276 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  71.74 
 
 		 277 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  71.01 
 
 		 276 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  71.01 
 
 		 276 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  71.01 
 
 		 276 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  71.01 
 
 		 276 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  71.01 
 
 		 276 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  71.01 
 
 		 276 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  68.25 
 
 		 276 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  66.79 
 
 		 276 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  66.18 
 
 		 275 aa  361  6e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  67.64 
 
 		 275 aa  361  6e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  67.39 
 
 		 276 aa  361  8e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf440  50S ribosomal protein L2  63.31 
 
 		 281 aa  360  1e-98  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  63.5 
 
 		 277 aa  359  3e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  66.18 
 
 		 277 aa  356  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  64.73 
 
 		 275 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  63.97 
 
 		 280 aa  356  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  64.86 
 
 		 275 aa  355  3.9999999999999996e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  63.04 
 
 		 275 aa  350  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0693  50S ribosomal protein L2  62.14 
 
 		 281 aa  350  2e-95  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  66.55 
 
 		 273 aa  349  3e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl126  50S ribosomal protein L2  64.26 
 
 		 281 aa  348  4e-95  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0445797  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3664  50S ribosomal protein L2  65.33 
 
 		 281 aa  347  9e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272816  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  63.04 
 
 		 276 aa  346  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  62.04 
 
 		 277 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  62.04 
 
 		 277 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  63.14 
 
 		 275 aa  345  5e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  63.77 
 
 		 275 aa  345  5e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 275 aa  343  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  64.96 
 
 		 274 aa  342  2.9999999999999997e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  62.32 
 
 		 275 aa  341  7e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  63.04 
 
 		 276 aa  341  7e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  62.32 
 
 		 275 aa  341  9e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 276 aa  340  2e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  62.32 
 
 		 276 aa  338  8e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  61.59 
 
 		 277 aa  336  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  60.58 
 
 		 274 aa  336  1.9999999999999998e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0246  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 		 276 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0249  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 		 276 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  61.37 
 
 		 279 aa  328  7e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0956  50S ribosomal protein L2  63.5 
 
 		 274 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00125176  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3992  ribosomal protein L2  61.59 
 
 		 275 aa  326  3e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  60.87 
 
 		 275 aa  325  4.0000000000000003e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  63.46 
 
 		 274 aa  325  5e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  60.51 
 
 		 274 aa  325  5e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  60.65 
 
 		 278 aa  324  9e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  60.65 
 
 		 279 aa  323  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3706  50S ribosomal protein L2  59.85 
 
 		 277 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0229  50S ribosomal protein L2  59.14 
 
 		 279 aa  322  5e-87  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.116801  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 276 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 276 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1282  ribosomal protein L2  59.42 
 
 		 275 aa  318  5e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  58.39 
 
 		 283 aa  317  1e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  59.78 
 
 		 279 aa  315  4e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1914  50S ribosomal protein L2  59.35 
 
 		 282 aa  314  8e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  58.67 
 
 		 287 aa  314  8e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  56.52 
 
 		 287 aa  314  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1710  50S ribosomal protein L2  60.22 
 
 		 276 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0454  50S ribosomal protein L2  56.93 
 
 		 274 aa  312  4.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000232989  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  57.93 
 
 		 287 aa  311  5.999999999999999e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0258  ribosomal protein L2  60.57 
 
 		 276 aa  311  6.999999999999999e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1135  50S ribosomal protein L2  60 
 
 		 275 aa  311  7.999999999999999e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000903374  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  60.51 
 
 		 274 aa  310  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0497  50S ribosomal protein L2  58.18 
 
 		 275 aa  310  2e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000398645  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  60.87 
 
 		 274 aa  310  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147453  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0477  50S ribosomal protein L2  56.57 
 
 		 274 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0481332  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_420  ribosomal protein L2  56.93 
 
 		 274 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00663414  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0436  50S ribosomal protein L2  57.82 
 
 		 275 aa  309  4e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00110098  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0401  ribosomal protein L2  62.36 
 
 		 278 aa  308  5e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  60.87 
 
 		 274 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  60.51 
 
 		 274 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  58.39 
 
 		 273 aa  305  4.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  57.25 
 
 		 274 aa  306  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  57.25 
 
 		 274 aa  306  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  57.25 
 
 		 274 aa  306  4.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10718  50S ribosomal protein L2  62.23 
 
 		 280 aa  304  9.000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0762488  normal  0.210258 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  57.61 
 
 		 274 aa  304  9.000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000106039  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  57.66 
 
 		 273 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  59.78 
 
 		 274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000833663  hitchhiker  0.00000000000856838 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2061  50S ribosomal protein L2  61.01 
 
 		 279 aa  303  1.0000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000364134  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20001  50S ribosomal protein L2  54.71 
 
 		 287 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.738026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1033  50S ribosomal protein L2  62.59 
 
 		 278 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1043  50S ribosomal protein L2  62.59 
 
 		 278 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1126  50S ribosomal protein L2  54.71 
 
 		 287 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>