More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1468 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1468  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 178 aa  356  9.999999999999999e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108957  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  64.04 
 
 		 178 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  60.11 
 
 		 178 aa  223  1e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  58.99 
 
 		 178 aa  201  4e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 178 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  57.3 
 
 		 178 aa  199  9.999999999999999e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 178 aa  194  6e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 178 aa  192  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 178 aa  192  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0305  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 176 aa  191  4e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.9924900000000002e-28 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  55.69 
 
 		 182 aa  191  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 178 aa  188  4e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  187  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 180 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 178 aa  184  6e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  184  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  52.81 
 
 		 178 aa  181  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  52.6 
 
 		 182 aa  178  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 180 aa  177  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  51.46 
 
 		 183 aa  176  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 179 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  48.3 
 
 		 178 aa  175  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  51.46 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  46.33 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  48.86 
 
 		 182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  48.31 
 
 		 180 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  171  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  47.19 
 
 		 179 aa  168  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 177 aa  168  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  48.33 
 
 		 181 aa  168  4e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  168  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  47.8 
 
 		 184 aa  166  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  47.8 
 
 		 184 aa  166  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0681  50S ribosomal protein L6  47.19 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  47.75 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  44.94 
 
 		 178 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 181 aa  164  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 		 180 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 		 179 aa  164  8e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  45.71 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  46.07 
 
 		 178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  46.63 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  46.07 
 
 		 178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  46.63 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  46.63 
 
 		 179 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  43.58 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27601  Plastid ribosomal protein L6 large ribosomal subunit  47.46 
 
 		 213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.935341  normal  0.110543 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  49.73 
 
 		 179 aa  162  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  44 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  46.78 
 
 		 182 aa  162  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 179 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 179 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  45.51 
 
 		 178 aa  161  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  46.63 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  46.63 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  44.07 
 
 		 177 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 180 aa  161  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 178 aa  161  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0441  50S ribosomal protein L6  45.71 
 
 		 177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296356  hitchhiker  0.000109216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 177 aa  161  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  44.32 
 
 		 187 aa  160  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0968  50S ribosomal protein L6  45.6 
 
 		 184 aa  160  7e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.569336  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  46.07 
 
 		 179 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  49.44 
 
 		 179 aa  160  8.000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  44.86 
 
 		 187 aa  160  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  42.29 
 
 		 177 aa  159  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  45.51 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  44.07 
 
 		 180 aa  159  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1636  50S ribosomal protein L6  46.63 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  47.67 
 
 		 183 aa  160  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  45.71 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0436  50S ribosomal protein L6P  48.57 
 
 		 176 aa  160  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0157307  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  45.71 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>