More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1466 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 169 aa  333  7.999999999999999e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  70.81 
 
 		 166 aa  236  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  70.19 
 
 		 166 aa  232  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  69.57 
 
 		 166 aa  230  7.000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  71.6 
 
 		 165 aa  229  1e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0212  30S ribosomal protein S5  72.89 
 
 		 168 aa  228  3e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  68.32 
 
 		 166 aa  224  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  68.32 
 
 		 166 aa  224  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  68.32 
 
 		 166 aa  224  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  68.32 
 
 		 166 aa  224  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  68.32 
 
 		 166 aa  224  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  68.32 
 
 		 166 aa  224  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  68.32 
 
 		 166 aa  224  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  68.32 
 
 		 166 aa  224  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  68.32 
 
 		 166 aa  224  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  67.7 
 
 		 166 aa  223  8e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0307  30S ribosomal protein S5  76.47 
 
 		 174 aa  214  5.9999999999999996e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.29437e-28 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2384  30S ribosomal protein S5  73.21 
 
 		 168 aa  213  9.999999999999999e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0029509  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0075  30S ribosomal protein S5  74.85 
 
 		 164 aa  211  3.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.774512  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1890  30S ribosomal protein S5  76.07 
 
 		 164 aa  210  5.999999999999999e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  63.25 
 
 		 173 aa  205  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  62.73 
 
 		 166 aa  202  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  59.39 
 
 		 168 aa  200  7e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  62.73 
 
 		 166 aa  200  7e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  61.68 
 
 		 168 aa  200  7e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  65.33 
 
 		 166 aa  197  6e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  63.35 
 
 		 166 aa  197  7e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  64.67 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  60.25 
 
 		 164 aa  196  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  64.67 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  59.01 
 
 		 165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  59.01 
 
 		 165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  59.88 
 
 		 167 aa  195  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  60.37 
 
 		 167 aa  194  7e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  59.63 
 
 		 166 aa  191  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  60.25 
 
 		 168 aa  189  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  57.76 
 
 		 166 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  59.63 
 
 		 169 aa  184  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1557  ribosomal protein S5  57.32 
 
 		 169 aa  185  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000355903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  59.63 
 
 		 169 aa  184  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  59.63 
 
 		 169 aa  184  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  57.14 
 
 		 166 aa  184  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  57.41 
 
 		 169 aa  183  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  58.13 
 
 		 163 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  58.67 
 
 		 206 aa  181  3e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  56.52 
 
 		 180 aa  180  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  56.52 
 
 		 180 aa  180  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  58.23 
 
 		 162 aa  180  9.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  58.86 
 
 		 162 aa  179  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  53.37 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  56.52 
 
 		 168 aa  177  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  52.83 
 
 		 163 aa  177  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3650  ribosomal protein S5  54.6 
 
 		 168 aa  177  9e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000874802  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  51.95 
 
 		 172 aa  176  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  53.46 
 
 		 163 aa  176  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  53.42 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  55.7 
 
 		 162 aa  175  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  54.49 
 
 		 167 aa  175  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  55.48 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  55.7 
 
 		 162 aa  174  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  55.7 
 
 		 162 aa  174  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  51.57 
 
 		 163 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  53.33 
 
 		 197 aa  173  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  52.17 
 
 		 182 aa  173  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  54.43 
 
 		 162 aa  172  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  51.53 
 
 		 174 aa  171  3.9999999999999995e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  56.33 
 
 		 162 aa  171  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  52.1 
 
 		 172 aa  170  7.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  56 
 
 		 163 aa  169  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  55.13 
 
 		 173 aa  167  6e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  50.93 
 
 		 173 aa  167  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  52.17 
 
 		 174 aa  167  8e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  50.92 
 
 		 172 aa  167  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  49.1 
 
 		 172 aa  167  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  51.19 
 
 		 175 aa  167  9e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  51.22 
 
 		 163 aa  166  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2138  SSU ribosomal protein S5P  54.61 
 
 		 200 aa  164  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0468  30S ribosomal protein S5  47.62 
 
 		 172 aa  164  5e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218414  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  52.53 
 
 		 179 aa  164  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_002936  DET0491  30S ribosomal protein S5  47.02 
 
 		 172 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0937948  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  48.5 
 
 		 171 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  48.5 
 
 		 172 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf423  ribosomal protein S5  50.96 
 
 		 234 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  47.9 
 
 		 172 aa  164  8e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  51.97 
 
 		 165 aa  163  9e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0506  30S ribosomal protein S5  51.97 
 
 		 165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_433  ribosomal protein S5  47.02 
 
 		 172 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00128815  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  47.31 
 
 		 172 aa  163  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3978  ribosomal protein S5  52.9 
 
 		 168 aa  162  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0679  30S ribosomal protein S5  54.67 
 
 		 254 aa  160  8.000000000000001e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1921  30S ribosomal protein S5  52.56 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1973  30S ribosomal protein S5  51.2 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00407796  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0274  30S ribosomal protein S5  51.85 
 
 		 194 aa  159  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.129476  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0303  30S ribosomal protein S5  58.27 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.924443  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1216  30S ribosomal protein S5  53.59 
 
 		 186 aa  158  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1003  30S ribosomal protein S5  53.12 
 
 		 189 aa  158  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0840798  decreased coverage  0.00550147 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0175  30S ribosomal protein S5  46.95 
 
 		 167 aa  158  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000490298  decreased coverage  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1179  30S ribosomal protein S5  52.94 
 
 		 186 aa  158  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.139582  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0736  30S ribosomal protein S5  52.26 
 
 		 166 aa  158  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000183061  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0209  ribosomal protein S5  54.48 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>