More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1463 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1463  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  100 
 
 		 438 aa  870    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110167  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0310  preprotein translocase subunit SecY  63.81 
 
 		 431 aa  561  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  8.823840000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0215  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  60.69 
 
 		 444 aa  551  1e-156  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2381  preprotein translocase subunit SecY  56.58 
 
 		 439 aa  510  1e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00042664  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0078  preprotein translocase subunit SecY  54.1 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0917629  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0614  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  55.94 
 
 		 448 aa  478  1e-134  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1887  preprotein translocase subunit SecY  52.09 
 
 		 431 aa  456  1e-127  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.729916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0130  preprotein translocase subunit SecY  49.09 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0161  preprotein translocase subunit SecY  49.09 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0130  preprotein translocase subunit SecY  49.09 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00164171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0126  preprotein translocase subunit SecY  49.09 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0265701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0124  preprotein translocase subunit SecY  49.09 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5175  preprotein translocase subunit SecY  49.32 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000485174  unclonable  4.1263e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0151  preprotein translocase subunit SecY  49.32 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0130  preprotein translocase subunit SecY  49.09 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00952483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0125  preprotein translocase subunit SecY  49.09 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00395698  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0131  preprotein translocase subunit SecY  50.57 
 
 		 430 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.129381  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0127  preprotein translocase subunit SecY  50.8 
 
 		 430 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0124  preprotein translocase subunit SecY  49.77 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  46.45 
 
 		 434 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2503  preprotein translocase subunit SecY  46.45 
 
 		 434 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2412  preprotein translocase subunit SecY  46.68 
 
 		 434 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00625491  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1843  preprotein translocase subunit SecY  47.6 
 
 		 434 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.019643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2742  preprotein translocase subunit SecY  46.45 
 
 		 434 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53667e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2545  preprotein translocase subunit SecY  46.22 
 
 		 434 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778926 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2766  preprotein translocase subunit SecY  46.22 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00224272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2547  preprotein translocase subunit SecY  46.22 
 
 		 434 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2747  preprotein translocase subunit SecY  46 
 
 		 434 aa  395  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.787541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2734  preprotein translocase subunit SecY  46.22 
 
 		 434 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.356112  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2298  preprotein translocase subunit SecY  46.31 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2257  preprotein translocase subunit SecY  46.31 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0110363  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2790  preprotein translocase subunit SecY  46.45 
 
 		 434 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000168645  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1811  preprotein translocase subunit SecY  45.85 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.741103  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  44.39 
 
 		 430 aa  353  4e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0142  preprotein translocase, SecY subunit  49.28 
 
 		 355 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.58947e-61 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  40.68 
 
 		 428 aa  317  3e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  40.55 
 
 		 429 aa  310  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  39.33 
 
 		 436 aa  310  4e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  38.55 
 
 		 435 aa  307  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  42.17 
 
 		 445 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  38.76 
 
 		 420 aa  306  5.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  39.82 
 
 		 437 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  39.51 
 
 		 441 aa  305  8.000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  38.19 
 
 		 443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  41.46 
 
 		 447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  40.89 
 
 		 448 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  40.18 
 
 		 430 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  41.23 
 
 		 447 aa  303  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  38.9 
 
 		 439 aa  302  9e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  38.11 
 
 		 443 aa  301  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  37.75 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  37.75 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  41.1 
 
 		 421 aa  301  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  37.75 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  37.14 
 
 		 437 aa  300  4e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  37.7 
 
 		 424 aa  300  4e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  40.55 
 
 		 447 aa  299  7e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  38.19 
 
 		 444 aa  299  7e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  39.18 
 
 		 421 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2923  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  40.96 
 
 		 427 aa  296  7e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000208113  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  38.29 
 
 		 445 aa  295  8e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  37.53 
 
 		 441 aa  295  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  37.47 
 
 		 419 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  38.8 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  38.57 
 
 		 448 aa  293  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  36.7 
 
 		 442 aa  292  7e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  36.75 
 
 		 432 aa  292  7e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  38.5 
 
 		 419 aa  292  8e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  38.43 
 
 		 443 aa  292  9e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2668  preprotein translocase subunit SecY  37.42 
 
 		 436 aa  291  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  37.96 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2956  preprotein translocase subunit SecY  37.42 
 
 		 436 aa  291  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226026  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  37.61 
 
 		 437 aa  290  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  37.89 
 
 		 435 aa  290  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  39.03 
 
 		 444 aa  290  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  39.12 
 
 		 449 aa  289  7e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  37.89 
 
 		 435 aa  289  8e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  37.96 
 
 		 443 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  37.59 
 
 		 418 aa  288  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  37.08 
 
 		 431 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  36.9 
 
 		 441 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  37.73 
 
 		 447 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  37.73 
 
 		 447 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  36.56 
 
 		 441 aa  286  4e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  36.7 
 
 		 429 aa  286  4e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  38.95 
 
 		 446 aa  286  5.999999999999999e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  37.96 
 
 		 445 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  37.44 
 
 		 442 aa  286  7e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  37.61 
 
 		 423 aa  285  8e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  38.9 
 
 		 453 aa  285  9e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1206  preprotein translocase SecY subunit  38.92 
 
 		 457 aa  285  9e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533641  normal  0.0165275 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  39.11 
 
 		 428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0647  preprotein translocase, SecY subunit  38.12 
 
 		 432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  38.22 
 
 		 463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  37.27 
 
 		 444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  37.76 
 
 		 457 aa  285  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4934  preprotein translocase, SecY subunit  37.78 
 
 		 439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000290796  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  38.13 
 
 		 430 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  38.11 
 
 		 434 aa  284  3.0000000000000004e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  37.95 
 
 		 443 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>