More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1462 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  100 
 
 
219 aa  453  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2380  adenylate kinase  69.16 
 
 
215 aa  309  2.9999999999999997e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000961521  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1886  adenylate kinase  64.98 
 
 
218 aa  300  1e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00135603  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  63.13 
 
 
216 aa  292  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0311  adenylate kinase  61.68 
 
 
217 aa  284  7e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000173731  unclonable  2.3199200000000003e-28 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  60.19 
 
 
215 aa  277  9e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  60.19 
 
 
215 aa  277  9e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  59.26 
 
 
215 aa  276  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  61.11 
 
 
217 aa  275  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  60.19 
 
 
216 aa  274  6e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  60.19 
 
 
216 aa  274  6e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  60.19 
 
 
216 aa  274  6e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  60.19 
 
 
216 aa  274  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  60.19 
 
 
216 aa  274  6e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  60.19 
 
 
216 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  59.72 
 
 
216 aa  271  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  59.72 
 
 
216 aa  271  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  59.26 
 
 
216 aa  271  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  59.72 
 
 
216 aa  270  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  59.26 
 
 
216 aa  270  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0079  adenylate kinase  59.45 
 
 
212 aa  255  3e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000187867  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  58.69 
 
 
214 aa  254  7e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  57.89 
 
 
217 aa  249  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  55.98 
 
 
213 aa  245  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2690  adenylate kinase  53.46 
 
 
216 aa  244  8e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  53.05 
 
 
216 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  55.4 
 
 
217 aa  241  6e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  54.17 
 
 
215 aa  240  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  53.52 
 
 
215 aa  239  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  55.5 
 
 
213 aa  238  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  51.17 
 
 
213 aa  234  8e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  53.05 
 
 
217 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  51.64 
 
 
216 aa  231  9e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  51.64 
 
 
216 aa  231  9e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  51.64 
 
 
217 aa  230  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  51.85 
 
 
217 aa  229  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  50.93 
 
 
222 aa  229  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2312  adenylate kinase  51.39 
 
 
215 aa  229  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00140159  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1140  adenylate kinase  51.4 
 
 
208 aa  229  2e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000592914  normal  0.025222 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  51.15 
 
 
215 aa  230  2e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  53.11 
 
 
214 aa  228  6e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  48.85 
 
 
217 aa  228  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  50.7 
 
 
216 aa  227  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  49.54 
 
 
216 aa  224  9e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  51.64 
 
 
214 aa  223  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  51.2 
 
 
214 aa  223  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  50.24 
 
 
217 aa  223  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  47.87 
 
 
423 aa  221  6e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  51.17 
 
 
215 aa  221  7e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  51.22 
 
 
217 aa  218  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  50.24 
 
 
214 aa  218  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  50.7 
 
 
214 aa  218  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  46.54 
 
 
217 aa  217  8.999999999999998e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2157  adenylate kinase  51.64 
 
 
208 aa  217  8.999999999999998e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140182  normal  0.776532 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  47.89 
 
 
217 aa  216  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  51.69 
 
 
217 aa  216  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  51.69 
 
 
217 aa  216  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  50.24 
 
 
217 aa  215  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  46.48 
 
 
217 aa  215  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  47.93 
 
 
220 aa  215  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  43.78 
 
 
219 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23240  Adenylate kinase  49.3 
 
 
208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112414 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  48.36 
 
 
219 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  50.24 
 
 
217 aa  211  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1001  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  46.51 
 
 
215 aa  210  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000583079  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  47.42 
 
 
224 aa  210  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  47.22 
 
 
216 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1553  adenylate kinase  49.3 
 
 
218 aa  209  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.216762  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  49.07 
 
 
214 aa  209  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  46.3 
 
 
218 aa  207  7e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3003  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  45.07 
 
 
222 aa  206  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.192004  hitchhiker  0.00720085 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09780  Adenylate kinase  49.76 
 
 
209 aa  206  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103651 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  44.19 
 
 
215 aa  204  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0974  adenylate kinase  45.54 
 
 
214 aa  203  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  46.34 
 
 
211 aa  203  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4935  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  49.76 
 
 
218 aa  201  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000314171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1361  adenylate kinase  45.16 
 
 
224 aa  201  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  42.99 
 
 
216 aa  201  8e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0348  adenylate kinase  42.33 
 
 
218 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0290027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0952  adenylate kinase  46.01 
 
 
225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  46.01 
 
 
213 aa  200  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1344  adenylate kinase  45.58 
 
 
213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1976  adenylate kinase  45.07 
 
 
215 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0518  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  41.86 
 
 
220 aa  198  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108305  unclonable  0.0000000000175387 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1164  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  43.66 
 
 
226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000123796  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  46.48 
 
 
216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  45.37 
 
 
216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1273  adenylate kinase  45.62 
 
 
217 aa  196  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  44.6 
 
 
217 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4005  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  43.46 
 
 
226 aa  195  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000986709  hitchhiker  0.0000175975 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  44.6 
 
 
217 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2513  adenylate kinase  44.6 
 
 
217 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  42.79 
 
 
229 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  41.86 
 
 
229 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0781  adenylate kinase  42.66 
 
 
218 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0419  adenylate kinase  45.62 
 
 
225 aa  192  3e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0216  adenylate kinase  46.12 
 
 
187 aa  192  4e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3974  adenylate kinase  47.69 
 
 
210 aa  191  6e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2797  adenylate kinase  41.86 
 
 
219 aa  191  9e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5595  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1112  adenylate kinase  44.76 
 
 
209 aa  190  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>