More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1451 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 147 aa  304  3e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0230  50S ribosomal protein L13  70.07 
 
 		 147 aa  224  2e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00330553  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0214  50S ribosomal protein L13  69.18 
 
 		 148 aa  223  8e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000083935  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0127  50S ribosomal protein L13  68.49 
 
 		 148 aa  221  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000749109  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0322  50S ribosomal protein L13  64.63 
 
 		 158 aa  209  1e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000362186  hitchhiker  1.16201e-17 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2584  50S ribosomal protein L13  63.27 
 
 		 148 aa  207  5e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0628  50S ribosomal protein L13  64.19 
 
 		 148 aa  205  1e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0115715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  64.34 
 
 		 145 aa  193  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  64.34 
 
 		 145 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  64.34 
 
 		 145 aa  192  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  64.34 
 
 		 145 aa  192  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  64.34 
 
 		 145 aa  192  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  65.03 
 
 		 145 aa  192  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  64.34 
 
 		 145 aa  192  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  64.34 
 
 		 145 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  64.34 
 
 		 145 aa  192  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  64.54 
 
 		 142 aa  191  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  64.54 
 
 		 142 aa  191  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  63.64 
 
 		 145 aa  191  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1799  50S ribosomal protein L13  60.84 
 
 		 145 aa  190  5e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  62.94 
 
 		 145 aa  189  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  65.22 
 
 		 148 aa  189  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  63.64 
 
 		 145 aa  188  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  66.19 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2245  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 145 aa  188  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000176479  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2286  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 145 aa  188  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101681  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  62.24 
 
 		 145 aa  187  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  60.84 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  63.19 
 
 		 145 aa  184  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  58.04 
 
 		 145 aa  183  7e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  60.84 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 144 aa  182  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 147 aa  180  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 147 aa  180  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 147 aa  180  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 150 aa  179  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  62.96 
 
 		 150 aa  179  9.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 144 aa  179  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  61.07 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1625  50S ribosomal protein L13  59.54 
 
 		 143 aa  177  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.971698  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  59.26 
 
 		 149 aa  177  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  60.31 
 
 		 143 aa  176  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  60.31 
 
 		 143 aa  176  7e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 144 aa  176  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 144 aa  176  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 147 aa  176  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 147 aa  176  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 149 aa  175  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  55.4 
 
 		 146 aa  174  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  55.48 
 
 		 151 aa  174  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  58.52 
 
 		 149 aa  174  5e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 147 aa  173  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2364  50S ribosomal protein L13  62.14 
 
 		 144 aa  173  6e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000697609  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  54.68 
 
 		 146 aa  173  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 147 aa  173  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 147 aa  173  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 149 aa  172  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2679  50S ribosomal protein L13  62.14 
 
 		 144 aa  173  9e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200743  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  57.82 
 
 		 151 aa  172  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  57.82 
 
 		 151 aa  172  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 147 aa  172  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 170 aa  172  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 149 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  55.71 
 
 		 148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf386  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.112252  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  51.72 
 
 		 150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  51.72 
 
 		 150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 149 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 142 aa  170  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 142 aa  170  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  60 
 
 		 146 aa  170  5e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  170  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482809  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 147 aa  170  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 142 aa  170  6.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 144 aa  169  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 146 aa  169  1e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  57.86 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1176  ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 143 aa  169  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 147 aa  168  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 144 aa  168  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  55.94 
 
 		 147 aa  168  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 143 aa  167  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 145 aa  167  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>