More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1450 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  100 
 
 		 131 aa  263  4e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  78.63 
 
 		 131 aa  213  5.9999999999999996e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  77.34 
 
 		 130 aa  211  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  75.78 
 
 		 130 aa  206  9e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  74.22 
 
 		 130 aa  205  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  73.28 
 
 		 131 aa  198  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  68.75 
 
 		 130 aa  189  8e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  67.19 
 
 		 130 aa  186  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  68.75 
 
 		 130 aa  185  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  67.19 
 
 		 130 aa  186  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  67.97 
 
 		 130 aa  184  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  67.97 
 
 		 130 aa  184  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  67.97 
 
 		 130 aa  184  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  67.97 
 
 		 130 aa  184  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  67.97 
 
 		 130 aa  184  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  67.97 
 
 		 130 aa  184  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  67.97 
 
 		 130 aa  184  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  67.19 
 
 		 130 aa  183  9e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  67.19 
 
 		 130 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  67.19 
 
 		 130 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  68.75 
 
 		 130 aa  178  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0629  SSU ribosomal protein S9P  75 
 
 		 130 aa  174  3e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391075  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  67.18 
 
 		 131 aa  173  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  67.18 
 
 		 131 aa  173  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  63.28 
 
 		 130 aa  172  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  63.28 
 
 		 130 aa  172  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  64.06 
 
 		 130 aa  171  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  64.06 
 
 		 130 aa  169  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  61.72 
 
 		 130 aa  166  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  63.78 
 
 		 130 aa  165  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  62.5 
 
 		 132 aa  164  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  60.94 
 
 		 130 aa  163  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  63.78 
 
 		 130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  59.38 
 
 		 130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  60.16 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1154  ribosomal protein S9  60.61 
 
 		 132 aa  153  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.252489  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0727  30S ribosomal protein S9  66.41 
 
 		 131 aa  153  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341683  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  60.66 
 
 		 158 aa  153  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  61.72 
 
 		 130 aa  153  9e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 133 aa  152  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  54.2 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  58.02 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0141  30S ribosomal protein S9  67.19 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  61.07 
 
 		 130 aa  150  4e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  61.07 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0746  ribosomal protein S9  60.32 
 
 		 134 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  59.38 
 
 		 131 aa  149  8.999999999999999e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0347  ribosomal protein S9  61.19 
 
 		 130 aa  149  8.999999999999999e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000129825  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  57.04 
 
 		 135 aa  149  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  60.66 
 
 		 180 aa  148  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0890  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2726  ribosomal protein S9  56.82 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000561308  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3995  ribosomal protein S9  58.33 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.850021  hitchhiker  0.000512267 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2613  30S ribosomal protein S9  60.48 
 
 		 169 aa  147  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1882  ribosomal protein S9  55.73 
 
 		 264 aa  145  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3105  ribosomal protein S9  61.48 
 
 		 162 aa  144  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  55.73 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  58.06 
 
 		 170 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  56.49 
 
 		 130 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 173 aa  143  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4594  30S ribosomal protein S9  59.84 
 
 		 188 aa  143  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1126  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 172 aa  142  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  55.73 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  58.2 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  58.2 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0618  ribosomal protein S9  60.48 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  54.96 
 
 		 130 aa  141  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20520  SSU ribosomal protein S9P  60 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.476775  normal  0.598664 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16860  30S ribosomal protein S9  58.02 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0244  30S ribosomal protein S9  59.84 
 
 		 165 aa  141  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  57.38 
 
 		 159 aa  141  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5159  ribosomal protein S9  59.2 
 
 		 169 aa  141  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623801  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  54.96 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  59.02 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2630  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 		 168 aa  141  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  57.38 
 
 		 160 aa  140  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2612  ribosomal protein S9  59.84 
 
 		 162 aa  140  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  55.56 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0923  30S ribosomal protein S9  57.85 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  57.38 
 
 		 159 aa  140  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4467  ribosomal protein S9  57.02 
 
 		 139 aa  140  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  55.73 
 
 		 130 aa  139  9e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6017  ribosomal protein S9  56.56 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0328969  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4345  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf385  30S ribosomal protein S9  55.3 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0579956  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  58.2 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  52.67 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0902  30S ribosomal protein S9  56.56 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.829966  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2205  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 135 aa  138  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1320  30S ribosomal protein S9  53.44 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.540344  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2993  ribosomal protein S9  58.73 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.113743  hitchhiker  0.00813341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  54.92 
 
 		 160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  51.18 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2424  SSU ribosomal protein S9P  63.28 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000332574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 		 162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  57.38 
 
 		 164 aa  137  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0972  ribosomal protein S9  56.45 
 
 		 173 aa  137  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0537605 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2970  30S ribosomal protein S9  58.2 
 
 		 159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0570988  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2249  30S ribosomal protein S9  57.38 
 
 		 163 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0257  30S ribosomal protein S9  63.28 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000068634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>