159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1447 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1447  xanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
191 aa  390  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0902677  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1302  xanthine phosphoribosyltransferase  64.21 
 
 
197 aa  249  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.550156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1475  xanthine phosphoribosyltransferase  63.16 
 
 
197 aa  246  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0761652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1447  xanthine phosphoribosyltransferase  63.16 
 
 
197 aa  246  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1591  xanthine phosphoribosyltransferase  63.16 
 
 
197 aa  246  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.556835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1737  xanthine phosphoribosyltransferase  63.16 
 
 
197 aa  246  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000180349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1661  xanthine phosphoribosyltransferase  63.16 
 
 
197 aa  246  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.855078 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1448  xanthine phosphoribosyltransferase  63.16 
 
 
197 aa  246  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000584742  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1697  xanthine phosphoribosyltransferase  62.11 
 
 
197 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3719  xanthine phosphoribosyltransferase  62.11 
 
 
197 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1626  xanthine phosphoribosyltransferase  61.58 
 
 
197 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1490  xanthine phosphoribosyltransferase  61.58 
 
 
197 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5265  xanthine phosphoribosyltransferase  60 
 
 
190 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5175  xanthine phosphoribosyltransferase  60 
 
 
190 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458979  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5317  xanthine phosphoribosyltransferase  60 
 
 
190 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0748508  normal  0.105571 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0205  xanthine phosphoribosyltransferase  58.95 
 
 
190 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605547 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0076  xanthine phosphoribosyltransferase  60.11 
 
 
189 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287774  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47930  xanthine phosphoribosyltransferase  57.89 
 
 
190 aa  235  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5520  xanthine phosphoribosyltransferase  58.95 
 
 
190 aa  234  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0112  xanthine phosphoribosyltransferase  59.04 
 
 
189 aa  232  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6072  xanthine phosphoribosyltransferase  57.67 
 
 
190 aa  229  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69940  xanthine phosphoribosyltransferase  57.67 
 
 
190 aa  228  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0251  xanthine phosphoribosyltransferase  57.14 
 
 
190 aa  223  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0537  adenine/guanine phosphoribosyltransferase-like protein  54.74 
 
 
206 aa  219  9.999999999999999e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0798782  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2059  adenine/guanine phosphoribosyltransferase-like protein  60.85 
 
 
189 aa  220  9.999999999999999e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2755  xanthine phosphoribosyltransferase  53.16 
 
 
190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0229  xanthine phosphoribosyltransferase  53.97 
 
 
192 aa  207  8e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115581  hitchhiker  6.642120000000001e-23 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1086  xanthine phosphoribosyltransferase  53.19 
 
 
193 aa  201  5e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.821507  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2387  xanthine phosphoribosyltransferase  52.13 
 
 
195 aa  201  7e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0720  xanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
196 aa  196  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000414905  normal  0.141539 
 
 
-
 
NC_002950  PG2147  xanthine phosphoribosyltransferase  49.21 
 
 
193 aa  196  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1265  xanthine phosphoribosyltransferase  49.47 
 
 
197 aa  194  9e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.165454  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0435  xanthine phosphoribosyltransferase  48.15 
 
 
192 aa  188  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.584524  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0446  xanthine phosphoribosyltransferase  48.15 
 
 
192 aa  188  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210484  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0067  xanthine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 
192 aa  186  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00414676  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0380  xanthine phosphoribosyltransferase  49.72 
 
 
192 aa  185  4e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000351735  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0364  xanthine phosphoribosyltransferase  46.11 
 
 
193 aa  179  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2968  xanthine phosphoribosyltransferase  47.51 
 
 
191 aa  178  4e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0628  xanthine phosphoribosyltransferase  48.09 
 
 
193 aa  177  9e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00387933  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0319  xanthine phosphoribosyltransferase  45.5 
 
 
190 aa  175  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0313  xanthine phosphoribosyltransferase  45.5 
 
 
190 aa  175  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1405  xanthine phosphoribosyltransferase  44.74 
 
 
190 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000101739  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2173  xanthine phosphoribosyltransferase  41.94 
 
 
188 aa  171  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0867075  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3381  xanthine phosphoribosyltransferase  44.56 
 
 
194 aa  169  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00123669  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1498  xanthine phosphoribosyltransferase  44.5 
 
 
192 aa  167  7e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00482653  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1287  xanthine phosphoribosyltransferase  44.5 
 
 
192 aa  167  7e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11335  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17850  xanthine phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 
192 aa  149  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0491  xanthine phosphoribosyltransferase  39.46 
 
 
202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2510  xanthine phosphoribosyltransferase  29.95 
 
 
200 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0705495  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46613  predicted protein  31.44 
 
 
798 aa  115  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2135  xanthine phosphoribosyltransferase  32.61 
 
 
204 aa  91.7  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0584  pur operon repressor  25.97 
 
 
274 aa  77.8  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0058  pur operon repressor  27.67 
 
 
280 aa  71.2  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0134  pur operon repressor  26.06 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000199065  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21340  pur operon repressor  27.03 
 
 
271 aa  67.8  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0041  pur operon repressor  25.69 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5265  pur operon repressor  25.69 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.549004  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0051  pur operon repressor  25.69 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0210  pur operon repressor  24.05 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000033257  normal  0.0176248 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0044  pur operon repressor  25.69 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0045  pur operon repressor  25.69 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0041  pur operon repressor  25.69 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0044  pur operon repressor  25.69 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0051  pur operon repressor  25.69 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000444912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0055  pur operon repressor  25.69 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.748352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0041  pur operon repressor  25.69 
 
 
282 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2627  pur operon repressor  28.17 
 
 
272 aa  65.1  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0041  pur operon repressor  25.69 
 
 
282 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0042  pur operon repressor  24.85 
 
 
274 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00214648  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3095  pur operon repressor  27.74 
 
 
270 aa  63.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.933063  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0040  pur operon repressor  24.85 
 
 
273 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1765  pur operon repressor  22.5 
 
 
274 aa  62  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.011589  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0517  pur operon repressor  25.67 
 
 
274 aa  61.6  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00109684  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0530  pur operon repressor  25.67 
 
 
274 aa  61.6  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000100819  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1772  pur operon repressor  21.99 
 
 
270 aa  57.8  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000200517  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0089  pur operon repressor  24.52 
 
 
278 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  27.56 
 
 
172 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1785  adenine phosphoribosyltransferase  27.42 
 
 
248 aa  52.4  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.232267  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0219  pur operon repressor  20.39 
 
 
281 aa  52.4  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000738086  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2815  pur operon repressor  25 
 
 
267 aa  51.6  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2501  pur operon repressor  23.23 
 
 
267 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0755  Adenine phosphoribosyltransferase  28.12 
 
 
177 aa  50.4  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2590  pur operon repressor  19.62 
 
 
271 aa  51.2  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2400  pur operon repressor  29.92 
 
 
272 aa  50.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1201  adenine phosphoribosyltransferase  27.61 
 
 
174 aa  50.4  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  29.77 
 
 
182 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0023  phosphoribosyltransferase  26.06 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00393898 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  25.44 
 
 
173 aa  50.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3653  adenine phosphoribosyltransferase  26.24 
 
 
174 aa  49.7  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0545  adenine phosphoribosyltransferase  28.78 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.342183  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  27.08 
 
 
171 aa  48.5  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  27.69 
 
 
183 aa  48.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0558  adenine phosphoribosyltransferase  26.62 
 
 
173 aa  48.1  0.00007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.176929  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1212  phosphoribosyltransferase  29.13 
 
 
246 aa  47.4  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.279163  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1608  pur operon repressor  19.01 
 
 
277 aa  47.4  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1531  adenine phosphoribosyltransferase  25.17 
 
 
173 aa  47.4  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  26.92 
 
 
183 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  26.92 
 
 
183 aa  46.6  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  26.92 
 
 
183 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  26.92 
 
 
183 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>