141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1371 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
472 aa  949    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  44.94 
 
 
475 aa  412  1e-113  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  45.03 
 
 
471 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  43.98 
 
 
481 aa  382  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  42.53 
 
 
472 aa  337  2.9999999999999997e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  40.52 
 
 
474 aa  337  3.9999999999999995e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  37.15 
 
 
484 aa  297  3e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  34.2 
 
 
486 aa  291  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  34.8 
 
 
485 aa  280  4e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  39.08 
 
 
478 aa  276  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  36.53 
 
 
471 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  32.76 
 
 
477 aa  244  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  30.32 
 
 
478 aa  219  1e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  29.01 
 
 
476 aa  205  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  29.01 
 
 
476 aa  205  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  24.36 
 
 
419 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  24.2 
 
 
483 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  23.95 
 
 
486 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 
417 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 
417 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 
417 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  23.6 
 
 
431 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  24.51 
 
 
424 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  25.42 
 
 
484 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.43 
 
 
484 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  23.13 
 
 
422 aa  91.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  23.13 
 
 
422 aa  91.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  23.13 
 
 
422 aa  91.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  23.13 
 
 
422 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  23.13 
 
 
422 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  23.13 
 
 
422 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  23.13 
 
 
422 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  21.09 
 
 
422 aa  89  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  23.29 
 
 
484 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 
417 aa  86.7  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 
484 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 
484 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  23.08 
 
 
484 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  26.64 
 
 
418 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  22.03 
 
 
433 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  22.43 
 
 
484 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  20.81 
 
 
419 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 
429 aa  83.2  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 
424 aa  82.4  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  20.81 
 
 
419 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  24.5 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  22.25 
 
 
483 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  22.45 
 
 
444 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  19.51 
 
 
418 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  22.78 
 
 
421 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  20.46 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  21.18 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2885  polysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 
404 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.285914  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  21.72 
 
 
443 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  22.31 
 
 
416 aa  65.1  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  23.53 
 
 
422 aa  63.5  0.000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  25.54 
 
 
476 aa  58.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  26.05 
 
 
504 aa  58.2  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  26.48 
 
 
490 aa  57.8  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  22.37 
 
 
461 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2760  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 
542 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.874111  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 
444 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  22.63 
 
 
424 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  26.73 
 
 
444 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  27.57 
 
 
489 aa  55.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  21.55 
 
 
405 aa  55.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 
511 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  28.24 
 
 
431 aa  53.9  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  27.31 
 
 
444 aa  53.5  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1922  polysaccharide biosynthesis family protein  23.75 
 
 
544 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1681  polysaccharide biosynthesis family protein  23.12 
 
 
544 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.960771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1700  polysaccharide biosynthesis family protein  23.12 
 
 
544 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.312469  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1656  polysaccharide biosynthesis protein; spore cortex protein  23.12 
 
 
544 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.177668  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  20.36 
 
 
429 aa  52  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1834  polysaccharide biosynthesis family protein  23.12 
 
 
544 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1878  polysaccharide synthase family protein  23.12 
 
 
544 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0013771 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1957  polysaccharide synthase family protein  24.89 
 
 
544 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.55468  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  25.62 
 
 
513 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4849  polysaccharide biosynthesis family protein  24.31 
 
 
550 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4603  polysaccharide biosynthesis family protein  24.49 
 
 
550 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0339143  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4439  polysaccharide biosynthesis family protein; export protein for polysaccharides and teichoic acids  24.49 
 
 
550 aa  50.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4457  polysaccharide biosynthesis family protein; export protein for polysaccharides and teichoic acids  24.49 
 
 
550 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0642469  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4824  polysaccharide synthase family protein  24.49 
 
 
550 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4959  polysaccharide biosynthesis family protein  24.49 
 
 
550 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4819  polysaccharide synthase family protein  24.49 
 
 
550 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0294842  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  25.85 
 
 
513 aa  50.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0417  polysaccharide synthase family protein  23.81 
 
 
550 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00377185  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1439  polysaccharide biosynthesis protein  23.75 
 
 
544 aa  50.1  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.30396  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  25.57 
 
 
513 aa  50.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4842  polysaccharide synthase family protein  23.81 
 
 
550 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00735996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2534  integral membrane protein MviN  21.83 
 
 
515 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0132262 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3370  polysaccharide biosynthesis protein  23.95 
 
 
550 aa  49.7  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0247135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1694  polysaccharide biosynthesis protein  24.38 
 
 
544 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196134  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3133  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 
507 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0165717  normal  0.444225 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 
427 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2118  polysaccharide biosynthesis family protein  24.4 
 
 
459 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1855  export protein for polysaccharides and teichoic acids  24.4 
 
 
459 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.383858  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  23.11 
 
 
512 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>