33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1368 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1368  acyltransferase 3  100 
 
 
355 aa  704    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.79899  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1412  polysaccharide biosynthesis protein (putative)  33.33 
 
 
343 aa  149  6e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.536858  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0873  acyltransferase 3  33.49 
 
 
376 aa  105  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.128696 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3292  hypothetical protein  23.17 
 
 
336 aa  87.8  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5308  hypothetical protein  27.45 
 
 
343 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5136  hypothetical protein  26.61 
 
 
343 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5704  hypothetical protein  27.45 
 
 
343 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5549  hypothetical protein  27.17 
 
 
343 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5150  hypothetical protein  26.9 
 
 
343 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591493  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0422  membrane protein  23.86 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0817  acyltransferase 3  25.07 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.923925  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1879  hypothetical protein  24.04 
 
 
373 aa  73.6  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2117  acyltransferase 3  24.18 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00661626  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002129  hypothetical protein  23.31 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00291  hypothetical protein  23.81 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2065  acyltransferase 3  22.98 
 
 
384 aa  66.2  0.0000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.393482  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0003  hypothetical protein  23.88 
 
 
339 aa  60.1  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165442 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20920  hypothetical protein  24.17 
 
 
357 aa  59.7  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2581  acyltransferase 3  25 
 
 
358 aa  59.3  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0275652 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3041  hypothetical protein  26.02 
 
 
374 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1429  hypothetical protein  31.4 
 
 
379 aa  53.5  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.715682  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1382  hypothetical protein  26.32 
 
 
375 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3764  acyltransferase family protein  23.4 
 
 
331 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.748321  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0153  acyltransferase 3  23.4 
 
 
331 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73773  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03364  hypothetical protein  23.4 
 
 
331 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03413  conserved inner membrane protein  23.4 
 
 
331 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0632  acyltransferase, putative  28.32 
 
 
208 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000552746  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0144  hypothetical protein  21.05 
 
 
359 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1450  acyltransferase 3  24.55 
 
 
392 aa  44.3  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.012691  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0160  acyltransferase 3  22.46 
 
 
331 aa  43.9  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4937  acyltransferase family protein  22.8 
 
 
331 aa  43.5  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3981  acyltransferase 3  21.39 
 
 
331 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3853  acyltransferase 3  20.83 
 
 
331 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>