34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1365 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1365  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  100 
 
 		 514 aa  1046    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0022042  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1367  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  51.49 
 
 		 474 aa  325  2e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000955772  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  55.31 
 
 		 420 aa  320  5e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  73.84 
 
 		 1363 aa  269  7e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1355  hypothetical protein  38.97 
 
 		 532 aa  239  9e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0180624  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1094  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.86 
 
 		 399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000219862  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0859  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.29 
 
 		 399 aa  170  5e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000303579  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1403  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.99 
 
 		 307 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1336  cell wall binding repeat-containing protein  45.31 
 
 		 184 aa  144  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0144  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.23 
 
 		 231 aa  139  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1112  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase., mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  43.15 
 
 		 1248 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00229916  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1135  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.15 
 
 		 1248 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00817868  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0636  bifunctional autolysin  41.45 
 
 		 1335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.0000166594  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  34.72 
 
 		 1025 aa  85.5  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  35.58 
 
 		 1002 aa  84  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  35.58 
 
 		 1009 aa  83.2  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2581  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.54 
 
 		 354 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000866464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3407  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.71 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000173531  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.15 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000414044  normal  0.0779521 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  28.27 
 
 		 330 aa  62.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  26.7 
 
 		 502 aa  54.7  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0822  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.01 
 
 		 253 aa  54.3  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  24.91 
 
 		 573 aa  53.9  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  29.47 
 
 		 651 aa  52.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  24.02 
 
 		 2821 aa  50.8  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  27.46 
 
 		 613 aa  51.2  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  22.43 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  25.59 
 
 		 550 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  24.62 
 
 		 552 aa  47.4  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  24.62 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  26.17 
 
 		 532 aa  44.3  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  25.48 
 
 		 750 aa  44.3  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  27.83 
 
 		 817 aa  43.5  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  23.9 
 
 		 430 aa  43.5  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>