More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1348 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  100 
 
 		 293 aa  596  1e-169  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  49.22 
 
 		 235 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  49.15 
 
 		 400 aa  116  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  48.39 
 
 		 1048 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  45.08 
 
 		 487 aa  109  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  50.43 
 
 		 162 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  48.51 
 
 		 176 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  51.61 
 
 		 452 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  56.18 
 
 		 392 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  52.69 
 
 		 438 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  43.7 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  47.12 
 
 		 395 aa  103  5e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  40.44 
 
 		 347 aa  102  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  51.72 
 
 		 432 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  50.86 
 
 		 432 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  43.62 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  47.71 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  47.52 
 
 		 335 aa  99.8  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  48.31 
 
 		 337 aa  99.4  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  44.12 
 
 		 331 aa  99.4  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  52.81 
 
 		 340 aa  99.4  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  53.93 
 
 		 367 aa  99.4  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  50 
 
 		 453 aa  99.4  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1816  NLP/P60 protein  53.54 
 
 		 330 aa  99.4  7e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00581974  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  49.57 
 
 		 327 aa  99  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  50.5 
 
 		 368 aa  99  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  42.5 
 
 		 368 aa  98.6  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  47 
 
 		 332 aa  98.2  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  46.23 
 
 		 417 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  41.45 
 
 		 420 aa  98.2  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  45.88 
 
 		 366 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  46.81 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  46.24 
 
 		 204 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  48.39 
 
 		 345 aa  96.7  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  39.53 
 
 		 388 aa  96.3  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  37.5 
 
 		 388 aa  96.3  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  47.37 
 
 		 348 aa  95.9  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  44.21 
 
 		 491 aa  95.9  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  52.81 
 
 		 366 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  42.4 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  39.47 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  50.55 
 
 		 553 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000246871  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  38.41 
 
 		 265 aa  94  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  39.72 
 
 		 197 aa  93.6  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  52.81 
 
 		 347 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 375 aa  93.2  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  43 
 
 		 180 aa  93.2  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  38.35 
 
 		 317 aa  92.8  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  46.07 
 
 		 350 aa  92.8  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  47.19 
 
 		 306 aa  92.8  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  46.81 
 
 		 374 aa  92.4  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  47.19 
 
 		 281 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  49.44 
 
 		 459 aa  92  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  46.6 
 
 		 524 aa  91.3  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  44.94 
 
 		 363 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  41.82 
 
 		 348 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  45.16 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  46.07 
 
 		 372 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  46.07 
 
 		 372 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  44.94 
 
 		 378 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  41.82 
 
 		 348 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  44.94 
 
 		 348 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  49.51 
 
 		 232 aa  90.1  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  48.11 
 
 		 274 aa  90.1  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 447 aa  89.7  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  46.24 
 
 		 342 aa  89.7  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  45.19 
 
 		 391 aa  89.7  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  45.95 
 
 		 259 aa  89.7  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 236 aa  89.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1353  NLP/P60 family protein, enterotoxin  48.35 
 
 		 549 aa  89.4  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.185421  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 348 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  43.69 
 
 		 476 aa  89  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.5 
 
 		 475 aa  89  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  41 
 
 		 393 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.07 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  37.88 
 
 		 432 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  49.44 
 
 		 326 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  44.94 
 
 		 372 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1216  NLP/P60 protein  50 
 
 		 212 aa  87.8  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000177513  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  42.2 
 
 		 234 aa  87.8  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  43.56 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  44.23 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  43.82 
 
 		 315 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  43.82 
 
 		 378 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  40.8 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  38.95 
 
 		 446 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  42.42 
 
 		 370 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  42.7 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 374 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  42.7 
 
 		 361 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  42.7 
 
 		 361 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  35.9 
 
 		 325 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  38.71 
 
 		 466 aa  86.7  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  43.82 
 
 		 363 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  40.59 
 
 		 330 aa  85.9  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  44.94 
 
 		 323 aa  85.9  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  38.71 
 
 		 217 aa  85.9  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 394 aa  85.5  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>