48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1336 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1336  cell wall binding repeat-containing protein  100 
 
 		 184 aa  379  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  67.07 
 
 		 1363 aa  226  2e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1367  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  84.21 
 
 		 474 aa  145  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000955772  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  51.68 
 
 		 420 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1365  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  62.96 
 
 		 514 aa  139  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0022042  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1355  hypothetical protein  41.18 
 
 		 532 aa  134  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0180624  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0859  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  59.21 
 
 		 399 aa  102  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000303579  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1094  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  56.58 
 
 		 399 aa  97.4  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000219862  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  32.56 
 
 		 2495 aa  81.3  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  30.67 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  34.5 
 
 		 1009 aa  62.8  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  34.71 
 
 		 1002 aa  62.8  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  30.68 
 
 		 1514 aa  60.8  0.000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  25 
 
 		 613 aa  59.7  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  29.11 
 
 		 592 aa  57.8  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  26.86 
 
 		 502 aa  56.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  24.75 
 
 		 434 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  27.89 
 
 		 342 aa  55.5  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  29.14 
 
 		 478 aa  53.9  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  31.4 
 
 		 1025 aa  53.5  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  43.21 
 
 		 737 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  28.39 
 
 		 811 aa  52.4  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  31.39 
 
 		 651 aa  51.6  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  29.44 
 
 		 757 aa  51.2  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  26.97 
 
 		 324 aa  51.2  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  27.23 
 
 		 2821 aa  49.7  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  31.71 
 
 		 1475 aa  49.7  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  26.15 
 
 		 753 aa  48.9  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  23.7 
 
 		 512 aa  48.9  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  30.25 
 
 		 552 aa  48.9  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  24.37 
 
 		 602 aa  48.5  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  31.36 
 
 		 1527 aa  47  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  29.75 
 
 		 573 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  31.36 
 
 		 817 aa  46.2  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  29.27 
 
 		 1557 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  28.35 
 
 		 550 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  27.88 
 
 		 532 aa  45.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  28.98 
 
 		 807 aa  44.7  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  30 
 
 		 316 aa  44.7  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  25.47 
 
 		 454 aa  45.1  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  38.16 
 
 		 293 aa  43.9  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  27.54 
 
 		 440 aa  42.4  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  26.54 
 
 		 330 aa  42  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  26.43 
 
 		 750 aa  42  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02470  putative cell wall binding protein  31.51 
 
 		 271 aa  41.6  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  27.17 
 
 		 891 aa  41.6  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  29.38 
 
 		 1131 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  29.38 
 
 		 1131 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>