More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1332 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1332  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 127 aa  259  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  55.46 
 
 		 122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2609  transcriptional regulator, GntR family  52.94 
 
 		 122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1359  transcriptional regulator, GntR family  51.26 
 
 		 123 aa  133  8e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.428483 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04510  regulatory protein GntR HTH  49.58 
 
 		 127 aa  117  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4757  transcriptional regulator, GntR family  46.43 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4731  transcriptional regulator, GntR family  44.26 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2889  transcriptional regulator, GntR family  42.28 
 
 		 123 aa  110  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1337  transcriptional regulator, GntR family  43.22 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39240  transcriptional regulator, GntR family  43.59 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2657  GntR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000366094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2908  putative transcriptional regulator  43.36 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000437446 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02920  predicted transcriptional regulator  38.26 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0676  transcriptional regulator, GntR family  45.61 
 
 		 119 aa  104  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0188  transcriptional regulator, GntR family  43.64 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2945  GntR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315023  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2634  GntR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00782758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2324  putative transcriptional regulator  42.48 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.665788  hitchhiker  0.000002965 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06980  transcriptional regulator, GntR family  42.48 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2712  GntR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 126 aa  100  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.902974  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2569  transcriptional regulator, GntR family  40.83 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0413  transcriptional regulator, GntR family  41.59 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126119  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0486  transcriptional regulator, GntR family  41.96 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.78271 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1559  transcriptional regulator, GntR family  39.29 
 
 		 122 aa  94.4  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1206  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0894307 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3111  transcriptional regulator, GntR family  41.28 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04760  predicted transcriptional regulator  39.81 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0506039  normal  0.467802 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0274  transcriptional regulator, GntR family  40.74 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0823  transcriptional regulator, GntR family  38.53 
 
 		 113 aa  87.4  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.609388  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1173  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 113 aa  87.4  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.497772  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3323  transcriptional regulator, GntR family  36.61 
 
 		 122 aa  86.7  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  36.75 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000965  transcriptional regulator GntR family  37.89 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2708  transcriptional regulator  48.05 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.159908  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07005  hypothetical protein  37.23 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3525  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_002950  PG1007  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 115 aa  72  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0952  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.091739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2982  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.583811  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0449  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5187  transcriptional regulator, GntR family  35.63 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1122  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379756 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0075  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0073  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  34.19 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0077  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256514 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  31.15 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7289  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  33.64 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  28.69 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  29.31 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  29.31 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0072  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0164  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1272  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3352  regulatory protein GntR HTH  31.11 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  27.87 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  26.72 
 
 		 121 aa  62  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3779  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 252 aa  60.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  32.95 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  30.58 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0076  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 115 aa  60.1  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  28.57 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  31.53 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 554 aa  59.3  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01221  transcriptional regulator GntR family  32.97 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189033  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3976  transcriptional regulator, GntR family protein  29.75 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1279  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00230471  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0077  GntR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>