More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1322 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1322  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
342 aa  712    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580469  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1588  glycosyltransferase  57.35 
 
 
347 aa  430  1e-119  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1727  glycosyl transferase group 1  35.93 
 
 
389 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00570551  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0738  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 
358 aa  168  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0960  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
345 aa  159  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0120  glycosyl transferase, group 1  33.81 
 
 
325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1077  glycosyl transferase, group 1  36.02 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.508973  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0941  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 
325 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.018842  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0967  hypothetical protein  28.57 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3633  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
339 aa  102  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0388  glycosyltransferase  27.72 
 
 
335 aa  99  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0709  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.18 
 
 
332 aa  97.4  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0160  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 
337 aa  94.4  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12200  glycosyltransferase  31.75 
 
 
376 aa  87  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0610  glycosyl transferase, family 1  28.86 
 
 
334 aa  85.9  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2810  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
356 aa  84  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2440  glycosyltransferase  29.59 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0778  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0355299  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
820 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  29.54 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
816 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1228  glycosyl transferase group 1  23.33 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000548043 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7580  WbdA; mannosyl transferase A  31.72 
 
 
377 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207702  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  29.58 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
403 aa  73.6  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  30.53 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  28.62 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
819 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  28.35 
 
 
413 aa  73.2  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
461 aa  73.2  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3517  glycosyl transferase group 1  22.18 
 
 
329 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1635  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 
623 aa  72  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030735  normal  0.881168 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0986  glycosyltransferase  26.69 
 
 
383 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.075214 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0649  glycosyltransferase  23.99 
 
 
343 aa  72  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.109124  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 
436 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 
743 aa  70.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
402 aa  70.5  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
414 aa  70.1  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
371 aa  70.1  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.19 
 
 
495 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.19 
 
 
499 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0659  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100835  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.19 
 
 
443 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.19 
 
 
443 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.64 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.19 
 
 
443 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2705  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
803 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.19 
 
 
443 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1997  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.723795  normal  0.0390531 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  25.79 
 
 
383 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3289  putative LPS biosynthesis-related protein  34.23 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502045  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.19 
 
 
498 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  27.78 
 
 
816 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
384 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
426 aa  67  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  25.12 
 
 
406 aa  67  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  34.38 
 
 
417 aa  67  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0016  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
380 aa  67  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0290375  normal  0.0192422 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  28.98 
 
 
351 aa  66.6  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
438 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  28.05 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  29.02 
 
 
393 aa  66.2  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1997  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
383 aa  66.2  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.336344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
422 aa  66.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
517 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 
385 aa  66.2  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3923  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 
356 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
899 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 
381 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  25.2 
 
 
803 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 
391 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 
398 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
378 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
380 aa  65.1  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
407 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
423 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  25.42 
 
 
361 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1256  glycosyl transferase group 1  33.56 
 
 
358 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121425  normal  0.610922 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1996  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 
381 aa  64.7  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3905  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 
366 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.840872  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3356  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
430 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.25857  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4786  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
414 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0735512 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  29.84 
 
 
443 aa  64.3  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  28.86 
 
 
401 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
386 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  31.58 
 
 
466 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  23.93 
 
 
385 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  24.37 
 
 
427 aa  63.9  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  28.33 
 
 
450 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  22.7 
 
 
387 aa  63.9  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 
348 aa  63.9  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.09 
 
 
380 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
398 aa  63.5  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 
381 aa  63.5  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>