37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1321 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  676    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  40.77 
 
 		 342 aa  257  2e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  38.76 
 
 		 338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  38.46 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  22.03 
 
 		 354 aa  98.6  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0911  hypothetical protein  23.84 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00529353  normal  0.444552 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0465  hypothetical protein  23.05 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0450  integral membrane protein-like protein  22.49 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00950527  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  25.48 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1439  hypothetical protein  21.03 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0220  hypothetical protein  27.73 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1853  hypothetical protein  25.48 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126154  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  26.39 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  23.95 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  26.12 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  24.6 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  20.14 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  20.93 
 
 		 332 aa  57  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  26.42 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  23.16 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  22.3 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  24.48 
 
 		 342 aa  53.9  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1924  hypothetical protein  25.1 
 
 		 323 aa  53.9  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00284727  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  22.61 
 
 		 347 aa  53.5  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  23.26 
 
 		 342 aa  53.5  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  24.4 
 
 		 347 aa  50.1  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  24.9 
 
 		 321 aa  49.7  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  24.93 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  24.07 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  25.1 
 
 		 333 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1222  hypothetical protein  34.57 
 
 		 330 aa  47  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.997837  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  30.09 
 
 		 330 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56050  hypothetical protein  27.78 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  24.91 
 
 		 366 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  23.66 
 
 		 344 aa  43.9  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1651  hypothetical protein  44.44 
 
 		 334 aa  43.5  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0104013  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  31.25 
 
 		 330 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>