More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1309 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  100 
 
 
432 aa  900    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0824  dihydropyrimidine dehydrogenase  64.89 
 
 
411 aa  578  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1501  dihydropyrimidine dehydrogenase  64.89 
 
 
411 aa  578  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02076  dihydropyrimidine dehydrogenase  64.89 
 
 
411 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1511  dihydroorotate dehydrogenase family protein  64.89 
 
 
411 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.823928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2281  dihydropyrimidine dehydrogenase  64.89 
 
 
411 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2294  dihydropyrimidine dehydrogenase  64.89 
 
 
411 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484206 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02035  hypothetical protein  64.89 
 
 
411 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2442  dihydropyrimidine dehydrogenase  64.65 
 
 
411 aa  574  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3279  dihydropyrimidine dehydrogenase  64.89 
 
 
411 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2422  dihydropyrimidine dehydrogenase  65.6 
 
 
411 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2333  dihydropyrimidine dehydrogenase  65.6 
 
 
411 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.757399  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2377  dihydropyrimidine dehydrogenase  65.36 
 
 
411 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2534  dihydropyrimidine dehydrogenase  65.6 
 
 
411 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.666903  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2426  dihydropyrimidine dehydrogenase  65.6 
 
 
411 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1363  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.49 
 
 
432 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.709069 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2199  dihydropyrimidine dehydrogenase  41.07 
 
 
426 aa  319  7e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2689  dihydropyrimidine dehydrogenase  41.23 
 
 
444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3448  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.82 
 
 
422 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117206  normal  0.0570725 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6712  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.33 
 
 
437 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.302469 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1534  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.86 
 
 
436 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.553983  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5721  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.28 
 
 
435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85505  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5965  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.28 
 
 
435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.663226  normal  0.568701 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5351  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.28 
 
 
435 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.162671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6035  dihydropyrimidine dehydrogenase  37.74 
 
 
441 aa  309  6.999999999999999e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181923  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1595  dihydropyrimidine dehydrogenase  41.94 
 
 
437 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6236  dihydropyrimidine dehydrogenase  41.94 
 
 
437 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.182337  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1429  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.86 
 
 
444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2213  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.2 
 
 
429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0365  dihydropyrimidine dehydrogenase  41.98 
 
 
436 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0296  dihydropyrimidine dehydrogenase  41.98 
 
 
436 aa  306  5.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0282  dihydropyrimidine dehydrogenase  41.98 
 
 
436 aa  306  6e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384818  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6656  dihydropyrimidine dehydrogenase  41.94 
 
 
438 aa  306  6e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.569417  normal  0.0129308 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0540  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.78 
 
 
424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1458  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.15 
 
 
434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.850585  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2712  dihydropyrimidine dehydrogenase  38.79 
 
 
434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462922  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3449  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.3 
 
 
437 aa  302  8.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591903  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1820  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.9 
 
 
434 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3281  dihydropyrimidine dehydrogenase  41.84 
 
 
437 aa  302  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.919759  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0187  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.9 
 
 
434 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799767  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05740  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.53 
 
 
425 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.744293  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2862  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.05 
 
 
439 aa  302  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2108  dihydroorotate dehydrogenase family protein  40.23 
 
 
461 aa  300  4e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.110161  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1500  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.66 
 
 
434 aa  298  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4020  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.85 
 
 
435 aa  298  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3029  dihydropyrimidine dehydrogenase  41.58 
 
 
437 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00152592  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0967  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.74 
 
 
442 aa  297  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.584052  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2055  dihydropyrimidine dehydrogenase  41.07 
 
 
437 aa  296  4e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0045  dihydropyrimidine dehydrogenase  38.23 
 
 
437 aa  295  9e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2361  dihydropyrimidine dehydrogenase  41.33 
 
 
437 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3443  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.29 
 
 
424 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4151  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.24 
 
 
436 aa  285  8e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1834  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.69 
 
 
424 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.184272 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4038  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.34 
 
 
424 aa  279  8e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3640  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.09 
 
 
424 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0957824  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1889  dihydroorotate dehydrogenase family protein  39.77 
 
 
461 aa  278  2e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0110983  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1800  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.09 
 
 
424 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.287074  normal  0.942647 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2025  dihydroorotate dehydrogenase family protein  35.09 
 
 
398 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1743  dihydroorotate dehydrogenase family protein  31.27 
 
 
363 aa  153  7e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1390  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.86 
 
 
303 aa  151  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0832  dihydroorotate dehydrogenase family protein  33.12 
 
 
299 aa  150  4e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0472  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.23 
 
 
304 aa  149  8e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.730654  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2085  dihydroorotate dehydrogenase family protein  29.34 
 
 
381 aa  146  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00414883  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0121  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.96 
 
 
360 aa  146  9e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0618  dihydroorotate dehydrogenase family protein  32.49 
 
 
307 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.056994  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1436  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.91 
 
 
304 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.405217  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1198  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.6 
 
 
304 aa  143  5e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.770719  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0785  dihydroorotate dehydrogenase family protein  31.33 
 
 
299 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1466  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.52 
 
 
301 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831826  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1820  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.48 
 
 
305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0131374 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0912  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.34 
 
 
305 aa  137  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53908  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0450  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.25 
 
 
304 aa  137  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.187702  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2286  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.11 
 
 
300 aa  136  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000160117  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1225  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.25 
 
 
300 aa  136  8e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0613844  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1296  putative oxidoreductase  30.72 
 
 
314 aa  136  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000054569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2399  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.17 
 
 
305 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2629  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.87 
 
 
304 aa  134  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.372998  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2150  dihydroorotate dehydrogenase 1B  32.09 
 
 
305 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000128716  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2762  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  32.2 
 
 
303 aa  133  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0125  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.94 
 
 
308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000118304  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4014  dihydroorotate dehydrogenase family protein  31.37 
 
 
314 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1424  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.5 
 
 
304 aa  131  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.601121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1279  hypothetical protein  32.82 
 
 
302 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2350  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.48 
 
 
305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.893945 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1092  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.19 
 
 
311 aa  129  9.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.149271  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0051  dihydroorotate dehydrogenase family protein  29.02 
 
 
330 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2665  dihydroorotate dehydrogenase family protein  31.03 
 
 
322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2127  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  32.29 
 
 
352 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.95796 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1380  dihydroorotate dehydrogenase family protein  29.78 
 
 
300 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1382  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.41 
 
 
299 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0126255  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1197  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.39 
 
 
299 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2822  dihydroorotate dehydrogenase 1  28.21 
 
 
331 aa  124  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0209539  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1841  dihydroorotate dehydrogenase 1B  32.64 
 
 
305 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000167258  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0389  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  31.56 
 
 
321 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.42122  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1183  dihydroorotate dehydrogenase 1B  34.1 
 
 
324 aa  122  9e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0657  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.39 
 
 
300 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.345915  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1686  dihydroorotate dehydrogenase 1B  32.21 
 
 
304 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00226183  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0444  dihydroorotate dehydrogenase  27.25 
 
 
390 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1300  dihydroorotate dehydrogenase family protein  32.01 
 
 
307 aa  121  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1372  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.18 
 
 
310 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000766739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>